Ed Topp, Ph.D.

Directeur de Recherche

Microbiologie et chimie de l'environnement

1391, rue Sandford, London, ON, Canada N5V 4T3

Recherche et / ou projets en cours

Évaluation et gestion des risques pour l'environnement et la santé humaine associés aux engrais organiques agricoles d'origine animale, avicole et humaine: devenir et impacts des produits pharmaceutiques, des agents pathogènes microbiens et des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les systèmes de production agricole.

Énoncés de recherches/projets

-Atténuer la résistance aux antimicrobiens dans les systèmes de production alimentaire.

-Initiative de recherche et développement en génomique sur la résistance aux antimicrobiens [GRDI-AMR]

Activités professionnelles / intérêts

Membre, Comité consultatif scientifique de l'Initiative de programmation conjointe sur la RAM (JPIAMR) (2019-)

Président, Comité d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens, les cultures et l'environnement (Rome, juin 2018)

Membre de la liste d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens d'origine alimentaire (2019-)

Membre du groupe de travail de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) concernant «Le rôle de l'environnement dans l'émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à travers la chaîne alimentaire» (2019-20)
Membre Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES, France) collectif d'expertise: «Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques et par les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques »(2019-2021)

Société canadienne des microbiologistes (Président 2010-2011)

Société canadienne des sciences du sol

American Society for Microbiology

Soil Science Society of America

International Society for Microbial Ecology

Society of Environmental Toxicology and Chemistry

Prix et études

Ph.D., Département de microbiologie, Université du Minnesota, États-Unis

M.Sc., Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

B.Sc. (Agriculture). Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

Élu Membre Correspondant de l'Académie d'Agriculture de France 2016

Prix d'excellence de la fonction publique du gouvernement du Canada pour contribution scientifique 2016

Prix Gold Harvest d'AAC pour la réussite professionnelle 2015

Prix d'excellence en recherche de l'Association des eaux et de l'environnement de l'Ontario 2014

