Ed Topp, Ph.D.

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Directeur de Recherche

Microbiologie et chimie de l'environnement

    Recherche et / ou projets en cours

    Évaluation et gestion des risques pour l'environnement et la santé humaine associés aux engrais organiques agricoles d'origine animale, avicole et humaine: devenir et impacts des produits pharmaceutiques, des agents pathogènes microbiens et des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les systèmes de production agricole.

    Énoncés de recherches/projets

    -Atténuer la résistance aux antimicrobiens dans les systèmes de production alimentaire.

    -Initiative de recherche et développement en génomique sur la résistance aux antimicrobiens [GRDI-AMR]

    Activités professionnelles / intérêts

    Membre, Comité consultatif scientifique de l'Initiative de programmation conjointe sur la RAM (JPIAMR) (2019-)

    Président, Comité d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens, les cultures et l'environnement (Rome, juin 2018)

    Membre de la liste d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens d'origine alimentaire (2019-)

    Membre du groupe de travail de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) concernant «Le rôle de l'environnement dans l'émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à travers la chaîne alimentaire» (2019-20)
    Membre Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES, France) collectif d'expertise: «Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques et par les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques »(2019-2021)

    Société canadienne des microbiologistes (Président 2010-2011)

    Société canadienne des sciences du sol

    American Society for Microbiology

    Soil Science Society of America

    International Society for Microbial Ecology

    Society of Environmental Toxicology and Chemistry

    Prix et études

    Ph.D., Département de microbiologie, Université du Minnesota, États-Unis

    M.Sc., Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    B.Sc. (Agriculture). Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    Élu Membre Correspondant de l'Académie d'Agriculture de France 2016

    Prix d'excellence de la fonction publique du gouvernement du Canada pour contribution scientifique 2016

    Prix Gold Harvest d'AAC pour la réussite professionnelle 2015

    Prix d'excellence en recherche de l'Association des eaux et de l'environnement de l'Ontario 2014

    Bourse d'études supérieures du CRSNG 1984

    Bourse Busch, The Graduate School, Université du Minnesota 1984

    Prix Walter M. Stewart, Faculté d'agriculture, Université McGill 1983

    Principales publications

    1. Dring, C., Devlin, J.F., Boag, G., Sunohara, M.D., Fitzgibbon, J., Topp, E., et Lapen, D.R. (2016). « Incentives and disincentives identified by producers and drainage contractors/experts on the adoption of controlled tile drainage in eastern Ontario, Canada. », Water Quality Research Journal of Canada, 51(1), p. 1-16. doi : 10.2166/wqrjc.2015.047

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    2. Whiteduck-Léveillée, J., Cloutier, M., Topp, E., Lapen, D.R., Talbot, G., Villemur, R., et Khan, I.U.H. (2016). « Development and Evaluation of Multiplex PCR Assays for Rapid Detection of Virulence-associated Genes in Arcobacter Species. », Journal of Microbiological Methods, 121, p. 59-65. doi : 10.1016/j.mimet.2015.12.017

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    3. Chen, J., Nadya, S., Allen, K.J., Johnson, R., Ziebell, K.A., Bach, S., Topp, E., et Delaquis, P.J. (2015). « Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from surface water in the Lower Mainland of British Columbia. », VTEC 2015, Boston, MA, USA, September 13-16, 2015. (Résumé)

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    4. Khan, I.U.H., Topp, E., Chen, W., Lapen, D.R., Lévesque, C.A., Pintar, K.D.M., Tambong, J.T., Talbot, G., et Wilkes, G.A. (2015). « Assessment of Zoonotic Pathogens in Agroecosystem. », Biodiversity, Bioresources and Collection Science Day, Ottawa Research and Development Center, Agriculture and Agri-Food Canada, Ottawa, ON, Canada, December 1-2, 2015. (Présentation)

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    5. Delaquis, P.J., Nadya, S., Chen, J., Allen, K.J., Johnson, R., Ziebell, K.A., Bach, S., et Topp, E. (2015). « Prevalence, phenotypic and genotypic characteristics of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from irrigation waters in a Canadian urban-agricultural landscape. », VTEC 2015, Boston, MA, USA, September 13-16, 2015. (Résumé)

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    6. Talbot, G., Yin, X., Service, C., Ziebell, K.A., Gagnon, N., Auffret, M., Topp, E., et Diarra, M.S. (2015). « Characterization of ceftiofur-resistant Escherichia coli isolated from dairy cattle manures. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015, AE37. (Affiche)

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    7. Islam, R., Yin, X., Lepp, D., Topp, E., et Diarra, M.S. (2015). « Comparative genomics of Escherichia coli isolated from soil fertilized with litter of chicken fed with or without tetracycline. », 2015 International Association of Food Protection (IAFP), Portland, Oregon, USA, July 25-28, 2015. (Résumé)

