Hai D.T. Nguyen, Ph.D.

Chercheur scientifique
Agriculture et Agroalimentaire Canada
960 Carling Ave, Ottawa, ON, Canada

Recherche et / ou projets en cours

J'étudie la taxonomie et la génomique des champignons zoosporiques, particulièrement ceux qui sont important pour l'agriculture. En ce moment, je travaille sur Synchytrium endobioticum et les espèces de Pythium.

Énoncés de recherches/projets

  • Développement de nouveaux méthodes de détection moléculaire et des outils en bioinformatiques
  • Séquençage génomique
  • Résoudre les problèmes en taxonomie
  • Identification des espèces et la description de nouvelles espèces

Prix et études

  • Doctorat, Biologie, Université d'Ottawa, 2015
  • Maîtrise en science, Microbiologie et Immunologie, Université d'Ottawa, 2011
  • Baccalauréat en science, Biologie (cellulaire et moléculaire), Université d'Ottawa, 2008

Liens additionnels

Google Scholar

LinkedIn

ResearchGate

Key publications

  1. van de Vossenberg, B.T.L.H., van der Lee, T.A.J., Nguyen, H.D.T. (2020). The 2019 Potato Wart Disease workshop: shared needs and future research directions. EPPO Bulletin, [online] 50(1), 170-176. http://dx.doi.org/10.1111/epp.12638

    2020 - Consulter les détails de la publication

  2. Bromfield, E.S.P., Cloutier, S., Nguyen, H.D.T. (2020). Description and complete genome sequences of bradyrhizobium symbiodeficiens sp. Nov., a non-symbiotic bacterium associated with legumes native to Canada. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM), [online] 70(1), 442-449. http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.003772

    2020 - Consulter les détails de la publication

  3. van de Vossenberg, B.T.L.H., Warris, S., Nguyen, H.D.T., van Gent-Pelzer, M.P.E., Joly, D.L., van de Geest, H.C., Bonants, P.J.M., Smith, D.S., Lévesque, C.A., van der Lee, T.A.J. (2019). Comparative genomics of chytrid fungi reveal insights into the obligate biotrophic and pathogenic lifestyle of Synchytrium endobioticum. Scientific Reports, [online] 9(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-019-45128-9

    2019 - Consulter les détails de la publication

  4. Tremblay, É. D., D. Shearlaw, H. D. T. Nguyen, G. J. Bilodeau and S. Hambleton. 2019. Laboratory testing of qPCR assays designed in silico reveal promising results to rapidly identify phytopathogenic Tilletia species. In Plant Canada 2019 meeting. July 7-10 2019, Guelph, Ontario, Canada. (Poster).

    2019 - Consulter les détails de la publication

  5. Bromfield, E.S.P., Cloutier, S., Nguyen, H.D.T. (2019). Description and complete genome sequence of bradyrhizobium amphicarpaeae sp. Nov., harbouring photosystem and nitrogenfixation genes. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM), [online] 69(9), 2841-2848. http://dx.doi.org/10.1099/ijsem.0.003569

    2019 - Consulter les détails de la publication

  6. Wingfield, B.D., Liu, M., Nguyen, H.D.T., Lane, F.A., Morgan, S.W., De Vos, L., Markus Wilken, P., Duong, T.A., Aylward, J., Coetzee, M.P.A., Dadej, K., De Beer, Z.W., Findlay, W., Havenga, M., Kolarík, M., Menzies, J.G., Naidoo, K., Pochopski, O., Shoukouhi, P., Santana, Q.C., Seifert, K.A., Soal, N., Steenkamp, E.T., Tatham, C.T., van der Nest, M.A., Wingfield, M.J. (2018). Nine draft genome sequences of Claviceps purpurea s.lat., including C. arundinis, C. humidiphila, and C. cf. spartinae, pseudomolecules for the pitch canker pathogen Fusarium circinatum, draft genome of Davidsoniella eucalypti, Grosmannia galeiformis, Quambalaria eucalypti, and Teratosphaeria destructans. IMA Fungus, [online] 9(2), 401-418. http://dx.doi.org/10.5598/imafungus.2018.09.02.10

    2018 - Consulter les détails de la publication

  7. Nguyen, H.D.T., Cloutier, S., Bromfield, E.S.P. (2018). Complete genome sequence of bradyrhizobium ottawaense OO99 T , an efficient nitrogen-fixing symbiont of soybean. Microbiology Resource Announcements, [online] 7(21), http://dx.doi.org/10.1128/MRA.01477-18

    2018 - Consulter les détails de la publication

  8. van de Vossenberg, B.T.L.H., Brankovics, B., Nguyen, H.D.T., van Gent-Pelzer, M.P.E., Smith, D., Dadej, K., Przetakiewicz, J., Kreuze, J.F., Boerma, M., van Leeuwen, G.C.M., André Lévesque, C., van der Lee, T.A.J. (2018). The linear mitochondrial genome of the quarantine chytrid Synchytrium endobioticum; insights into the evolution and recent history of an obligate biotrophic plant pathogen. BMC Evolutionary Biology, [online] 18(1), 136. http://dx.doi.org/10.1186/s12862-018-1246-6

    2018 - Consulter les détails de la publication

  9. Díaz-Valderrama, J.R., Nguyen, H.D.T., Aime, M.C. (2017). Wallemia peruviensis sp. nov., a new xerophilic fungus from an agricultural setting in South America. Extremophiles, [online] 21(6), 1017-1025. http://dx.doi.org/10.1007/s00792-017-0960-0

