Ed Topp, Ph.D.

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Directeur de Recherche

Microbiologie et chimie de l'environnement

    Recherche et / ou projets en cours

    Évaluation et gestion des risques pour l'environnement et la santé humaine associés aux engrais organiques agricoles d'origine animale, avicole et humaine: devenir et impacts des produits pharmaceutiques, des agents pathogènes microbiens et des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les systèmes de production agricole.

    Énoncés de recherches/projets

    -Atténuer la résistance aux antimicrobiens dans les systèmes de production alimentaire.

    -Initiative de recherche et développement en génomique sur la résistance aux antimicrobiens [GRDI-AMR]

    Activités professionnelles / intérêts

    Membre, Comité consultatif scientifique de l'Initiative de programmation conjointe sur la RAM (JPIAMR) (2019-)

    Président, Comité d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens, les cultures et l'environnement (Rome, juin 2018)

    Membre de la liste d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens d'origine alimentaire (2019-)

    Membre du groupe de travail de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) concernant «Le rôle de l'environnement dans l'émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à travers la chaîne alimentaire» (2019-20)
    Membre Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES, France) collectif d'expertise: «Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques et par les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques »(2019-2021)

    Société canadienne des microbiologistes (Président 2010-2011)

    Société canadienne des sciences du sol

    American Society for Microbiology

    Soil Science Society of America

    International Society for Microbial Ecology

    Society of Environmental Toxicology and Chemistry

    Prix et études

    Ph.D., Département de microbiologie, Université du Minnesota, États-Unis

    M.Sc., Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    B.Sc. (Agriculture). Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    Élu Membre Correspondant de l'Académie d'Agriculture de France 2016

    Prix d'excellence de la fonction publique du gouvernement du Canada pour contribution scientifique 2016

    Prix Gold Harvest d'AAC pour la réussite professionnelle 2015

    Prix d'excellence en recherche de l'Association des eaux et de l'environnement de l'Ontario 2014

    Bourse d'études supérieures du CRSNG 1984

    Bourse Busch, The Graduate School, Université du Minnesota 1984

    Prix Walter M. Stewart, Faculté d'agriculture, Université McGill 1983

    Principales publications

    1. Brandt, K.K., Aamézquita, A., Backhaus, T., Boxall, A.B.A., Coors, A., Heberer, T., Lawrence, J.R., Lazorchak, J.R., Schönfeld, J., Snape, J.R., Zhu, Y.-G., et Topp, E. (2015). « Ecotoxicological assessment of antibiotics: A call for improved consideration of microorganisms. », Environment International, 85, p. 189-205. doi : 10.1016/j.envint.2015.09.013

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    2. Frey, S.K., Topp, E., Khan, I.U.H., Ball, B., Edwards, M., Gottschall, N., Sunohara, M.D., et Lapen, D.R. (2015). « Quantitative Campylobacter spp., antibiotic resistance gene, and veterinary antibiotic movement to surface and ground water following manure application: Influences of Tile Drainage Control. », Science of the Total Environment, 532, p. 138-153. doi : 10.1016/j.scitotenv.2015.03.114

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    3. Zhi, S., Li, Q., Yasui, Y., Edge, T.A., Topp, E., et Neumann, N.F. (2015). « Assessing host-specificity of Escherichia coli using a supervised learning logic-regression-based analysis of single nucleotide polymorphisms in intergenic regions. », Molecular Phylogenetics and Evolution, 92, p. 72-81. doi : 10.1016/j.ympev.2015.06.007

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    4. Holman, D.B., McAllister, T.A., Topp, E., Wright, A.-D.G., et Alexander, T.W. (2015). « The nasopharyngeal microbiota of feedlot cattle that develop bovine respiratory disease. », Veterinary Microbiology, 180(1-2), p. 90-95. doi : 10.1016/j.vetmic.2015.07.031

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    5. Etienne, D., Destas, M., Lyautey, E., Marti, R., Ruffaldi, P., Georges-Leroy, M., Dambrine, E., et Topp, E. (2015). « Two thousand–year reconstruction of livestock production intensity in France using sediment-archived fecal Bacteroidales and source-specific mitochondrial markers. », The Holocene, 25(9), p. 1384-1393. doi : 10.1177/0959683615585836

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    6. Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Leveillee, J., Cloutier, M., Tambong, J.T., Xu, R., Topp, E., Arts, M.T., Chao, J., Adam, Z., Lévesque, C.A., Lapen, D.R., Villemur, R., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2015). « Arcobacter lanthieri sp. nov., isolated from pig and dairy cattle manure. », International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSEM). doi : 10.1099/ijs.0.000318

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    7. Dhanani, A.S., Block, G.S., Dewar, K., Forgetta, V., Topp, E., Beiko, R.G., et Diarra, M.S. (2015). « Genomic comparison of non-typhoidal Salmonella enterica Serovars Typhimurium, Enteritidis, Heidelberg, Hadar and Kentucky isolates from broiler chickens. », PLoS ONE. doi : 10.1371/journal.pone.0128773

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    8. Jokinen, C.C., Koot, J.M., Cole, L., Desruisseau, A., Edge, T.A., Khan, I.U.H., Koning, W., Lapen, D.R., Pintar, K.D.M., Reid-Smith, R., Thomas, J.L., Topp, E., Wang, L.Y., Wilkes, G.A., Ziebell, K.A., van Bochove, É., et Gannon, V.P.J. (2015). « The distribution of Salmonella enterica serovars and subtypes in surface water from five agricultural regions across Canada. », Water Research, 76, p. 120-131. doi : 10.1016/j.watres.2015.02.038

