Natalia V. Bykova, Ph.D.

Image Natalia V Bykova
Chercheuse scientifique

Protéomique des céréales, analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications post‑traductionnelles par spectrométrie de masse

Recherche et / ou projets en cours

Le programme de recherche est axé sur l’analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications; la coordination post-traductionnelle des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences; les technologies quantitatives fondées sur la spectrométrie de masse en protéomique végétale pour une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires qui régulent les fonctions et les interactions des protéines.

Intégration de la protéomique quantitative, de la métabolomique d’oxydoréduction et de la protéogénomique afin de déterminer les sources de résistance à la germination avant la récolte dans le blé canadien.

Atténuation des nouvelles menaces pour le blé – menace de rouille sur le blé dur mexicain. Découverte de protéines effectrices ciblant le noyau – analyse protéomique nucléaire quantitative de l’interaction hôte‑pathogène, intégration des données omiques et bio‑informatiques, validation et analyses fonctionnelles des effecteurs candidats, dont les gènes R et les cibles de l’hôte.

 

Énoncés de recherches/projets

Protéomique végétale fonctionnelle et caractérisation des protéines par spectrométrie de masse, réaction aux maladies et au stress

    Analyse protéomique des modifications – identification et caractérisation par spectrométrie de masse des modifications post‑traductionnelles que sont la phosphorylation, la glycosylation et l’oxydoréduction cystéinique, et élucidation des relations entre les modifications et les fonctions.

    Détermination du rôle des modifications protéiques post‑traductionnelles dans la coordination des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences

    Détermination des éléments des voies de signalisation et des mécanismes moléculaires liés aux interactions entre les plantes et les agents pathogènes

Activités professionnelles / intérêts

Membre de la Société canadienne de biologie végétale et de l’American Society of Plant Biologists; membre de l’International Plant Proteomics Organization (INPPO) et représentante du Canada et porte‑parole au Conseil exécutif de l’INPPO (depuis 2011), un organisme qui facilite la mise au point de nouvelles technologies en sciences végétales, fait la promotion de la protéomique végétale et intensifie la coopération internationale en vue de l’intégration des activités liées à la protéomique végétale.

Prix et études

Ph. D. en biochimie, Université d’État de Voronej, Russie

M. Sc. en biochimie et physiologie végétales, Université d’État de Voronej, Russie

Bourse d’études de cycle supérieur – G. Soros International Science Foundation, États‑Unis, 1996

Expérience et / ou de travail international

Professeure adjointe – Département de biologie, Memorial University of Newfoundland (MUN), 2008 à 2012

Associée de recherche – Applications de spectrométrie de masse en biologie, Time-of-Flight Mass Spectrometry Laboratory, Département de physique et d’astronomie, Université du Manitoba, 2002 à 2004

Poste postdoctoral – Protéomique, Département de recherche sur les végétaux, Risø National Laboratory, Danemark, 2001 à 2002

Bourse postdoctorale – Quatrième programme cadre de biotechnologie de l’UE, Département de physiologie végétale, Umeå Plant Science Centre, Université d’Umeå, Suède, 1998 à 2001

Bourse d’études du Swedish Institute (total de 7 mois) – Département de physiologie végétale, Université de Lund, Suède, 1998

 

Principales publications

  1. Rampitsch C, Bykova NV, Wang X, Huang M, Djuric-Ciganovic S (2018) Candidate Effector Proteome of the apoplastic space of wheat leaves infected with leaf rust (Puccinia triticina). 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation

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  2. Bykova NV, Rampitsch M, Rampitsch C, Huang M (2018) Histone posttranslational modification landscape related to epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Poster presentation

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  3. Bykova NV, Jordan M, Radovanovic N, Rampitsch M, Hu-Skrzenta J, Huang M (2018) Proteomic signatures associated with pre-harvest sprouting resistance in wheat revealed through proteogenomics. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation

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  4. Dumont S, Bykova NV, Rojas LM, Bélanger M, Rivoal J (2018) Arabidopsis thaliana Enolase 2 is modified by S-glutathionylation. Plant Biology 2018. A joint meeting of the American Society of Plant Biologists, Canadian Society of Plant Biologists/Societe Canadienne de Biologie Vegetale, and the International Society of Photosynthesis Research, Montreal, Québec, Canada, July 14-18, 2018. Poster

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  5. Huang M, Fernando U, Djuric-Ciganovic S, Wang X, Bakkeren G, Linning R, Bykova NV, Rampitsch C (2018) Quantitative proteomic approaches to characterize the dynamic and comprehensive defence responses of wheat to leaf rust. 66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, San Diego, CA, USA, June 3-7, 2018. Poster

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  6. Igamberdiev AU, Bykova NV (2018) Role of organic acids in the integration of cellular redox metabolism and mediation of redox signalling in photosynthetic tissues of higher plants. Free Radic Biol Med. pii: S0891-5849(18)30026-1. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2018.01.016. [Epub ahead of print]

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  7. Ma Z, Bykova NV, Igamberdiev AU (2017) Cell signaling mechanisms and metabolic regulation of germination and dormancy in barley seeds. The Crop Journal 5(6): 459-477. https://doi.org/10.1016/j.cj.2017.08.007

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  8. Tailor, S., Bykova, N.V., Igamberdiev, A.U., Debnath, S.C. (2017). Structural pattern and genetic diversity in blueberry (Vaccinium) clones and cultivars using EST-PCR and microsatellite markers, 64(8), 2071-2082. http://dx.doi.org/10.1007/s10722-017-0497-1

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  9. RM1. The activity of key fermentative enzyme Alcohol Dehydrogenase 1 from Arabidopsis thaliana is differentially altered by several redox post-translational modifications. S. Dumont1*, N.V. Bykova2, A. Khaou1, Y. Besserour1, J. Rivoal1.Canadian Society of Plant Biologists. Eastern Regional Meeting 2017. November 24-25, 2017. Montreal, Canada.

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  10. Bykova NV, Jordan M, Radovanovic N, Rampitsch M, Hu-Skrzenta J (2017) Proteogenomics analysis of seed dormancy identifies genotype- and phenotype-associated proteomic signatures of pre-harvest sprouting resistance in dormant and non-dormant hybrid genotypes of wheat. In: Plants from Sea to Sky. A joint meeting of the CSPB and the Canadian Society for Horticultural Science, Vancouver, British Colombia, Canada, July 4-7, 2017. Poster number 246-DV.

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Installation de recherche

101, Route 100, Unité 100
Morden, MB R6M 1Y5
Canada

Language

Anglais