Natalie C. Knox

Chef de l’unité de biologie computationnelle

Chercheuse scientifique et chef de l’unité de biologie computationnelle, section de bioinformatique

Recherche et / ou projets en cours

La recherche de la Dre Knox porte sur l’application de la génomique microbienne et des méthodes bioinformatiques à la surveillance et à la détection des maladies infectieuses en santé publique et en microbiologie clinique. De plus, elle étudie l’influence du microbiome intestinal sur la santé et les maladies, en particulier les maladies inflammatoires à médiation immunitaire.

Énoncés de recherches/projets

• Métagénomique de la santé publique pour la détection des pathogènes en microbiologie alimentaire et clinique

• Épidémiologie génomique des pathogènes

• Microbiome intestinal dans les maladies inflammatoires à médiation immunitaire (p. ex., MII et SP)

• Élaboration d’un cadre pancanadien pour la mise en œuvre de nouvelles technologies de génomique en santé publique

• Avancement de l’identification et du diagnostic des maladies infectieuses au moyen des technologies omiques à partir d’initiatives et à de collaborations internationales

• Recherche de solutions au fardeau disproportionné sur la santé (p. ex., le cancer de l’estomac) causé par les infections de Helicobacter pylori dans les communautés autochtones de l’Arctique en utilisant l’épidémiologie génomique

Prix et études

Études:

Doctorat en sciences animales, Université du Manitoba

B.Sc. en sciences de la nutrition humaine, Université du Manitoba

Prix:

Prix de citation Nakano (2014) : pour l’une des meilleures publications de 2013 dans NCEZID, CDC (National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases)

Nomination pour le prix Shepard (2014). Meilleure publication au CDC dans la catégorie des sciences laboratoires

Prix au mérite en recherche de l’ASPC (2012), prix d’équipe (Section de bioinformatique)

Liens additionnels

NBCI:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Knox+NC%5Bauth%5D

University of Manitoba:

https://umanitoba.ca/faculties/health_sciences/medicine/units/medical_microbiology/faculty/12967.html

VADA:

http://vada.cs.umanitoba.ca/about-us/faculty/

Principales publications

Knox, N.C., Forbes, J.D., Peterson, C.-L., Van Domselaar, G., Bernstein, C.N. The Gut Microbiome in Inflammatory Bowel Disease: Lessons Learned From Other Immune-Mediated Inflammatory Diseases 2019 The American journal of gastroenterology. 114(7), pp. 1051-1070.

https://doi.org/10.14309/ajg.0000000000000305

Forbes, J.D., Bernstein, C.N., Tremlett, H., Van Domselaar, G., Knox, N.C. A Fungal World: Could the Gut Mycobiome be Involved in Neurological Disease? 2019 Frontiers in Microbiology. 10(JAN), 3249.

https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.03249

Natalie C. Knox, Jessica Forbes, Gary Van Domselaar, Charles N. Bernstein. The Gut Microbiome as a Target for IBD Treatment: Are We There Yet? 2019 Current Treatment Options in Gastroenterology, 17(1).

https://doi.org/10.1007/s11938-019-00221-w

Forbes, J.D., Chen, C.-Y., Knox, N.C., (...), Bernstein, C.N., Van Domselaar, G. A Comparative Study of the Gut Microbiota in Immune-mediated Inflammatory Diseases - Does a Common Dysbiosis Exist? 2018 Microbiome. 6(1), 221.

https://doi.org/10.3389/fmicb.2018.03249

Forbes, J.D., Knox, N.C., Peterson, C.-L., Reimer, A.R. Highlighting Clinical Metagenomics for Enhanced Diagnostic Decision-making: A Step Towards Wider Implementation. 2018 Computational and Structural Biotechnology Journal 16, pp. 108-120.

https://doi.org/10.1016/j.csbj.2018.02.006

Forbes, J.D., Knox, N.C., Ronholm, J., Pagotto, F., Reimer, A. Metagenomics: The Next Culture-Independent Game Changer. 2017 Frontiers in Microbiology, 8(JUL), 1069.

https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.01069

Knox, N.C., Weedmark, K.A., Conly, J., (...), Hosein, F.S., Drews, S.J. Unusual Legionnaires' outbreak in cool, dry Western Canada: An investigation using genomic epidemiology. 2017 Epidemiology and Infection. 145(2), pp. 254-265.

https://doi.org/10.1017/S0950268816001965

Peterson, S.W., Knox, N.C., Golding, G.R., (...), Mulvey, M.R., Graham, M.R. A study of the infant nasal microbiome development over the first year of life and in relation to their primary adult caregivers using cpn60 universal target (UT) as a phylogenetic marker. 2016 PLoS ONE, 11(3), e0152493.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0152493

Lynch, T., Petkau, A., Knox, N., Graham, M., Van Domselaar, G. Primer on infectious disease bacterial genomics. 2016 Clinical Microbiology Reviews, 29(4), pp. 881-913.

https://doi.org/10.1128/CMR.00001-16

Khan, M.A., Knox, N., Prashar, A., (...), Ensminger, A.W., Guyard, C. Comparative Genomics Reveal That Host-Innate Immune Responses Influence the Clinical Prevalence of Legionella pneumophila Serogroups. 2013 PLoS ONE, 8(6),e67298.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0067298