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    8. Fernando, E., Khan, I.U.H., Loewen, P., Lapen, D.R., Talbot, G., Topp, E., et Kumar, A. (2015). « Expressions and characterization of Acinetobacter spp. From Canadian Agricultural niches. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015, AE46PC. (Affiche)

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    9. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Topp, E., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. DRDC-RDDC-2015-C148. Final Close-Out Report. (Rapport)

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    10. Archambault, M., Boerlin, P., Campbell, J.M., Dumont, M., Hutchinson, J.J., Landals, D., McClure, J., McEwen, S.A., Prescott, J.F., Rubin, J., Slavic, D., Stemshorn, B., Skippon, W., Weese, S., Szkotnicki, J., et Topp, E. (2015). « Antibiotic stewardship’s golden moment: Resistance or change? », Canadian Veterinary Journal, 56(2), p. 115-119.

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    11. Delaquis, P.J., Nadya, S., Chen, J., Allen, K.J., Johnson, R.P., Ziebell, K.A., Bach, S.J., et Topp, E. (2015). « Prevalence, phenotypic and genotypic characteristics of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from irrigation waters in a Canadian urban-agricultural landscape. », VTEC 2015, Boston, MA, USA, September 13-16, 2015.

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    12. Fock-Chow-Tho, D., Topp, E., et Bissonnette, N. (2015). « Comparison of commercial DNA extraction and detection kits for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015. (Affiche)

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    13. Kolotilin, I., Topp, E., Cox, E., Devriendt, B., Conrad, U., Joensuu, J.J., Stöger, E., Warzecha, H., McAllister, T.A., McLean, M.D, Hall, J.C., et Menassa, R. (2015). « Plant-based solutions for veterinary immunotherapeutics and prophylactics. », BMC Veterinary Research, 45(1), p. 375. (Résumé)

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    14. Khan, I.U.H., Cloutier, M., Lapen, D.R., Topp, E., Wilkes, G.A., Jones, T., Brassard, J., Edge, T.A., et Talbot, G. (2015). « Quantitative detection and assessment of occurrence of human and animal viruses in agricultural aquatic environment. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015, S4-06. (Affiche)

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    15. Khan, I.U.H., Cloutier, M., Lapen, D.R., Topp, E., Wilkes, G.A., Jones, T.H., Brassard, J., Edge, T.A., et Talbot, G. (2015). « Quantitative detection and assessment of occurrence of human and animal viruses in agricultural aquatic environment. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015. (Affiche)

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    16. Diarra, M.S., Delaquis, P.J., Topp, E., McCallum, J.L., Ehret, D.L., Malouin, F., Gong, J., Brar, S.K., et Ross, K.A. (2015). Fruit Pomaces to Improve Immunity and Health of Organic Chickens. Project ID: AIP-CL02 – Organic Science Cluster II; Research Project Annual Report 2014-2015. AIP-CL02 – Organic Science Cluster II. (Rapport)

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    17. Chen, J., Nadya, S., Allen, K.J., Johnson, R.P., Ziebell, K.A., Zeibell, K., Bach, S.J., Topp, E., et Delaquis, P.J. (2015). « Phenotypic and genotypic characterization of antimicrobial resistance in Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from surface water in the Lower Mainland of British Columbia. », VTEC 2015, Boston, MA, USA, September 13-16, 2015.

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    18. Talbot, G., Auffret, M., Gagnon, N., Masse, L., Barret, M., et Topp, E. (2015). « Relationship between methanogenesis and transcriptional activity of Methanoculleus spp. In stored dairy cow and swine manures. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015, Invited speaker – short talk SAE-04 in the Applied and Environmental Microbiology Section.

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    19. Delaquis, P.J., Bach, S.J., Bezanson, G.S., Topp, E., McKellar, R., Blais, B., et Peréz Rodriguez, F. (2015). Phenotypic diversity in Escherichia coli O157:H7 and its influence on survival in leafy vegetables. Research Project Annual Report. AAFC Project ID J-000132. (Rapport)

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    20. Khan, A.H., Topp, E., Scott, A., Sumarah, M.W., Macfie, S. M., et Ray, M.B. (2015). « Biodegradation of benzalkonium chlorides singly and in mixtures by a Pseudomonas sp. Isolated from returned activated sludge/ », Journal of Hazardous Materials, 299, p. 595-602. doi : 10.1016/j.jhazmat.2015.07.073

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    Installation de recherche

    1391, rue Sandford
    London, ON N5V 4T3
    Canada

    Affiliations

    Adjoint, Université Western Ontario, Département de biologie.

    Faculté des études supérieures spéciales, Université de Guelph, Collège vétérinaire de l'Ontario, Département de pathobiologie

    Language

    Anglais
    Français