Izhar Khan, Ph.D.

Chercheur scientifique

Mes travaux dans le domaine de la santé environnementale, de la biodiversité et des bioressources portent sur l’élaboration de méthodes quantitatives de pointe permettant de détecter et d’identifier rapidement et facilement les agents anthropopathogènes et zoopathogènes d’origine hydrique ou alimentaire, et ce, afin de déterminer d’où provient la pollution fécale dans différentes niches environnementales. En outre, j'ai travaillé sur la classification taxonomique de bactéries telles que les genres Acinetobacter, Campylobacter et Arcobacter et j'étudie leur pathogénicité et leur résistance aux antibiotiques chez l'homme et les animaux à l'aide du séquençage de nouvelle génération afin de fournir des informations sur la diversité génétique et la relation évolutive entre les espèces et souches.

Recherche et / ou projets en cours

  • Effets des pratiques agricoles et des facteurs environnementaux sur la répartition et la diversité des bactéries pathogènes d’origine hydrique dans les bassins hydrographiques agricoles.
  • Mise au point d’outils moléculaires de pointe pour la détection et l’identification rapides des agents pathogènes microaérophiles.
  • Épreuve de PCR quantitative en temps réel pour la détection et la quantification des bactéries et des virus pathogènes pour l’humain et l’animal provenant de diverses sources environnementales.
  • Détection et caractérisation moléculaires d’agents pathogènes émergents d’origine hydrique et d’indicateurs microbiens de la qualité de l’eau dans les bassins hydrographiques agricoles et urbains.
  • Caractérisation génotypique des agents pathogènes par séquençage de l’ADN, électrophorèse en champ pulsé et analyse du polymorphisme des sites de restriction.

Énoncés de recherches/projets

1. Solidifier la compétitivité et la durabilité du secteur agricole et agroalimentaire canadien.

2. Faire la promotion de l’innovation et d’un environnement sain en favorisant les priorités qui suivent, et ce, afin d’obtenir la meilleure information scientifique possible en vue de décisions en matière de politiques et de réglementation :

       i). accroître la performance environnementale du système agricole canadien;

       ii). améliorer la performance environnementale et la durabilité des systèmes de production de porc ou de produits laitiers;

       iii). améliorer la qualité des aliments et la salubrité du système alimentaire;

       iv). améliorer l’identification des ravageurs des cultures et des organismes bénéfiques, et mieux comprendre leur cycle biologique;

       v). réduire la dégradation chimique, biologique et physique des sols et en maintenir la santé  en améliorant les pratiques de gestion des  productions agricoles et du fumier;

       vi). déterminer quelles pratiques de gestion bénéfiques permettent de limiter les risques de contamination de l’eau, des sols et de l’air.

Prix et études

Doctorat, Université Justus-Liebig de Giessen (Allemagne)

Maîtrise en sciences, University of Agriculture Faisalabad (Pakistan)

Doctorat en médecine vétérinaire, University of Agriculture Faisalabad (Pakistan)

Expérience et / ou de travail international

  • Spécialiste des sciences physiques (PC-02), Environnement Canada – Direction des sciences et de la technologie de l’eau – Microbiologie, Centre canadien des eaux intérieures (CCEI), Burlington (Ontario).

  • Programme de bourses de recherche scientifique du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada (CRSNG) dans les laboratoires du gouvernement canadien, Environnement Canada – CCEI, Burlington (Ontario).

  • Conseiller en recherche, Environnement Canada, CCEI, Burlington (Ontario).

  • Chercheur-boursier, University of Cincinnati (Ohio, États-Unis).

  • Assistant de recherche, Université Justus-Liebig de Giessen (Allemagne).

  • Vétérinaire, Livestock and Poultry Department (Balochistan, Pakistan).

Principales publications

  1. Brazeau, K., Cloutier, M., et Khan, I.U.H. (2014). « Development of quantitative real-time PCR-based assays for the detection and identification of human and animal viruses in environmental matrices. », Biotechnology Poster Competition, La Cité Collégiale, Ottawa, ON, Canada, April 26, 2014. (Affiche)

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  2. Mazzola, L.G., Khan, I.U.H., et Vierula, J. (2014). « Comparative analysis of three DNA extraction kits and PCR assays for purification and identification of fungal DNA from agricultural water. », Biology Poster Competition, Carleton University, Ottawa, ON, Canada, April 10, 2014. (Affiche)

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  3. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequence of Arcobacter cibarius Strain LMG21996{SUP}T{/SUP} isolated from broiler carcasses. », Genome Announcements, 2(1), p. e00034-14. doi : 10.1128/genomeA.00034-14

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  4. Khan, I.U.H., Cloutier, M., Topp, E., Lapen, D.R., Lévesque, C.A., Edge, T.A., Tambong, J.T., Talbot, G., et Wilkes, G.A. (2014). « Quantitative Detection and Identification of Arcobacter, Campylobacter and Helicobacter Species in a Canadian Agricultural Watershed. », XVIth International Congress of Virology - International Union of Microbiological Societies (IUMS 2014), July 27 - August 1, 2014, Montréal, Québec, Canada, July 27-August 1, 2014.

