Hezhao Ji

Image Sarah London
Chercheur scientifique & Responsable de la Division de la génétique virale

Recherche ciblée sur la pharmacorésistance du VIH et l’épidémiologie moléculaire

Recherche et / ou projets en cours

Les travaux du Dr Ji portent sur la pharmacorésistance du VIH, la génétique du VIH, l’évolution virale du VIH, l’épidémiologie moléculaire du VIH et le séquençage de nouvelle génération.

Énoncés de recherches/projets

  • Conception et mise en œuvre de technologies d’analyse de la pharmacorésistance du VIH fondées sur le séquençage de nouvelle génération (SNG)
  • Élaboration d’un protocole universel de séquençage du génome complet pour le VHC et le VIH basé sur l’enrichissement de la capture oligonucléotidique et le séquençage de nouvelle génération
  • Révolution des stratégies de caractérisation virale et moléculaire pour améliorer l’étude et la surveillance des éclosions de maladies virales dans l’ère du séquençage de nouvelle génération
  • Principal initiateur et président du comité d’organisation du symposium international sur les technologies d’analyse de la pharmacorésistance du VIH fondées sur le SNG depuis 2017
    • Contribue de manière significative à la normalisation et à l’opérationnalisation de ces essais pour les analyses en laboratoire de la pharmacorésistance du VIH à des fins de recherche, de surveillance et de prise en charge des patients

Activités professionnelles / intérêts

A encadré des étudiants des cycles supérieurs, des étudiants inscrits à un programme d’enseignement coopératif et des boursiers de recherches postdoctorales.

Prix et études

Éducation

Doctorat en microbiologie médicale et en maladies infectieuses de l’Université du Manitoba (2007)

Maîtrise en immunologie médicale de l’Université médicale de Hebei (1996)

Doctorat en médecine du Collège médical de Zhangjiakou (actuellement la Faculté de médecine de l’Université de North Hebei) (1993)

Prix

Prix de l’excellence scientifique de la Direction générale de la prévention et du contrôle des maladies infectieuses de l’ASPC (2019)

 

Expérience et / ou de travail international

Membre de la Société internationale sur le SIDA

Membre du Réseau mondial de l’OMS sur la pharmacorésistance du VIH et du « Groupe de travail sur la recherche et l’innovation »

A organisé trois ateliers internationaux de formation (en 2015, 2016 et 2017) sur les technologies de pharmacorésistance du VIH fondées sur le SNG. Des personnes travaillant dans des laboratoires de référence régionale ou nationale en matière de pharmacorésistance du VIH, basés au Brésil, à Porto Rico (États-Unis), au Chili, en Martinique, en Argentine, en Colombie, au Panama et en Ouganda y ont participé. 

A initié et présidé le premier (2018) et le deuxième (2019) symposium international sur l’analyse de la pharmacorésistance du VIH fondée sur le SNG, qui s’est tenu à Winnipeg, au Canada, et a réuni des experts délégués du monde entier.

Principales publications

Marinier E, Enns E, Tran C, Fogel M, Peters C, Kidwai A, Ji H, and Van Domselaar G. quasitools: A collection of tools for viral quasispecies analysis. BioRxiv, August 2019.

https://doi.org/10.1101/733238

Taylor, T., Lee, E.R., Nykoluk, M., (...), Brooks, J., Ji, H.  A MiSeq-HyDRA platform for enhanced HIV drug resistance genotyping and surveillance. 2019 Scientific Reports, 9(1),8970.

https://doi.org/10.1038/s41598-019-45328-3

Ji, H., Enns, E., Brumme, C.J., (...), Kantor, R., Noguera-Julian, M. Bioinformatic data processing pipelines in support of next-generation sequencing-based HIV drug resistance testing: the Winnipeg Consensus. 2018 Journal of the International AIDS Society, 21(10),e25193.

