Li, Xiang (Sean)

Image Li, Sean (Xiang)
Chercheur scientifique

Au laboratoire de Charlottetown de l’Agence canadienne d’inspection des aliments, M. Li coordonne et mène des recherches et conçoit des technologies à l’appui de la détection, de l’identification et de la classification de bactéries phytopathogènes d’importance réglementaire. Il se spécialise dans des maladies comme la pourriture brune de la pomme de terre, le flétrissement bactérien, la jambe noire/pourriture molle, la maladie de la chip zébrée et les maladies à phytoplasmes, ainsi que la pourriture des racines et la carie de la souche des conifères au moyen de la génomique et de la métagénomique comparative, de la phylogénétique et de la phylogéographie, et des technologies de diagnostic traditionnelles et moléculaires.

Agence canadienne d'inspection des aliments

Recherche et / ou projets en cours

Détection et identification de bactéries phytopathogènes d’importance réglementaire : Ralstonia solanacearum, Clavibacter sepedonicus, Candidatus Liberibacter solanacearum, Candidatus Phytoplasma spp.

Classification et taxonomie de bactéries phytopathogènes : Clavibacter spp., Pectobacterium spp., Dickeya spp.

Élaboration de techniques de diagnostic « sur-le-champ » : Appareil portatif utilisant des technologies basées sur l’amplification isothermique par clivage invasif et qPCR.

Phylogénétique et phylogéographie des maladies de la pourriture des racines et de la carie de la souche des conifères : Heterobasidion spp.

Autres activités de recherche : Gale commune et gale poudreuse de la pomme de terre, flétrissure bactérienne de Stewart chez le maïs, maladie des stries bactériennes, maladies causées par des virus et des viroïdes chez la pomme de terre.

Technologies de génomique et de métagénomique comparatives.

Activités professionnelles / intérêts

•Membre du Comité de taxonomie des bactéries phytopathogènes de la Société internationale de phytopathologie.

•Membre du Comité de quarantaine et de biosécurité de la Société internationale de phytopathologie.

•Membre du comité de rédaction d’Acta Microbiologica Sinica.

•Membre de l’American Phytopathology Society, membre du Comité de diagnostic et membre du Comité de bactériologie.

•Membre de la Société canadienne de phytopathologie.

•Conférencier lors de nombreuses conférences et à de nombreuses universités.

•Supervision de chercheurs postdoctoraux et d’étudiants au doctorat et à la maîtrise et d’étudiants inscrits à un programme d’alternance travail-études.

•Examen de manuscrits scientifiques pour des revues internationales.

•Examen de demandes de proposition pour des subventions de recherche.

•Professeur adjoint, département de biologie, Université de l’Île-du-Prince-Édouard, depuis 2008.

Prix et études

1993-1995 – Participation au Programme de bourses de recherche scientifique dans les laboratoires du gouvernement canadien (chercheur postdoctoral), Station de recherche de Vancouver d’AAC, Vancouver (Colombie-Britannique) Canada

1993. Doctorat du département de microbiologie, Université du Queensland, QLD, Australie; Récompense : bourse d’études supérieures de l’Université du Queensland

1983. Baccalauréat en sciences agricoles, département de protection des plantes, Université d’agriculture de Huazhong, Wuhan, Chine

Principales publications

1.Li X., J. Tambong, X. Yuan., W. Chen, H. Xu, C.A. Levesque et S.H. De Boer. « Re-classification of Clavibacter michiganensis subspecies on the basis of whole-genome and multi-locus sequence analyses. » International Journal of Systematics and Evolutionary Microbiology, 68:234–240, 2018. DOI 10.1099/ijsem.0.002492

2.Li X., X. Yuan. « Genome sequences for multiple Clavibacter strains from different subspecies. » Genome Announcements, 5:e00721-17, 2017. https://doi.org/10.1128/genomeA.00721-17.

3.Tian, Y., Y. Zhao, X. Yuan, J. Yi, J. Fan, Z. Xu, B. Hu*, S.H. De Boer et X. Li*. « Dickeya fangzhongdai sp. nov., a plant-pathogenic bacterium isolated from pear trees (Pyrus pyrifolia). » International Journal of Systematic and Evolutional Microbiology, 66(8):2831-2835, 2016.

4.Gagnon, M.C., T. van der Lee, P. Bonants, D.S. Smith, X. Li, C.A. Levesque et G.J. Bilodeau. « Development of polymorphic microsatellite loci for potato wart from next-generation sequence data. » Phytopathology, 106(6):636-644, 2016.

5.Li, X., S.H. De Boer, A.M. Alvarez et N.W. Schaad. « Detection of Ralstonia solanacearum in potato and geranium. » Manual on detection of plant pathogenic bacteria in seed and planting material, chapitre 30, (Ed. M'Barek Fatmis), APS Press, 2016.

6.Yuan, K., J. Cullis, C.A. Lévesque, J. Tambong, W. Chen, C.T. Lewis, S.H. De Boer et X. Li. « Draft genome sequences of Ralstonia solanacearum race 3 biovar 2 strains with different temperature adaptations. » Genome Announcements, 3(4):e00815-15, 2015. doi: 10.1128/genomeA.00815-15.