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  5. Khan, I.U.H., Gannon, V.P.J., Jokinen, C.C., Kent, R., Koning, W., Lapen, D.R., Medeiros, D.T., Miller, J.J., Neumann, N.F., Phillips, R., Schreier, H., Topp, E., van Bochove, É., Wilkes, G.A., et Edge, T.A. (2014). « A National Investigation of the Prevalence and Diversity of Thermophilic Campylobacter Species in Agricultural Watersheds in Canada », Water Research, 61, p. 243-252. doi : 10.1016/j.watres.2014.05.027

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  6. Ryu, H., Elk, M., Khan, I.U.H., Harwood, V.J., Molina Casanova, A., Molina, M., Edge, T.A., et Santo Domingoa, J. (2014). « Comparison of two poultry litter qPCR assays targeting the 16S rRNA gene of Brevibacterium sp. », Water Research, 48, p. 613-621. doi : 10.1016/j.watres.2013.10.015

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  7. Adam, Z., Tambong, J.T., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Chen, W., Bromfield, E.S.P., Khan, I.U.H., et Xu, R. (2014). « Draft Genome Sequence of Pantoea ananatis Strain LMG 2665T, a Bacterial Pathogen of Pineapple Fruitlets. », Genome Announcements, 2(3: e00489-14). doi : 10.1128/genomeA.00489-14

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  8. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequences of two Arcobacter strains isolated from human feces. », Genome Announcements, 2(2 e00113-14). doi : 10.1128/genomeA.00113-14

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  9. Wilkes, G.A., Brassard, J., Edge, T.A., Gannon, V.P.J., Gottschall, N., Jokinen, C.C., Jones, T.H., Khan, I.U.H., Marti, R., Sunohara, M., Topp, E., et Lapen, D.R. (2014). « Long-term monitoring of waterborne pathogens and microbial source tracking markers in paired-agricultural watersheds under controlled and conventional tile drainage management. », Applied and Environmental Microbiology, 80(12), p. 3708-3720. doi : 10.1128/AEM.00254-14

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  10. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Tambong, J.T., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequences of three Arcobacter strains of pig and dairy cattle manure origin. », Genome Announcements, 2(3:e00377-14). doi : 10.1128/genomeA.00377-14

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  11. Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Kaneza, C.A., Laprade, N., Topp, E., Guylaine, T., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Development of genus-specific PCR assay for rapid identification of Arcobacter species: Optimization of PCR Primers and Conditions, and Restriction Pattern Analysis. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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  12. Kaneza, C.A., Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Laprade, N., Topp, E., Guylaine, T., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Identification and detection of Arcobacter spp. From water and fecal matter using genus- and species-specific PCR assays. », La Cité Collégiale, Ottawa, ON, Canada, April 26, 2013.

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  13. Léveillée, W.J., Kaneza, C.A., Léveillée, K., Talbot, G., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Optimization of multiplex PCR assays for the detection of virulence genes in Arcobacter species isolated from fecal samples. », 63rd Annual Conference of the Canadian Society of Microbiologists, Carleton University, Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013, Abstract AE86.

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  14. Khan, I.U.H., Cloutier, M., Edge, T.A., Schellhorn, H.E., Gupta, R.S., Laprade, N., Topp, E., Guylaine, T., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Wilkes, G.A., Nowak, E.K., et Hill, S. (2013). « A comparative study on the prevalence of thermophilic Campylobacter spp. In agricultural and recreational waters. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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  15. Hamelin, M-A., Cloutier, M., et Khan, I.U.H. (2013). « Detection and identification of thermophilic Campylobacter species in agricultural watershed in Ontario. », La Cité Collégiale, Ottawa, ON, Canada, April 26, 2013.

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  16. Whiteduck-Leveillee, K., Laprade, N., Whiteduck-Leveillee, J., Topp, E., Kaneza, C.A., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Guylaine, T., Wilkes, G.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Antimicrobial resistance profiling of Arcobacter butzleri isolated from a Canadian agricultural watershed. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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  17. Léveillée, W.J., Kaneza, C.A., Léveillée, K., Talbot, G., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Optimization of a genus-specific PCR assay and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis for rapid detection. », 63rd Annual Conference of the Canadian Society of Microbiologists, Carleton University, Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013, Abstract AE88.

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  18. Kaneza, C.A., Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Laprade, N., Topp, E., Guylaine, T., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Identification and detection of Arcobacter spp. from water and fecal matter using genus- and species-specific PCR assays. », La Cité Collégiale, Ottawa, ON, Canada, April 26, 2013. (Affiche)

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  19. Laprade, N., Whiteduck-Léveillée, J., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Tambong, J.T., Topp, E., Lapen, D.R., Wilkes, G.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Detection of virulence, toxin and tet(O) resistant genes in thermophilic Campylobacter species using multiplex PCR assays. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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  20. Whiteduck-Leveillee, J., Whiteduck-Leveillee, K., Kaneza, C.A., Cloutier, M., Laprade, N., Topp, E., Guylaine, T., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Lévesque, C.A., et Khan, I.U.H. (2013). « Multiplex PCR assay for the detection and identification of virulent genes in Arcobacter species. », Canadian Society of Microbiologists (CSM) 63rd Annual Conference / Conférence annuelle de la Société Canadienne des Microbiologistes (SCM), Ottawa, ON, Canada, June 17-20, 2013.

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Installation de recherche

960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Affiliations

  • Membre, American Society for Microbiology
  • Membre, la Société canadienne des microbiologistes
  • Membre, du Collège canadien des microbiologistes
  • Membre, Association canadienne sur la qualité de l’eau

Language

Anglais

Other languages

Ourdou, pendjabi, allemand