    2017 - Consulter les détails de la publication

  10. Nguyen, H.D.T., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Gräfenhan, T. (2016). Draft genome sequence of Alternaria alternata ATCC 34957. Genome Announcements, [online] 4(1), http://dx.doi.org/10.1128/genomeA.01554-15

    2016 - Consulter les détails de la publication

  11. Hirooka, Y., Tanney, J.B., Nguyen, H.D.T., Seifert, K.A. (2016). Xerotolerant fungi in house dust: Taxonomy of Spiromastix, Pseudospiromastix and Sigleria gen. nov. in Spiromastigaceae (Onygenales, Eurotiomycetes). Mycologia, [online] 108(1), 135-156. http://dx.doi.org/10.3852/15-065

    2016 - Consulter les détails de la publication

  12. Wingfield, B.D., Ambler, J.M., Coetzee, M.P.A., De Beer, Z.W., Duong, T.A., Joubert, F., Hammerbacher, A., McTaggart, A.R., Naidoo, K., Nguyen, H.D.T., Ponomareva, E., Santana, Q.S., Seifert, K.A., Steenkamp, E.T., Trollip, C., van der Nest, M.A., Visagie, C.M., Wilken, P.M., Wingfield, M.J., et Yilmaz, N. (2016). « Draft genome sequences of Armillaria fuscipes, Ceratocystiopsis minuta, Ceratocystis adiposa, Endoconidiophora laricicola, E. polonica and Penicillium freii DAOMC 242723. », IMA Fungus, 7(1), p. 217-227. doi : 10.5598/imafungus.2016.07.01.11

    2016 - Consulter les détails de la publication

  13. Pratibha, J., Nguyen, H.D.T., Mel'nik, V.A., Bhat, D.J., White, G.P., et Seifert, K.A. (2014). « Lectotypification, epitypification, and molecular phylogeny of the synnematous hyphomycete Pseudogliophragma indicum, the second genus in the Wiesneriomycetaceae. », Mycoscience, 56(4), p. 387–395. doi : 10.1016/j.myc.2014.12.002

    2015 - Consulter les détails de la publication

  14. Jančič, S., Nguyen, H.D.T., Frisvad, J.C., Zalar, P., Schroers, H.-J., Seifert, K.A., et Gunde-Cimerman, N. (2015). « A Taxonomic Revision of the Wallemia sebi Species Complex. », PLoS ONE, p. 1-25. doi : 10.1371/journal.pone.0125933

    2015 - Consulter les détails de la publication

  15. Nguyen, H.D.T., Jančič, S., Meijer, M., Tanney, J.B., Zalar, P., Gunde-Cimerman, N., et Seifert, K.A. (2015). « Application of the phylogenetic species concept to wallemia sebi from house dust and indoor air revealed by multi-locus genealogical concordance. », PLoS ONE, 10(3: Article number e0120894). doi : 10.1371/journal.pone.0120894

    2015 - Consulter les détails de la publication

  16. Nguyen, H.D.T., Chabot, D., Hirooka, Y., Roberson, R.W., et Seifert, K.A. (2015). « Basidioascus undulatus: Genome, origins, and sexuality. », IMA Fungus, 6(1), p. 215-231. doi : 10.5598/imafungus.2015.06.01.14

    2015 - Consulter les détails de la publication

  17. Wingfield, B.D., Barnes, I., De Beer, Z.W., De Vos, L., Duong, T.A., Kanzi, A.M., Naidoo, K., Nguyen, H.D.T., Santana, Q.C., Sayari, M., Seifert, K.A., Steenkamp, E.T., Trollip, C., van der Merwe, N.A., van der Nest, M.A., Wilken, P.M., et Wingfield, M.J. (2015). « Draft genome sequences of Ceratocystis eucalypticola, Chrysoporthe cubensis, C. deuterocubensis, Davidsoniella virescens, Fusarium temperatum, Graphilbum fragrans, Penicillium nordicum, and Thielaviopsis musarum. », IMA Fungus, 6(2), p. 493-506. doi : 10.5598/imafungus.2015.06.02.13

    2015 - Consulter les détails de la publication

  18. Nguyen, H.D.T., Tanney, J.B., Chabot, D., Nickerson, N.L., et Seifert, K.A. (2014). « Paratritirachium curvibasidium, a new heat-resistant basidiomycete from flare pit soils in Alberta, Canada. », Mycological Progress, 13(3), p. 575-587. doi : 10.1007/s11557-013-0941-3

    2014 - Consulter les détails de la publication

  19. Nguyen, H.D.T., Nickerson, N.L., et Seifert, K.A. (2013). « Basidioascus and Geminibasidium: a new lineage of heat resistant and xerotolerant basidiomycetes », Mycologia, 105(5), p. 1231-1250. doi : 10.3852/12-351

    2013 - Consulter les détails de la publication

  20. Nguyen, H.D.T. et Seifert, K.A. (2008). « Description and DNA barcoding of three new species of Leohumicola from South Africa and the United States. », Persoonia, 21, p. 57-69. doi : 10.3767/003158508X361334

    2008 - Consulter les détails de la publication

Contact

Installation de recherche

Centre de recherche et de développement d'Ottawa
960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Expertise

Champignons›Génomique
Champignons›Systématique

Language

Anglais