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    9. Al-Rajab, A.J., Sabourin, L., Lapen, D.R., et Topp, E. (2015). « Dissipation of triclosan, triclocarban, carbamazepine and naproxen in agricultural soil following surface or sub-surface application of dewatered municipal biosolids. », Science of the Total Environment, 512-513, p. 480-488. doi : 10.1016/j.scitotenv.2015.01.075

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    10. Lawrence, J.R., Topp, E., Waiser, M.J., Tumber, V., Roy, J., Swerhone, G.D.W., Leavitt, P.R., Paule, A., et Korber, D.R. (2015). « Resilience and recovery: the effect of triclosan exposure timing during development, on the structure and function of river biofilm communities. », Aquatic Toxicol, 161, p. 253-266. doi : 10.1016/j.aquatox.2015.02.012

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    11. Caracciolo, A.B., Topp, E., et Grenni, P. (2015). « Pharmaceuticals in the environment: Biodegradation and effects on natural microbial communities. A Review. », Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis, 106, p. 25-36. doi : 10.1016/j.jpba.2014.11.040

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    12. Konopka, M., Henry, H.A.L., Romain, M., et Topp, E. (2015). « Multi-year and short-term responses of soil ammonia-oxidizing prokaryotes to zinc bacitracin, monensin and ivermectin, singly or in combination. », Environmental Toxicology and Chemistry, 34(3), p. 618-625. doi : 10.1002/etc.2848

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    13. Barret, M., Gagnon, N., Morissette, B., Kalmokoff, M.L., Topp, E., Brooks, S.P.J., Matias, F., Neufeld, J.D., et Talbot, G. (2015). « Phylogenetic identification of methanogens assimilating acetate-derived carbon in dairy and swine manures. », Systematic and Applied Microbiology, 38(1), p. 56-66. doi : 10.1016/j.syapm.2014.11.006

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    14. Frey, S.K., Gottschall, N., Wilkes, G.A., Gregoire, D., Topp, E., Pintar, K.D.M., Sunohara, M.D., Romain, M., et Lapen, D.R. (2014). « Rainfall-Induced Runoff From Exposed Streambed Sediments: An Important Source of Water Pollution. », Journal of Environmental Quality, 44(1), p. 236-247. doi : 10.2134/jeq2014.03.0122

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    15. Ross, J. et Topp, E. (2015). « Abundance of antibiotic resistance genes in bacteriophage following soil fertilization with dairy manure or municipal biosolids, and evidence for potential transduction. », Applied and Environmental Microbiology, 81(22), p. 7905-7913. doi : 10.1128/AEM.02363-15

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    16. MacDonald, J., Doshi, K., Dussault, M., Hall, J.C., Holbrook, L., Jones, G., Kaldis, A., Klima, C.L., MacDonald, P., McAllister, T.A., McLean, M.D, Potter, A., Richman, A.S., Shearer, H., Yarosh, O., Yoo, H.S., Topp, E., et Menassa, R. (2015). « Bringing plant-based veterinary vaccines to market: Managing regulatory and commercial hurdles. », Biotechnology Advances. doi : 10.1016/j.biotechadv.2015.07.007

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    17. Que, Z., Seidou, O., Droste, R.L., Wilkes, G.A., Sunohara, M., Topp, E., et Lapen, D.R. (2015). « Using AnnAGNPS to Predict the Effects of Tile Drainage Control on Nutrient and Sediment Loads for a River Basin. », Journal of Environmental Quality, 44, p. 1-13. doi : 10.2134/jeq.2014.06.0246

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    18. Nadya, S., Allen, K.J., Johnson, R.P., Ziebell, K.A., Topp, E., Delaquis, P.J., et Bach, S.J. (2014). « A comparison of the presence of total Escherichia coli and Shiga-toxigenic E. coli in irrigation waters from an intensive agricultural region. », United Fresh 2014, Chicago, IL, USA, June 10-14, 2014, Abstract. (Affiche)

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    19. Adam, Z., Whiteduck-Leveillee, K., Cloutier, M., Chen, W., Lewis, C.T., Lévesque, C.A., Topp, E., Lapen, D.R., Tambong, J.T., Talbot, G., et Khan, I.U.H. (2014). « Draft genome sequence of Arcobacter cibarius Strain LMG21996{SUP}T{/SUP} isolated from broiler carcasses. », Genome Announcements, 2(1), p. e00034-14. doi : 10.1128/genomeA.00034-14

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    20. McKellar, R.C., Peréz Rodriguez, F., Harris, L.J., Moyne, A.-L., Blais, B., Topp, E., Bezanson, G.S., Bach, S.J., et Delaquis, P.J. (2014). « Evaluation of mathematical models to describe Escherichia coli O157:H7 decay on field-grown leafy vegetables. », Annual Meeting of the International Association for Food Protection (IAFP), Indianapolis, USA, August 3-6, 2014, Oral presentation. (Résumé)

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    Installation de recherche

    1391, rue Sandford
    London, ON N5V 4T3
    Canada

    Affiliations

    Adjoint, Université Western Ontario, Département de biologie.

    Faculté des études supérieures spéciales, Université de Guelph, Collège vétérinaire de l'Ontario, Département de pathobiologie

    Language

    Anglais
    Français