Nathalie Bissonnette, PhD.

Chercheur Scientifique, génomique animale

Contribuer à l'avancement de la recherche en santé animale et favoriser la résistance naturelle aux maladies à l’aide d’une approche intégrée en génomique animale.

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Sherbrooke, Québec, Canada.

Recherche et / ou projets en cours

Le Dr Nathalie Bissonnette oriente principalement ses activités de recherche sur l'immunogénétique de l’animal, l'immunotolérance et l'immunorégulation en réponse aux nutriments, à l’environnement, et aux contacts de pathogènes. Cela comprend l'identification de marqueurs génétiques et épigénétiques et des facteurs environnementaux qui mettent à profit le système immunitaire. Ses recherches contribuent à formuler des interventions nutritionnelles qui supportent la résistance naturelle aux maladies. Elle utilise des technologies avancées de séquençage et de génotypage de nouvelle génération afin d’identifier les marqueurs génétiques et épigénétiques, les profils d’expression génétique (transcriptome) et les régulateurs (ARNlnc, microARN) des réseaux qui gouvernent la résistance ou la susceptibilité aux maladies, notamment à la paratuberculose bovine.

Le Dr Nathalie Bissonnette s’est jointe à Agriculture et Agroalimentaire Canada au Centre de recherche et développement de Sherbrooke, Québec, en 2001. L’expertise de Dr. Bissonnette en biologie moléculaire et génomique animale a été mise à profit dans le cadre de nombreux projets, tant au niveau du porc qu’au niveau de la vache laitière. Les objectifs sectoriels ciblés par ses travaux visent à : (1) Éliminer les menaces dans la chaîne de valeur agricole et agroalimentaire et (2) Soutenir un secteur agricole en santé.

Énoncés de recherches/projets

Démasquer la susceptibilité à la paratuberculose en étudiant la génétique de l'hôte et le dynamisme d'infection de souches présentant des génétique variées (infection à génotype mixte) pour comprendre la susceptibilité et la progression de la maladie – Cultivons l’avenir III (AAC) : Grappe Laitière

Génomique animale pour la résistance à la paratuberculose – Projet ciblé par AAC

Développement de stratégies innovantes et d'outils analytiques pour identifier les vaches atteintes de paratuberculose, soit infectées par la Mycobacterium avium ssp paratuberculosis – AAC A-base

Interventions nutritionnelles néonatales avec du colostrum bovin et / ou de la vitamine D et du cuivre (Cu) et leurs effets de programmation sur l'état oxydatif, la maturation du système immunitaire et l'établissement de populations microbiennes intestinales chez les porcelets – Cultivons l’avenir II (AAC) : Grappe Porc II

Comprendre le microbiote intestinal et les réponses immunitaires de l'hôte aux probiotiques et au colostrum pour améliorer la santé intestinale du porc – AAC A-Base

Activités professionnelles / intérêts

• Membre : GRESABO (Groupe de recherche en santé bovine)

• Membre : Association internationale pour la paratuberculose

• Membre : groupe de recherche Op+lait sur la qualité du lait, programme de regroupement stratégique FQRNT

• Membre : Dairy Cattle Breeding and Genetics Committee, Canada

• Membre : Comité Institutionnel de Protection des Animaux

• Membre: Comité de rédaction de la revue scientifique Gene

• Membre : Société canadienne de science animale

• Membre : American Dairy Science Association

Intérêts : nutritional intervention, épigénétique, immuno-tolérance, vaccination

Prix et études

Études:

Post-doc Agriculture et Agriculture Canada (1999-2000)

PhD/MSc. Radiobiologie/Oncologie (Université de Sherbrooke) 1998

Bacc Biotechnologie (Université de Sherbrooke) 1994

Prix de reconnaissance :

