Nicholas (Nick) Tinker, Ph. D.

Image Nicholas Tinker
Chercheur

Recherche en bioinformatique et en génomique pour l'amélioration de l'avoine et d'autres cultures céréalières.

Agriculture et Agroalimentaire Canada
Centre de recherche et de développement d’Ottawa

Recherche et / ou projets en cours

  • Génomique à haut débit pour l'avoine et l'orge
  • Pangénomique et évolution du génome de l'avoine
  • Sélection génomique dans l'avoine et l'orge

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Principales publications

  1. Luo, X., Tinker, N.A., Zhou, Y., Liu, J., Wan, W., Chen, L. (2018). A comparative cytogenetic study of 17 Avena species using Am1 and (GAA)6 oligonucleotide FISH probes. Acta Physiologiae Plantarum, [online] 40(8), http://dx.doi.org/10.1007/s11738-018-2721-9

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  2. Bekele WA, Wight CP, Chao S, Howarth CJ, Tinker NA (2018) Haplotype based genotyping-by-sequencing in oat genome research. Plant Biotechnology Journal (accepted with minor revisions)

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  3. Luo X, Tinker NA, Zhou Y-H, Wight CP, Liu J, Wan W, Chen L, Peng Y (2017) Genomic relationships among sixteen Avena species based on (ACT) 6 trinucleotide repeat FISH. Genome:Online-first

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  4. Zhao J, Tang X, Wight CP, Tinker NA, Jiang Y, Yan H, Ma J, Lan X-J, Wei Y-M, Ren C, Chen G, Peng Y (2018) Genetic Mapping and a New PCR-based Marker Linked to a Dwarfing Gene in Oat (Avena sativa L.). Genome 61:497-503

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  5. Fu YB and Tinker NA (2017) An update on PGRC oat germplasm research. Oral presentation by Nick Tinker at AAFC / USDA Oat Forum, Cornell, Ithaca, New York, November 13-14, 2017

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  6. Bjørnstad Å, He X, Tekle S, Klos K, Huang YF, Tinker NA, Dong Y, Skinnes H (2017) Genetic variation and associations involving Fusarium head blight and deoxynivalenol accumulation in cultivated oat (Avena sativa L.). Plant Breeding 136 (5):620-636. doi:10.1111/pbr.12502

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  7. Esvelt Klos K, Yimer BA, Babiker EM, Beattie AD, Bonman JM, Carson ML, Chong J, Harrison SA, Ibrahim A, Kolb FL, McCartney CA, McMullen M, Mitchell Fetch J, Mohammadi M, Murphy JP, Tinker NA (2017) Genome-wide association mapping of crown rust resistance in oat elite germplasm. The Plant Genome 10(12). doi:10.3835/plantgenome2016.10.0107

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  8. Ouellet, T., Gou, L., Konkin, D., Hattori, J., Tekieh, F., Wolfe, D.F., Balcerzak, M., Chalabian, F., Vrana, J., Kubaláková, M., Doležel, J., Tinker, N.A., Sharpe, A.G., et Fedak, G. (2016). « Towards cloning of the FHB-resistance locus from Thinopyrum elongatum chromosome 7EL. », XIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, USA, January 2016. (Affiche)

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  9. Jannink, J.-L., Tinker, N.A., Chao, S., Saied, C., et Matthews, D.E. (2016). « Genotyping to integrate historical research efforts in oat. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016.

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  10. Tinker, N.A. et Cober, E.R. (2016). « Plant Breeding. », dans Stewart, J.C.N. (dir.) - Plant Biotechnology and Genetics: Principles, Techniques and Applications, 2nd edition, Wiley - Blackwell.

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  11. Haiyan, J., Tinker, N.A., Jannink, J.-L., Wight, C.P., Saied, C., Lazo, G.R., et Gusmini, G. (2016). « International engagement through Oat Global, T3/Oat, and the Oat Newsletter. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016.

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  12. Bekele, W.A. et Tinker, N.A. (2016). « Haplotag: new GBS software facilitates haplotype-based GWAS in hexaploid oat. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016.

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  13. Ouellet, T., Gou, L., Konkin, D., Hattori, J., Tekieh, F., Wolfe, D., Balcerzak, M., Chalabian, F., Haldar, A., Vrana, J., Kubalakova, M., Dolezel, J., Tinker, N.A., Sharpe, A., Fedak, G. 2016. Collective effort to develop genomics and genetics tools for the cloning of the FHB-resistance locus from Thinopyrum elongatum chromosome 7EL. Proceedings of the 8th Canadian Workshop on Fusarium Head Blight, Ottawa, ON, November 20-22 2016. P. 14.

    2016 - Consulter les détails de la publication

  14. Yan, H., Bekele, W. A., Wight, C. P., Peng, Y., Langdon, T., Latta, R. G., Fu, Y.-B., Diederichsen, A., Howarth, C. J., Jellen, E. N., Boyle, B., Wei, Y., and Tinker, N. A., 2016: High-density marker profiling confirms ancestral genomes of Avena species and identifies D-genome chromosomes of hexaploid oat. Theoretical and Applied Genetics 129, 2133–2149.

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  15. Fu YB, Cloutier S, Tinker N (2016) Molecular characterization of plant germplasm in Plant Gene Resources of Canada: some lessons learnt for DivSeek. DivSeek Workshop. Saskatoon, Sk, 18 June 2016

    2016 - Consulter les détails de la publication

  16. Yan, H., Martin, S.L., Bekele, W.A., Latta, R.G., Diederichsen, A., Peng, Y.-Y., et Tinker, N.A. (2016). « Genome size variation in the genus Avena. », Genome, 59(3), p. 209-220. doi : 10.1139/gen-2015-0132

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  17. Tinker, N.A., Bekele, W.A., et Hattori, J. (2016). « Haplotag: software for haplotype-based genotyping-by-sequencing analysis. », G3: Genes, Genomes, Genetics, 6(4), p. 857-863. doi : 10.1534/g3.115.024596

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  18. Gou, L., Hattori, J., Fedak, G., Balcerzak, M., Sharpe, A.G., Visendi, P., Edwards, D.J., Tinker, N.A., Wei, Y.-M., Chen, G-Y., et Ouellet, T. (2016). « Development and validation of Thinopyrum elongatum expressed molecular markers specific for the long arm of chromosome 7E. », Crop Science, 56(1), p. 354-363. doi : 10.2135/cropsci2015.03.0184

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  19. Gusmini, G., Howarth, C.J., Tinker, N.A., Okamuro, J.K., Boroughs, B., Federizzi, L.C., Roskens, A.B., Zwer, P., et Dyck, J. (2015). « Oat Global: Uniting the Oat World at OatGlobal.org. », XXIII Plant and Animal Genome Conference, San Diego, CA, USA, January 10-14, 2015, https://pag.confex.com/pag/xxiii/webprogram/Session2675.html. (Résumé)

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  20. Saied, C., Matthews, D.E., Birkett, C., Clohessy, J., Huang, Y.-F., Tinker, N.A., et Jannink, J.-L. (2015). « T3/Oat: Relational data for oat genotypes and phenotypes. », Oats 2020, (http://www.oats2020.org/presentations.html).

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