Ed Topp, Ph.D.

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Directeur de Recherche

Microbiologie et chimie de l'environnement

    Recherche et / ou projets en cours

    Évaluation et gestion des risques pour l'environnement et la santé humaine associés aux engrais organiques agricoles d'origine animale, avicole et humaine: devenir et impacts des produits pharmaceutiques, des agents pathogènes microbiens et des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les systèmes de production agricole.

    Énoncés de recherches/projets

    -Atténuer la résistance aux antimicrobiens dans les systèmes de production alimentaire.

    -Initiative de recherche et développement en génomique sur la résistance aux antimicrobiens [GRDI-AMR]

    Activités professionnelles / intérêts

    Membre, Comité consultatif scientifique de l'Initiative de programmation conjointe sur la RAM (JPIAMR) (2019-)

    Président, Comité d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens, les cultures et l'environnement (Rome, juin 2018)

    Membre de la liste d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens d'origine alimentaire (2019-)

    Membre du groupe de travail de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) concernant «Le rôle de l'environnement dans l'émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à travers la chaîne alimentaire» (2019-20)
    Membre Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES, France) collectif d'expertise: «Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques et par les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques »(2019-2021)

    Société canadienne des microbiologistes (Président 2010-2011)

    Société canadienne des sciences du sol

    American Society for Microbiology

    Soil Science Society of America

    International Society for Microbial Ecology

    Society of Environmental Toxicology and Chemistry

    Prix et études

    Ph.D., Département de microbiologie, Université du Minnesota, États-Unis

    M.Sc., Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    B.Sc. (Agriculture). Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

    Élu Membre Correspondant de l'Académie d'Agriculture de France 2016

    Prix d'excellence de la fonction publique du gouvernement du Canada pour contribution scientifique 2016

    Prix Gold Harvest d'AAC pour la réussite professionnelle 2015

    Prix d'excellence en recherche de l'Association des eaux et de l'environnement de l'Ontario 2014

    Bourse d'études supérieures du CRSNG 1984

    Bourse Busch, The Graduate School, Université du Minnesota 1984

    Prix Walter M. Stewart, Faculté d'agriculture, Université McGill 1983

    Principales publications

    1. Khan, I.U.H., Miltenburg, M.G., Cloutier, M., Islam, O., Lapen, D.R., Wilkes, G., Talbot, G., Topp, E. 2018. Quantitative assessment of agricultural water quality, human and animal feces for prevalence of Arcobacter faecis and A. lanthieri. ASM (American Society for Microbiology) Microbe 2018. June 07-11, 2018, Atlanta, GA.

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    2. Liu, L., Cloutier, M., Craiovan, E., Edwards, M., Frey, S.K., Gottschall, N., Lapen, D.R., Sunohara, M., Topp, E., Khan, I.U.H. (2018). Quantitative real-time PCR-based assessment of tile drainage management influences on bacterial pathogens in tile drainage and groundwater, 624 1586-1597. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2017.10.200

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    3. Jones, T.H., Brassard, J., Topp, E., Wilkes, G., Lapen, D.R. (2017). Waterborne viruses and F-specific coliphages in mixed-use watersheds: Microbial associations, host specificities, and affinities with environmental/land use factors, 83(3), http://dx.doi.org/10.1128/AEM.02763-16

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    4. Fock-Chow-Thow et al. 2017. Comparison of commercial DNA extraction kits and quantitative PCR systems for better sensitivity in detecting the causative agent of paratuberculosis in dairy cow fecal samples. Journal of Dairy Science 100(1):572-581.

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    5. Simmons, K., Islam, R., Rempel, H., Block, G.S., Topp, E., et Diarra, M.S. (2016 in press). « Antimicrobial Resistance of Escherichia fergusonii Isolated from Broiler Chickens. », Journal of Food Protection.

