Natalia V. Bykova, Ph.D.

Chercheuse scientifique

Protéomique des céréales, analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications post‑traductionnelles par spectrométrie de masse

Agriculture et Agroalimentaire Canada

101 Route 100, Unit 100, Morden, Manitoba, R6M 1Y5

Recherche et / ou projets en cours

Le programme de recherche est axé sur l’analyse protéomique quantitative et fonctionnelle des modifications; la coordination post-traductionnelle des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences; les technologies quantitatives fondées sur la spectrométrie de masse en protéomique végétale pour une meilleure compréhension des mécanismes moléculaires qui régulent les fonctions et les interactions des protéines.

Intégration de la protéomique quantitative, de la métabolomique d’oxydoréduction et de la protéogénomique afin de déterminer les sources de résistance à la germination avant la récolte dans le blé canadien.

Atténuation des nouvelles menaces pour le blé – menace de rouille sur le blé dur mexicain. Découverte de protéines effectrices ciblant le noyau – analyse protéomique nucléaire quantitative de l’interaction hôte‑pathogène, intégration des données omiques et bio‑informatiques, validation et analyses fonctionnelles des effecteurs candidats, dont les gènes R et les cibles de l’hôte.

Énoncés de recherches/projets

Protéomique végétale fonctionnelle et caractérisation des protéines par spectrométrie de masse, réaction aux maladies et au stress

Analyse protéomique des modifications – identification et caractérisation par spectrométrie de masse des modifications post‑traductionnelles que sont la phosphorylation, la glycosylation et l’oxydoréduction cystéinique, et élucidation des relations entre les modifications et les fonctions.

Détermination du rôle des modifications protéiques post‑traductionnelles dans la coordination des voies de signalisation induites dans les plantes en réaction au stress biotique et abiotique et pendant le développement des semences

Détermination des éléments des voies de signalisation et des mécanismes moléculaires liés aux interactions entre les plantes et les agents pathogènes

Activités professionnelles / intérêts

Membre de la Société canadienne de biologie végétale et de l’American Society of Plant Biologists; membre de l’International Plant Proteomics Organization (INPPO) et représentante du Canada et porte‑parole au Conseil exécutif de l’INPPO (depuis 2011), un organisme qui facilite la mise au point de nouvelles technologies en sciences végétales, fait la promotion de la protéomique végétale et intensifie la coopération internationale en vue de l’intégration des activités liées à la protéomique végétale.

Prix et études

Ph. D. en biochimie, Université d’État de Voronej, Russie

M. Sc. en biochimie et physiologie végétales, Université d’État de Voronej, Russie

Bourse d’études de cycle supérieur – G. Soros International Science Foundation, États‑Unis, 1996

Expérience et / ou de travail international

Professeure adjointe – Département de biologie, Memorial University of Newfoundland (MUN), 2008 à 2012

Associée de recherche – Applications de spectrométrie de masse en biologie, Time-of-Flight Mass Spectrometry Laboratory, Département de physique et d’astronomie, Université du Manitoba, 2002 à 2004

Poste postdoctoral – Protéomique, Département de recherche sur les végétaux, Risø National Laboratory, Danemark, 2001 à 2002

Bourse postdoctorale – Quatrième programme cadre de biotechnologie de l’UE, Département de physiologie végétale, Umeå Plant Science Centre, Université d’Umeå, Suède, 1998 à 2001

Bourse d’études du Swedish Institute (total de 7 mois) – Département de physiologie végétale, Université de Lund, Suède, 1998

