Izhar Khan, Ph. D.

Chercheur scientifique

Mes travaux dans le domaine de la santé environnementale, de la biodiversité et des bioressources portent sur l’élaboration de méthodes quantitatives de pointe permettant de détecter et d’identifier rapidement et facilement les agents anthropopathogènes et zoopathogènes d’origine hydrique ou alimentaire, et ce, afin de déterminer d’où provient la pollution fécale dans différentes niches environnementales. En outre, j'ai travaillé sur la classification taxonomique de bactéries telles que les genres Acinetobacter, Campylobacter et Arcobacter et j'étudie leur pathogénicité et leur résistance aux antibiotiques chez l'homme et les animaux à l'aide du séquençage de nouvelle génération afin de fournir des informations sur la diversité génétique et la relation évolutive entre les espèces et souches.

Agriculture et Agroalimentaire Canada
Edifice Neatby, 960, avenue Carling, Ottawa, Ontario

Recherche et / ou projets en cours

  • Effets des pratiques agricoles et des facteurs environnementaux sur la répartition et la diversité des bactéries pathogènes d’origine hydrique dans les bassins hydrographiques agricoles.
  • Mise au point d’outils moléculaires de pointe pour la détection et l’identification rapides des agents pathogènes microaérophiles.
  • Épreuve de PCR quantitative en temps réel pour la détection et la quantification des bactéries et des virus pathogènes pour l’humain et l’animal provenant de diverses sources environnementales.
  • Détection et caractérisation moléculaires d’agents pathogènes émergents d’origine hydrique et d’indicateurs microbiens de la qualité de l’eau dans les bassins hydrographiques agricoles et urbains.
  • Caractérisation génotypique des agents pathogènes par séquençage de l’ADN, électrophorèse en champ pulsé et analyse du polymorphisme des sites de restriction.

Énoncés de recherches/projets

1. Solidifier la compétitivité et la durabilité du secteur agricole et agroalimentaire canadien.

2. Faire la promotion de l’innovation et d’un environnement sain en favorisant les priorités qui suivent, et ce, afin d’obtenir la meilleure information scientifique possible en vue de décisions en matière de politiques et de réglementation :

       i). accroître la performance environnementale du système agricole canadien;

       ii). améliorer la performance environnementale et la durabilité des systèmes de production de porc ou de produits laitiers;

       iii). améliorer la qualité des aliments et la salubrité du système alimentaire;

       iv). améliorer l’identification des ravageurs des cultures et des organismes bénéfiques, et mieux comprendre leur cycle biologique;

       v). réduire la dégradation chimique, biologique et physique des sols et en maintenir la santé  en améliorant les pratiques de gestion des  productions agricoles et du fumier;

       vi). déterminer quelles pratiques de gestion bénéfiques permettent de limiter les risques de contamination de l’eau, des sols et de l’air.

Prix et études

Doctorat, Université Justus-Liebig de Giessen (Allemagne)

Maîtrise en sciences, University of Agriculture Faisalabad (Pakistan)

Doctorat en médecine vétérinaire, University of Agriculture Faisalabad (Pakistan)

Expérience et / ou de travail international

  • Spécialiste des sciences physiques (PC-02), Environnement Canada – Direction des sciences et de la technologie de l’eau – Microbiologie, Centre canadien des eaux intérieures (CCEI), Burlington (Ontario).

  • Programme de bourses de recherche scientifique du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG) dans les laboratoires du gouvernement canadien, Environnement Canada – CCEI, Burlington (Ontario).

  • Conseiller en recherche, Environnement Canada, CCEI, Burlington (Ontario).

  • Chercheur-boursier, University of Cincinnati (Ohio, États-Unis).

  • Assistant de recherche, Université Justus-Liebig de Giessen (Allemagne).

  • Vétérinaire, Livestock and Poultry Department (Balochistan, Pakistan).

Liens additionnels

https://scholar.google.ca/citations?user=wOmRbAEAAAAJ&hl=en

Principales publications

  1. Whiteduck-Leveillee, K., Laprade, N., Whiteduck-Leveillee, J., Topp, E., Kaneza, C.A., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Guylaine, T., Wilkes, G.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Antimicrobial resistance profiling of Arcobacter butzleri isolated from a Canadian agricultural watershed. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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  2. Léveillée, W.J., Kaneza, C.A., Léveillée, K., Talbot, G., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Optimization of a genus-specific PCR assay and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis for rapid detection. », 63rd Annual Conference of the Canadian Society of Microbiologists, Carleton University, Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013, Abstract AE88.