(1) Distinction : Mention d’honneur du Doyen de la faculté de médecine de l’Université de Sherbrooke, 1997-1998. (2) Prix Gordon Fisher (1997) de la faculté de médecine de l’Université de Sherbrooke pour l’excellence en recherche. (3) Prix Jean-Pierre Caillé (1997) remis par le Conseil de recherches médicales de l’Université de Sherbrooke. Récipiendaire à la Journée Scientifique (4) Distinction : Mention d’honneur du Doyen de la faculté de médecine de l’Université de Sherbrooke, 1991-1992. Bourse d’études, (5) F.C.A.R. (Fonds pour la formation de chercheurs et l’aide à la recherche) 1991-1992. (6) Bourse d’études pour la maîtrise ès sciences de l’Université de Sherbrooke 1990-1991. (7) Bourse d’étude pour le programme de recherche en sciences de la santé pour 1989-1990, accordée par la faculté de médecine de l’Université de Sherbrooke. (8) Bourse pour cours de formation remise par le Centre de recherche médicale de l’Université de Sherbrooke (CRMUS), été 1989. (9) Distinction remise à l’occasion d’un symposium à Ottawa (Canada) organisé par l’Association canadienne de l’industrie des médicaments (ACIM), novembre 1989. (10) Bourse de la fondation de l’ACIM, bourse pour le baccalauréat ès sciences 1989.

Expérience et / ou de travail international

Épidémiotypage des souches de Mycobacterium avium ssp paratuberculosis (MAP) en collaboration avec le regroupement des Infections Mycobactériennes Animales de l’INRA, France (http://mac-inmv.tours.inra.fr) pour documenter la diversité génétique des infections à MAP en Amérique du Nord.

Chercheur invité (1994-1995), Université Pasteur (France), à l'Institut de Génétique et de Biologie moléculaire et cellulaire