Principales publications

Natalia V. Bykova, Christof Rampitsch, Abir U. Igamberdiev, Plant proteomics: From the molecular basis of biological processes to a systems biology perspective, Journal of Plant Physiology, Volume 280, 2023, 153880, ISSN 0176-1617, https://doi.org/10.1016/j.jplph.2022.153880.
2023 - Consulter les détails de la publication
Bykova NV, Rampitsch C, McCallum B, Bakkeren G, Wang X, Huang M, Fernando U, Radovanovic N, Rampitsch M, Linning R (2021) Profiling the total and nuclear proteomes of host-pathogen interactions of the wheat Thatcher near-isogenic line for Lr2a resistance gene with virulent and avirulent races of Puccinia triticina. 4th International Plant Proteomics Organization (INPPO) Conference. Virtual Conference hosted from Winnipeg, Canada, March 9-11, 2021. Poster http://www.inppo2020.org/
2021 - Consulter les détails de la publication
Ouellet J, Dumont S, Bykova NV, Rojas LM, Dorion S, Bélanger M, Kornblatt, MJ, Rivoal J (2020) Effects of redox modifications on proteins encoded by the Low expression of OSmotically responsive genes 2 locus in Arabidopsis thaliana. Concours d'affiches scientifiques étudiantes 2020 du Centre SÈVE, Virtual Meeting, Québec, Canada, November 25-26, 2020. Poster, student
2020 - Consulter les détails de la publication
Ouellet J, Dumont S, Bykova NV, Rojas LM, Dorion S, Bélanger M, Kornblatt, MJ, Rivoal J (2020) Redox sensitivity of proteins encoded by the Low expression of OSmotically responsive genes 2 locus in Arabidopsis thaliana. CSPB/SCBV 2020 Virtual Meeting, November 7, 2020. Oral presentation, student
2020 - Consulter les détails de la publication
Jayawardhane, J., Cochrane, D.W., Vyas, P., Bykova, N.V., Vanlerberghe, G.C., Igamberdiev, A.U. (2020). Roles for Plant Mitochondrial Alternative Oxidase Under Normoxia, Hypoxia, and Reoxygenation Conditions. Frontiers in Plant Science, [online] 11 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2020.00566
2020 - Consulter les détails de la publication
Møller, Ian & Igamberdiev, Abir & Bykova, Natalia & Finkemeier, Iris & Rasmusson, Allan & Schwarzländer, Markus. (2020). Matrix Redox Physiology Governs the Regulation of Plant Mitochondrial Metabolism through Post-Translational Protein Modifications. The Plant Cell. 10.1105/tpc.19.00535.
2020 - Consulter les détails de la publication
Bykova NV, Jordan M, Radovanovic N, Rampitsch M, Hu-Skrzenta J, Huang M (2019) Integrated proteogenomic, quantitative redox proteomic and metabolomic approaches reveal signatures of seed dormancy control in wheat. The 14th International Conference on Reactive Oxygen and Nitrogen Species in Plants. Munich, Germany, July 10-12, 2019. Oral presentation
2019 - Consulter les détails de la publication
Jayawardhane J, Cochrane DW, Shah JK, Bykova NV, Vanlerberghe GC, Igamberdiev AU (2019) The involvement of mitochondrial electron transport chain components in nitric oxide metabolism in plants. The 14th International Conference on Reactive Oxygen and Nitrogen Species in Plants. Munich, Germany, July 10-12, 2019. Oral presentation
2019 - Consulter les détails de la publication
Dumont, S., Bykova, N.V., Khaou, A., Besserour, Y., Dorval, M., Rivoal, J. (2019). Arabidopsis thaliana alcohol dehydrogenase is differently affected by several redox modifications. PLoS ONE, [online] 13(9), http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0204530
2019 - Consulter les détails de la publication
Rampitsch M, Huang M, Zhen Y, Radovanovic N, Xu W, Rampitsch C, Bykova NV (2019). Profiling of histone acetylation and methylation marks associated with embryo and aleurone tissue-specific epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Atlanta, Georgia, June 2 - 6, 2019. Poster presentation, Abstract ID number: 299846.
2019 - Consulter les détails de la publication
Igamberdiev AU, Bykova NV (2019) Metabolism and Interplay of Reactive Oxygen and Nitrogen Species in Plant Mitochondria. In: Nitric Oxide and Hydrogen Peroxide Signaling in Higher Plants. D.K. Gupta, J. M. Palma, F. J. Corpas (Editors), Springer International Publishing AG Switzerland. https://doi.org/10.1007/978-3-030-11129-8_5; pp 91-106.
2019 - Consulter les détails de la publication
Rampitsch C, Bykova NV, Wang X, Huang M, Djuric-Ciganovic S (2018) Candidate Effector Proteome of the apoplastic space of wheat leaves infected with leaf rust (Puccinia triticina). 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation
2018 - Consulter les détails de la publication
Bykova NV, Rampitsch M, Rampitsch C, Huang M (2018) Histone posttranslational modification landscape related to epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Poster presentation
2018 - Consulter les détails de la publication
Bykova NV, Jordan M, Radovanovic N, Rampitsch M, Hu-Skrzenta J, Huang M (2018) Proteomic signatures associated with pre-harvest sprouting resistance in wheat revealed through proteogenomics. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation
2018 - Consulter les détails de la publication
Dumont S, Bykova NV, Rojas LM, Bélanger M, Rivoal J (2018) Arabidopsis thaliana Enolase 2 is modified by S-glutathionylation. Plant Biology 2018. A joint meeting of the American Society of Plant Biologists, Canadian Society of Plant Biologists/Societe Canadienne de Biologie Vegetale, and the International Society of Photosynthesis Research, Montreal, Québec, Canada, July 14-18, 2018. Poster
2018 - Consulter les détails de la publication
Huang M, Fernando U, Djuric-Ciganovic S, Wang X, Bakkeren G, Linning R, Bykova NV, Rampitsch C (2018) Quantitative proteomic approaches to characterize the dynamic and comprehensive defence responses of wheat to leaf rust. 66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, San Diego, CA, USA, June 3-7, 2018. Poster
2018 - Consulter les détails de la publication
Igamberdiev AU, Bykova NV (2018) Role of organic acids in the integration of cellular redox metabolism and mediation of redox signalling in photosynthetic tissues of higher plants. Free Radic Biol Med. pii: S0891-5849(18)30026-1. doi: 10.1016/j.freeradbiomed.2018.01.016. [Epub ahead of print]
2018 - Consulter les détails de la publication
Ma Z, Bykova NV, Igamberdiev AU (2017) Cell signaling mechanisms and metabolic regulation of germination and dormancy in barley seeds. The Crop Journal 5(6): 459-477. https://doi.org/10.1016/j.cj.2017.08.007
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Tailor, S., Bykova, N.V., Igamberdiev, A.U., Debnath, S.C. (2017). Structural pattern and genetic diversity in blueberry (Vaccinium) clones and cultivars using EST-PCR and microsatellite markers. Genetic Resources and Crop Evolution, [online] 64(8), 2071-2082. http://dx.doi.org/10.1007/s10722-017-0497-1
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RM1. The activity of key fermentative enzyme Alcohol Dehydrogenase 1 from Arabidopsis thaliana is differentially altered by several redox post-translational modifications. S. Dumont1*, N.V. Bykova2, A. Khaou1, Y. Besserour1, J. Rivoal1.Canadian Society of Plant Biologists. Eastern Regional Meeting 2017. November 24-25, 2017. Montreal, Canada.
2017 - Consulter les détails de la publication