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  3. Edge, T.A., Khan, I.U.H., Bouchard, R., Guo, J., Hill, S., Locas, A., Moore, L., Neumann, N.F., Nowak, E.K., Payment, P., Yang, R., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2013). « Occurrence of waterborne pathogens and Escherichia coli at offshore drinking water intakes in Lake Ontario. », Applied and Environmental Microbiology, 79(19), p. 5799-5813. doi : 10.1128/AEM.00870-13

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  4. Khan, I.U.H., Hill, S., Nowak, E.K., Palmer, ME., Jarjanazi, H., Lee, D.-Y., Mueller, M., Schop, R., Weir, S., Irwin Abbey, A.-M., Winter, J., et Edge, T.A. (2013). « Investigation of the prevalence of thermophilic Campylobacter species at Lake Simcoe recreational beaches. », Inland Waters, 3(1), p. 93-104. doi : 10.5268/iw-3.1.582

    2013 - Consulter les détails de la publication

  5. Edge, T.A., Khan, I.U.H., Bouchard, R., Locas, A., Moore, L., Neumann, N.F., Payment, P., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2012). « Pathogen Occurrence at Offshore Lake Ontario Drinking Water Intakes (2007-10). », Environment Canada, Toronto, ON, Canada, November 20, 2012. (Présentation)

    2012 - Consulter les détails de la publication

  6. Ryu, H., Griffith, J.F., Khan, I.U.H., Moore, L., Locas, A., Hill, S., Neumann, N.F., Edge, T.A., Toledo-Hernandez, C., Gonzalez-Nieves, J., Santo Domingoa, J. (2012). « Comparison of gull feces-specific assays targeting the 16S rRNA genes of Catellicoccus marimammalium and Streptococcus spp. », Applied and Environmental Microbiology, 78(6), p. 1909-1916. doi : 10.1128/AEM.07192-11

    2012 - Consulter les détails de la publication

  7. Edge, T.A., El-Shaarawi, A., Gannon, V.P.J., Jokinen, C.C., Kent, R., Khan, I.U.H., Koning, W., Lapen, D.R., Miller, J.J., Neumann, N.F., Phillips, R., Robertson, W.J., Schreier, H., Scott, A., Shtepani, I., Topp, E., Wilkes, G.A., et van Bochove, É. (2012). « Investigation of an Escherichia coli Environmental Benchmark for Waterborne Pathogens in Agricultural Watersheds in Canada. », Journal of Environmental Quality, 41(1), p. 21-30. doi : 10.2134/jeq2010.0253

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  8. Khan, I.U.H., Edge, T.A., Jarjanazi, H., Lee, D.-Y., Palmer, ME., Mueller, M., Schop, R., Weir, S., et Winter, J. (2011). « Preliminary Investigation on the Prevalence of Campylobacters at Lake Simcoe Beaches. », 1st Biennial Lake Simcoe Protection Plan Science Forum: Science at Work, Kempenfelt Conference Centre,, Barrie, ON, Canada, May 26-27, 2011.

    2011 - Consulter les détails de la publication

  9. Selvaraju, S.B., Khan, I.U.H., et Yadav, J.S. (2011). « Susceptibility of Mycobacterium immunogenum and Pseudomonas fluorescens to Formaldehyde and Non-Formaldehyde Biocides in Semi-Synthetic Metalworking Fluids. », International Journal of Molecular Sciences, 12(1), p. 725-741. doi : 10.3390/ijms12010725

    2011 - Consulter les détails de la publication

  10. Khan, I.U.H., Edge, T.A., Booty, B., Moore, L., Neumann, N.F., Payment, P., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2010). « Occurrence of waterborne pathogens at offshore drinking water intakes in Lake Ontario. », 2010 Lake Ontario Collaborative Study meeting, Toronto, ON, Canada, March 22, 2010.

    2010 - Consulter les détails de la publication

  11. Khan, I.U.H. et Edge, T.A. (2010). « Thermotolerant Campylobacter species in two Lake Ontario beaches. Annual Great Lakes Beaches Conference 2010. », Annual Great Lakes Beaches Conference 2010, Preque Isle, PA, USA, October 19-22, 2010.