Principales publications

Byrne, A., Ollier, S., Tahlan, K., Biet, F., Bissonnette, N. (2023). Genomic epidemiology of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis isolates from Canadian dairy herds provides evidence for multiple infection events. Frontiers in Genetics, [online] 14 http://dx.doi.org/10.3389/fgene.2023.1043598
2023 - Consulter les détails de la publication
Wang, M., M. Laterrière, P.-L. Dudemaine, N. Bissonnette, D. Gagné, and E. M. Ibeagha-Awemu. 2022. PSVIII-B-15 Potential Involvement of DNA Methylation of First Intron in Transcriptional Regulation During Bovine Subclinical Mastitis Caused by Staphylococcus Aureus. Journal of Animal Science 100(Supplement_3):310-311. doi: 10.1093/jas/skac247.565 %J Journal of Animal Science
2022 - Consulter les détails de la publication
Byrne, A., O. Severine, T. Cochard, K. Tahlan, F. Biet, and N Bissonnette. 2022. Genetic typing of Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis strains isolated from 14 cows shedding high levels of MAP in the Provinces of Quebec and Ontario Herds. 15th International Colloquium on Paratuberculosis, Dublin, Irland, June 12-16th 2022.
2022 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., D. Kelton, G. Fecteau, K. Tahlan, E. Ibeagha-Awemu, and P. Griebel. 2022. Identification of disease tolerant and susceptible cows to Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis infection for genetic analyses of disease resistance. 15th International Colloquium on Paratuberculosis. Dublin, Irland, June 12-16 2022.
2022 - Consulter les détails de la publication
Ariel O. Brouard J.-S., Marete A., Miglior F. Ibeagha-Awemu E., and Bissonnette N. 2021. L’analyse d’association à l’échelle du génome a permis d'identifier des variations génétiques issues d’ARN-seq et biopuce à ADN associées à la paratuberculose chez des bovins Holstein canadiens à l'aide de macrophages infectés expérimentalement «in vitro»
2021 - Consulter les détails de la publication
2021 Marete, A. and N. Bissonnette. SnpRecode: A Versatile and Fast Genotype Recoding and Correlation Function. Research Square. doi.org/10.21203/rs.3.rs-95704/v3.
2021 - Consulter les détails de la publication
Are some cows genetically susceptible to Johne’s Disease?
2021 - Consulter les détails de la publication
Mallikarjunappa, S., Shandilya, U.K., Sharma, A., Lamers, K., Bissonnette, N., Karrow, N.A., Meade, K.G. (2020). Functional analysis of bovine interleukin-10 receptor alpha in response to Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis lysate using CRISPR/Cas9. BMC Genetics, [online] 21(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12863-020-00925-4
2020 - Consulter les détails de la publication
Nathalie Bissonnette, Andrew Marete, Dave Kelton, Flavio Schenkel, Eveline M Ibeagha-Awemu, Gilles Fecteau, Filippo Miglior, Conditional GWAS using sequence-based genotypes for susceptibility to Mycobacterium avium subsp paratuberculosis infection in Canadian Holstein, Journal of Animal Science, Volume 98, Issue Supplement 4, November 2020, Page 17.
2020 - Consulter les détails de la publication
S. Mallikarjunappa, F. S. Schenkel, L. F. Brito, N. Bissonnette, K. G. Meade, F. Miglior, J. Chesnais, M. Lohuis, and N. A. Karrow. 2019. Association des SNPs à la maladie de Johne chez les taureaux Holstein pour lesquels la valeur estimée d'élevage pour le test ELISA du lait est utilisée.
2019 - Consulter les détails de la publication
Lessard, M., Blais, M., Beaudoin, F., Deschene, K., Verso, L.L., Bissonnette, N., Lauzon, K., Guay, F. (2018). Piglet weight gain during the first two weeks of lactation influences the immune system development. Veterinary Immunology and Immunopathology, [online] 206 25-34. http://dx.doi.org/10.1016/j.vetimm.2018.11.005
2018 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., D. Gendron, O. Ariel, P.-L. Dudemaine, and E. Ibeagha-Awemu. Transcriptome profiling of primary bovine macrophages from cows with Johne’s disease suggests a tolerance state induced by convergent signalling via NF-κB and its synergistic tolerized genes. ASAS-CSAS Annual Meeting & Trade Show, Vancouver, Canada, July 8-12th.
2018 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., J.-S. Brouard, O. Ariel, N. Gévry, E. Ibeagha-Awemu, and F. Miglior. 2018. Discovery of expression quantitative trait loci associated with Johne’s disease using both RNA-seq and DNA variants. 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. February 10th-16th 2018, Auckland, New-Zealand.
2018 - Consulter les détails de la publication
Do D.N., Fomenky B.E., Dudemaine P-L., Bissonnette N. and Ibeagha-Awemu E.M. (2018) Weighted gene co-expression network analysis reveal gene clusters and pathways related to rumen development in calves. Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Productio, 11.945, February 11 to 16, 2018, Auckland New Zealand. 5 pages.
2018 - Consulter les détails de la publication
Brouard and Bissonnette. 2018. Is the GATK joint variant discovery approach appropriate for calling variants in RNA-Seq experiments? Plant and Animal Genome Conference XXVI, Jan 13th-17th 2018, San diego USA.
2018 - Consulter les détails de la publication
N. Bissonnette, Genetic association of variations in the osteopontin gene (SPP1) with lactation persistency in dairy cattle. 2017 Journal of Dairy Science. sous presse
2017 - Consulter les détails de la publication
Brouard et al. 2017. Génotypage par séquençage de faible profondeur (GBS) d'une population bovine: stratégies pour maximiser la sélection des génotypes de haute qualité et la précision de l'imputation. BMC Genetics 18:32.
2017 - Consulter les détails de la publication
Do DN, Bissonnette N, Lacasse P, Miglior F, Sargolzaei M, Zhao X & Ibeagha-Awemu EM 2017 Genome-wide association analysis and pathways enrichment for lactation persistency in Canadian Holstein cattle. J Dairy Sci 100(3) 1955-1970
2017 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., J.-S. Brouard, B. Boyle, and E. Ibeagha-Awemu. 2017. Low-Depth Genotyping-by-Sequencing (GBS) in a Bovine Population: Strategies to Maximize the Selection of High Quality Genotypes and Accuracy of Imputation. Plant & Animal Genome Plant & Animal Genome Conference, San Diego 2017/01/14 - 2017/01/18
2017 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Thow et al. 2017. Comparison of commercial DNA extraction kits and quantitative PCR systems for better sensitivity in detecting the causative agent of paratuberculosis in dairy cow fecal samples. Journal of Dairy Science 100(1):572-581.
2017 - Consulter les détails de la publication