Bourse d'études supérieures du CRSNG 1984

Bourse Busch, The Graduate School, Université du Minnesota 1984

Prix Walter M. Stewart, Faculté d'agriculture, Université McGill 1983

Liens additionnels

https://www.researchgate.net/profile/Edward_Topp

https://scholar.google.ca/citations?user=gERlCUQAAAAJ&hl=en

Principales publications

Khan, A.H., Topp, E., Scott, A., Sumarah, M.W., Macfie, S. M., et Ray, M.B. (2015). « Biodegradation of benzalkonium chlorides singly and in mixtures by a Pseudomonas sp. Isolated from returned activated sludge/ », Journal of Hazardous Materials, 299, p. 595-602. doi : 10.1016/j.jhazmat.2015.07.073
2015 - Consulter les détails de la publication
Brandt, K.K., Aamézquita, A., Backhaus, T., Boxall, A.B.A., Coors, A., Heberer, T., Lawrence, J.R., Lazorchak, J.R., Schönfeld, J., Snape, J.R., Zhu, Y.-G., et Topp, E. (2015). « Ecotoxicological assessment of antibiotics: A call for improved consideration of microorganisms. », Environment International, 85, p. 189-205. doi : 10.1016/j.envint.2015.09.013
2015 - Consulter les détails de la publication
Zhi, S., Li, Q., Yasui, Y., Edge, T.A., Topp, E., et Neumann, N.F. (2015). « Assessing host-specificity of Escherichia coli using a supervised learning logic-regression-based analysis of single nucleotide polymorphisms in intergenic regions. », Molecular Phylogenetics and Evolution, 92, p. 72-81. doi : 10.1016/j.ympev.2015.06.007
2015 - Consulter les détails de la publication
Frey, S.K., Topp, E., Khan, I.U.H., Ball, B., Edwards, M., Gottschall, N., Sunohara, M.D., et Lapen, D.R. (2015). « Quantitative Campylobacter spp., antibiotic resistance gene, and veterinary antibiotic movement to surface and ground water following manure application: Influences of Tile Drainage Control. », Science of the Total Environment, 532, p. 138-153. doi : 10.1016/j.scitotenv.2015.03.114
2015 - Consulter les détails de la publication
Holman, D.B., McAllister, T.A., Topp, E., Wright, A.-D.G., et Alexander, T.W. (2015). « The nasopharyngeal microbiota of feedlot cattle that develop bovine respiratory disease. », Veterinary Microbiology, 180(1-2), p. 90-95. doi : 10.1016/j.vetmic.2015.07.031
2015 - Consulter les détails de la publication
Etienne, D., Destas, M., Lyautey, E., Marti, R., Ruffaldi, P., Georges-Leroy, M., Dambrine, E., et Topp, E. (2015). « Two thousand–year reconstruction of livestock production intensity in France using sediment-archived fecal Bacteroidales and source-specific mitochondrial markers. », The Holocene, 25(9), p. 1384-1393. doi : 10.1177/0959683615585836
2015 - Consulter les détails de la publication
Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Cloutier, M., Tambong, J.T., Xu, R., Topp, E., Arts, M.T., Chao, J., Adam, Z., Lévesque, C.A., Lapen, D.R., Villemur, R., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2015). « Arcobacter lanthieri sp. nov., isolated from pig and dairy cattle manure. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM). doi : 10.1099/ijs.0.000318
2015 - Consulter les détails de la publication
Dhanani, A.S., Block, G.S., Dewar, K., Forgetta, V., Topp, E., Beiko, R.G., et Diarra, M.S. (2015). « Genomic comparison of non-typhoidal Salmonella enterica Serovars Typhimurium, Enteritidis, Heidelberg, Hadar and Kentucky isolates from broiler chickens. », PLoS ONE. doi : 10.1371/journal.pone.0128773
2015 - Consulter les détails de la publication
Jokinen, C.C., Koot, J.M., Cole, L., Desruisseau, A., Edge, T.A., Khan, I.U.H., Koning, W., Lapen, D.R., Pintar, K.D.M., Reid-Smith, R., Thomas, J.L., Topp, E., Wang, L.Y., Wilkes, G.A., Ziebell, K.A., van Bochove, É., et Gannon, V.P.J. (2015). « The distribution of Salmonella enterica serovars and subtypes in surface water from five agricultural regions across Canada. », Water Research, 76, p. 120-131. doi : 10.1016/j.watres.2015.02.038
2015 - Consulter les détails de la publication
Al-Rajab, A.J., Sabourin, L., Lapen, D.R., et Topp, E. (2015). « Dissipation of triclosan, triclocarban, carbamazepine and naproxen in agricultural soil following surface or sub-surface application of dewatered municipal biosolids. », Science of the Total Environment, 512-513, p. 480-488. doi : 10.1016/j.scitotenv.2015.01.075
2015 - Consulter les détails de la publication
Lawrence, J.R., Topp, E., Waiser, M.J., Tumber, V., Roy, J., Swerhone, G.D.W., Leavitt, P.R., Paule, A., et Korber, D.R. (2015). « Resilience and recovery: the effect of triclosan exposure timing during development, on the structure and function of river biofilm communities. », Aquatic Toxicol, 161, p. 253-266. doi : 10.1016/j.aquatox.2015.02.012
2015 - Consulter les détails de la publication
Caracciolo, A.B., Topp, E., et Grenni, P. (2015). « Pharmaceuticals in the environment: Biodegradation and effects on natural microbial communities. A Review. », Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 106, p. 25-36. doi : 10.1016/j.jpba.2014.11.040
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Konopka, M., Henry, H.A.L., Romain, M., et Topp, E. (2015). « Multi-year and short-term responses of soil ammonia-oxidizing prokaryotes to zinc bacitracin, monensin and ivermectin, singly or in combination. », Environmental Toxicology and Chemistry, 34(3), p. 618-625. doi : 10.1002/etc.2848
2015 - Consulter les détails de la publication
Barret, M., Gagnon, N., Morissette, B., Kalmokoff, M.L., Topp, E., Brooks, S.P.J., Matias, F., Neufeld, J.D., et Talbot, G. (2015). « Phylogenetic identification of methanogens assimilating acetate-derived carbon in dairy and swine manures. », Systematic and Applied Microbiology, 38(1), p. 56-66. doi : 10.1016/j.syapm.2014.11.006
2015 - Consulter les détails de la publication
Frey, S.K., Gottschall, N., Wilkes, G.A., Gregoire, D., Topp, E., Pintar, K.D.M., Sunohara, M.D., Romain, M., et Lapen, D.R. (2014). « Rainfall-Induced Runoff From Exposed Streambed Sediments: An Important Source of Water Pollution. », Journal of Environmental Quality, 44(1), p. 236-247. doi : 10.2134/jeq2014.03.0122
2015 - Consulter les détails de la publication
Ross, J. et Topp, E. (2015). « Abundance of antibiotic resistance genes in bacteriophage following soil fertilization with dairy manure or municipal biosolids, and evidence for potential transduction. », Applied and Environmental Microbiology, 81(22), p. 7905-7913. doi : 10.1128/AEM.02363-15
2015 - Consulter les détails de la publication
MacDonald, J., Doshi, K., Dussault, M., Hall, J.C., Holbrook, L., Jones, G., Kaldis, A., Klima, C.L., MacDonald, P., McAllister, T.A., McLean, M.D, Potter, A., Richman, A.S., Shearer, H., Yarosh, O., Yoo, H.S., Topp, E., et Menassa, R. (2015). « Bringing plant-based veterinary vaccines to market: Managing regulatory and commercial hurdles. », Biotechnology Advances. doi : 10.1016/j.biotechadv.2015.07.007
2015 - Consulter les détails de la publication
Que, Z., Seidou, O., Droste, R.L., Wilkes, G.A., Sunohara, M., Topp, E., et Lapen, D.R. (2015). « Using AnnAGNPS to Predict the Effects of Tile Drainage Control on Nutrient and Sediment Loads for a River Basin. », Journal of Environmental Quality, 44, p. 1-13. doi : 10.2134/jeq.2014.06.0246
2015 - Consulter les détails de la publication
Diarra, M.S., Diarrassouba, F., Proudfoot, J., Rempel, H., Topp, E., et Prichard, J. (2014). « Fate of antibiotic resistant enterococci during broiler chicken production. », 54th Annual Interscience Conference on Antimicrobial Agents and Chemotherapy (ICAAC) of American Society for Microbiology, Washington DC, USA, September 5-9, 2014.
2014 - Consulter les détails de la publication
Martin-Laurent, F., Marti, R., Waglechner, N., Wright, G.D., et Topp, E. (2014). « Draft genome sequence of the sulfonamide antibiotic-degrading Microbacterium sp. Strain C448. Genome Announcements. », Genome Announcements, 2(1), p. e01113-13. doi : 10.1128/genomeA.01113-13
2014 - Consulter les détails de la publication