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  12. Shtepani, I., Edge, T.A., Valeo, C., Khan, I.U.H., Gannon, V.P.J., Kent, R., Koning, W., Lapen, D.R., Medeiros, D.T., Miller, J., Phillips, R., Topp, E., van Bochove, É., Ruecker, N.J., et Neumann, N.F. (2010). « Source water protection: How well do traditional water quality indicators correlate with pathogen occurrence? », Water Quality Technology Conference and Exposition 2009, Seattle, WA, USA, November 15-19, 2009, p. 3710-3720.

    2010 - Consulter les détails de la publication

  13. Khan, I.U.H. et Edge, T.A. (2010). « Novel multiplex PCR-based assay developed for the detection and identification of Enterococcus faecalis and Enterococcus faecium from environmental sources. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 60th Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Hamilton, ON, Canada, June 14-17, 2010.

    2010 - Consulter les détails de la publication

  14. Nowak, E.K., Khan, I.U.H., et Edge, T.A. (2010). « Identification of Aeromonas species in water samples. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 60th Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Hamilton, ON, Canada, June 14-17, 2010.

    2010 - Consulter les détails de la publication

  15. Khan, I.U.H., Nowak, E.K., et Edge, T.A. (2010). « Thermophilic Campylobacters and Lake Ontario beaches. EnvioAnalysis2010. », 8th Biennial International Conference on Monitoring and Measurement of the Environment, Toronto, ON, Canada, May 10-12, 2010.

    2010 - Consulter les détails de la publication

  16. Khan, I.U.H., Edge, T.A., Booty, B., Moore, L., Neumann, N.F., Payment, P., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2009). « Occurrence of waterborne pathogens at offshore drinking water intakes in Lake Ontario. », 2009 Lake Ontario Collaborative Study meeting, Kingston, ON, Canada, September 23, 2009.

    2009 - Consulter les détails de la publication

  17. Khan, I.U.H., Loughborough, A., et Edge, T.A. (2009). « Effect of incubation temperature on the isolation of thermophilic Campylobacter species from agricultural water samples. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 59th Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Concordia University, Montréal, QC, Canada, June 15-18, 2009.

    2009 - Consulter les détails de la publication

  18. Loughborough, A., Khan, I.U.H., Edge, T.A., Booty, B., Locas, A., Moore, L., Neumann, N.F., Payment, P., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2009). « Development and evaluation of a novel DNA-based detection method for Enterococcus species in Lake Ontario based on the 16S-23S rRNA Internal Transcribed Spacer (ITS) region gene. », 44th Central Canadian Symposium on Water Quality Research, Canada Centre for Inland Waters (CCIW), Burlington, ON, Canada, February 23-24, 2009.

    2009 - Consulter les détails de la publication

  19. Khan, I.U.H., Loughborough, A., et Edge, T.A. (2009). « Impact of weather and temperature on the occurrence of thermophilic Campylobacters at Lake Ontario beaches. », 44th Central Canadian Symposium on Water Quality Research, Canada Centre for Inland Waters (CCIW), Burlington, ON, Canada, February 23-24, 2009.

    2009 - Consulter les détails de la publication

  20. Khan, I.U.H., Edge, T.A., Loughborough, A., Booty, B., Locas, A., Moore, L., Neumann, N.F., Payment, P., Yerubandi, R., et Watson, S.B. (2009). « Occurrence of thermophilic campylobacters in Lake Ontario. », 109th General Meeting of American Society for Microbiology, Philadelphia, PA, USA, May 17-21, 2009.

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Contact

Installation de recherche

Centre de recherche et de développement d'Ottawa
960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Expertise

Agriculture›Productivité des écosystèmes agricoles et santé
Environnement›Eau›Science des écosystèmes aquatiques
Sciences aquatiques›Écologie et écosystèmes›Eau douce›Biodiversité

Affiliations

  • Membre, American Society for Microbiology
  • Membre, la Société canadienne des microbiologistes
  • Membre, du Collège canadien des microbiologistes
  • Membre, Association canadienne sur la qualité de l’eau

Langue

Anglais

Autres langues

Ourdou, pendjabi, allemand