https://doi.org/10.1002/jia2.25193

Liu, C.C., Ji, H. PCR amplification strategies towards full-length HIV-1 genome sequencing. 2018 Current HIV Research, 16(2), pp. 98-105. 

https://doi.org/10.2174/1570162X16666180626152252

Ji, H., Patterson, A., Taylor, T., (...), Brooks, J., Sandstrom, P. Prevalence of primary drug resistance against HIV-1 integrase inhibitors in Canada. 2018 Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes, 78(1), pp. E1-E3. 

https://doi.org/10.1097/QAI.0000000000001649

Gupta, S., Taylor, T., Patterson, A., (...), Van Domselaar, G., Ji, H.  A robust PCR protocol for HIV drug resistance testing on low-level viremia samples. 2017 BioMed Research International, 2017.

https://doi.org/10.1155/2017/4979252

Avila-Rios S, Garcia-Morales C, Matias-Florentino M, Romero-Mora KA, Tapia-Trejo D, Quiroz-Morales SV, Ji H, Sandstrom P, Casillas-Rodriguez J, Sierra-Madero J, Leon-Juarez EA, Magis-Rodriguez C, Uribe-Zuñiga P, Reyes-Terán G. HIV pre-treatment drug resistance in Mexico and its impact on first-line antiretroviral treatment effectiveness: A nationally representative 2015 World Health Organization survey using Sanger and next generation sequencing. Lancet HIV. 3(12) e579–e591, December 2016.

https://doi.org/10.1016/S2352-3018(16)30119-9

Hora B, Keating SM, Chen Y, Sanchez AM, Sabino E, Hunt G, Hackett J, Swanson P, Hewlett I, Ragupathy V, Vemula SV, Zeng P, Tee KK, Chow WZ, Ji H, Sandstrom P, Denny TN, Busch MP and Gao F. Genetic characterization of a panel of diverse HIV-1 isolates at seven international sites. PLoS One, 11(6) :e0157340.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0157340

Ji, H., Kozak, R.A., Biondi, M.J., (...), Sandstrom, P., Brooks, J. Next generation sequencing of the hepatitis C virus NS5B gene reveals potential novel S282 drug resistance mutations. 2015 Virology, 477, pp. 1-9. 

https://doi.org/10.1016/j.virol.2014.12.037   

Ji, H., Li, Y., Liang, B., (...), Sandstrom, P., Brooks, J. Pyrosequencing Dried Blood Spots Reveals Differences in HIV Drug Resistance between Treatment Naïve and Experienced Patients. 2013 PLoS ONE, 8(2),e56170.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0056170

Ji H, Liang B, Li Y, Van Domselaar G, Graham M, Tyler S, Merks H, Sandstrom P and Brooks J. Low abundance drug resistance variants in transmitted HIV drug resistance surveillance specimens identified using tagged pooled pyrosequencing. J Virol Methods 187 (2013) 314– 320.

https://doi.org/10.1016/j.jviromet.2012.10.018

Ji H, Li Y, Graham M, Liang B, Pilon R, Tyson S, Peters G, Tyler S, Merks H, Bertagnolio S, Luis Soto-Ramirez L, Sandstrom P and Brooks J. Next Generation Sequencing of Dried Blood Spot Specimens: A Novel Approach to HIV Drug Resistance Surveillance. Antivir Ther 2011;16(6):871-8

https://doi.org/10.3851/IMP1839

Ji H, Massé N, Tyler S, Liang B, Merks H, Graham M, Sandstrom P and Brooks B. HIV Drug Resistance Surveillance Using Pooled Pyrosequencing. PLoS One  Feb 2010. 5(2):e9263.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009263

 

Installation de recherche

1015 Arlington Street
Winnipeg, MB R3E 3M4
Canada

Affiliations

Professeur associé au Département de microbiologie médicale et des maladies infectieuses de la Faculté de sciences de la santé Rady de l’Université du Manitoba

 

Language

Anglais