7.Li, X., K. Yuan, J. Cullis, C.A. Lévesque, W. Chen, C.T. Lewis et S.H. De Boer. « Draft genome sequences for Canadian isolates of Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliense with weak virulence on potato. » Genome Announcements, 3(2):e00240-15, 2015. doi:10.1128/genomeA.00240-15.

8.Yuan, K., L. Adam, J. Tambong, C.A. Lévesque, W. Chen, C.T. Lewis, S.H. De Boer et X. Li*. « Draft genome sequence of Pectobacterium wasabiae strain CFIA1002. » Genome Announcement, 15:2(3). pii: e00214-14, 2013. doi: 10.1128/genomeA.00214-14.

9.Li, X.*, J. Nie, D.L. Hammill, D. Smith, H. Xu et S.H. De Boer. « A comprehensive comparison of assays for detection and identification of Ralstonia solanacearum race 3 biovar 2. » Journal of Applied Microbiology,117(4):1132-43, 2014. doi: 10.1111/jam.12585.

10.Bull, C.T., T.A. Coutinho, T.P. Denny, G. Firrao, M.F. Saux, X. Li, G.S. Saddler, M. Scortichini, D.E. Stead et Y. Takikawa. « List of new names of plant pathogenic bacteria 2011-2012. » Journal of Plant Pathology, 96: 223-226, 2014.

11.Yuan, K., X. Li*, L. Adam, J. Tambong, C.A. Lévesque, W. Chen, C.T. Lewis et S.H. De Boer. « Draft genome sequence of Pectobacterium wasabiae strain CFIA1002. Genome Announcement, 2(3):e00214‑14, 2014. doi:10.1128/genomeA.00214-14.

12.Li, X., J. Nie, H. Arsenault, D.L. Hammill, H. Xu et S.H. De Boer. « Tomato as a latent carrier of ‘Candidatus Liberibacter solanacearum’, the causal agent of potato zebra chip disease » EPPO Bulletin, 43 (2): 229-237, 2013.

13.De Boer, S.H., X. Li et L. Ward. « Pectobacterium spp. associated with bacterial stem rot syndrome of potato in Canada. » Phytopathology 102: 937-947, 2012.

14.Xu, M., X. Chen, M. Qiu, X. Zeng, J. Xu, D. Deng, G.  Sun, X. Li et J. Guo. « Bar-coded pyrosequencing reveals the responses of PBDE-degrading microbial communities to electron donor amendments. » PLOS One 7(1): e30439, 2012.

15.Li, X., J. Nie, L. Ward, J. Nickerson et S.H. De Boer. « Development and evaluation of a loop-mediated isothermal amplification assay for rapid detection and identification of Pectobacterium atrosepticum. » Revue canadienne de phytopathologie 33: 447-457, 2011.

16.Li, X., L. Levy, A.F. Olivas et S.H. De Boer. « Detection and Identification of Ralstonia solanacearum Phylotype II Sequevar 1 (Race 3 Biovar 2) » Annexe 19 dans NAPPO RSPM 3, 2011.

17.Madani, M., S.A. Subbotin, L.J. Ward, X. Li et S.H. De Boer. « Molecular characterization of Canadian populations of potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallida using ribosomal nuclear RNA and cytochrome b genes. » Revue canadienne de phytopathologie, 32: 252-263, 2010.

18.Li, X., J. Nie, L. Ward, M. Madani, T. Hsiang, Y. Zhao et S.H. De Boer. « Comparative genomics-guided loop-mediated isothermal amplification for characterization of Pseudomonas syringae pv. phaseolicola. » Journal of Applied Microbiology, 107(3): 717-726, 2009.

19.Secor, G.A., V.V. Rivera, J.A. Abad, G.R.G. Clover, L.W. Liefting, X. Li et S.H. De Boer. « Association of ‘Candidatus Liberibacter’ sp. with the Zebra Chip Disease of Potato Established by Grafting, Psyllid Transmission and Electron Microscopy. » Plant Disease, 93(6): 574-583, 2009.

20.Li, X.*, J. Guo, S. Dai, Y. Ouyang, H. Wu, W. Sun et G. Wang. « Exploring and exploiting microbial diversity through metagenomics for natural product drug discovery. » Current Topics in Medicinal Chemistry, 9 (16): 1525-1535, 2009.

21.Xie, L.W., S.M. Jiang, H.H. Zhu, W. Sun, Y.C. Ouyang, S.K. Dai et X. Li*. « Potential inhibitors against Sclerotinia sclerotiorum, produced by fungus Myrothecium sp. associated with marine sponge Axinella sp. » European Journal of Plant Pathology, 122(4): 571-578, 2008.

22.Li, X.* et L. Qin. « Metagenome-Based Drug Discovery and Marine Microbial Diversity. » Trends in Biotechnology, 23 (11): 539-543, 2005.

23.Li, X.* et S.H. De Boer. « First Report of Burkholderia andropogonis causing leaf spots of Bougainvillea sp. in Hong Kong and clover in Canada. » Plant Disease, 89: 1132, 2005.