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    6. Fock-Chow-Tho, D., Topp, E., Ibeagha-Awemu, E.M., et Bissonnette, N. (2016). « Comparison of commercial DNA extraction and QPCR systems for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. », 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France, 19-24 June, 2016, P-03.18, p. 98. (Résumé)

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    7. Fernando, D.M., Khan, I.U.H., Patidar, R., Lapen, D.R., Talbot, G., Topp, E., Kumar, A. (2016). Isolation and characterization of acinetobacter baumannii recovered from campylobacter selective medium, 7(NOV), http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2016.01871

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    8. Topp, E., Irwin, R., McAllister, T.A., Lessard, M., Joensuu, J.J., Kolotilin, I., Conrad, U., Stöger, E., Mor, T., Warzecha, H., Hall, J.C., McLean, M.D, Cox, E., Devriendt, B., Potter, A., Depicker, A., Virdi, V., Holbrook, L., Doshi, K., Dussault, M., Friendship, R.M., Yarosh, O., Yoo, H.S., MacDonald, J.D., et Menassa, R. (2016). « The case for plant-made veterinary immunotherapeutics. », Biotechnology Advances. doi : 10.1016/j.biotechadv.2016.02.007

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    9. Coors, A., Edwards, M., Lorenz, P., Römbke, J., Schmelz, R.M., Topp, E., Waszak, K., Wilkes, G.A., et Lapen, D.R. (2016). « Biosolids applied to agricultural land: Influence on structural and functional endpoints of soil fauna on a short- and long-term scale. », Science of the Total Environment, 562, p. 312-326. doi : 10.1016/j.scitotenv.2016.03.226

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    10. Topp, E., Renaud, J.B., Sumarah, M.W., et Sabourin, L. (2016). « Reduced persistence of the macrolide antibiotics erythromycin, clarithromycin and azithromycin in agricultural soil following several years of exposure in the field. », Science of the Total Environment, 562, p. 136-144. doi : 10.1016/j.scitotenv.2016.03.210

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    11. Fock-Chow-Tho, D. E. Topp, E. Ibeagha-Awemu, and N. Bissonnette. Comparison of commercial DNA extraction and QPCR systems for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. International Congress on Paratuberculosis, Nantes, France, June 19-24th.

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    12. Holman, D.B., Hao, X., Topp, E., Yang, H.E., Alexander, T.W. (2016). Effect of co-composting cattle manure with construction and demolition waste on the archaeal, bacterial, and fungal microbiota, and on antimicrobial resistance determinants, 11(6), 1-21. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0157539

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    13. Laprade, N., Cloutier, M., Lapen, D.R., Topp, E., Wilkes, G.A., Villemur, R., et Khan, I.U.H. (2016). « Detection of virulence, antibiotic resistance and toxin (VAT) genes in Campylobacter species using newly developed multiplex PCR assays. », Journal of Microbiological Methods. doi : 10.1016/j.mimet.2016.03.009

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    14. Rahube, T.O., Marti, R., Scott, A., Tien, Y.C., Murray, R.L., Sabourin, L., Duenk, P.W., Lapen, D.R., et Topp, E. (2016). « Persistence of Antibiotic Resistance and Plasmid-Associated Genes in Soil Following Application of Sewage Sludge and Abundance on Vegetables at Harvest. », Canadian Journal of Microbiology, 62(7), p. 600-607. doi : 10.1139/cjm-2016-0034

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    15. Whiteduck-Leveillee, K., Whiteduck-Léveillée, J., Cloutier, M., Cloutier, M., Tambong, J.T., Xu, R., Topp, E., Arts, M.T., Chao, J., Adam, Z., Lévesque, C.A., Lapen, D.R., Villemur, R., et Khan, I.U.H. (2015). « Identification, characterization and description of Arcobacter faecis sp. Nov., isolated from a human waste septic tank. », Systematic and Applied Microbiology. doi : 10.1016/j.syapm.2015.12.002

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    16. Dring, C., Devlin, J.F., Boag, G., Sunohara, M.D., Fitzgibbon, J., Topp, E., et Lapen, D.R. (2016). « Incentives and disincentives identified by producers and drainage contractors/experts on the adoption of controlled tile drainage in eastern Ontario, Canada. », Water Quality Research Journal of Canada, 51(1), p. 1-16. doi : 10.2166/wqrjc.2015.047

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    17. Whiteduck-Léveillée, J., Cloutier, M., Topp, E., Lapen, D.R., Talbot, G., Villemur, R., et Khan, I.U.H. (2016). « Development and Evaluation of Multiplex PCR Assays for Rapid Detection of Virulence-associated Genes in Arcobacter Species. », Journal of Microbiological Methods, 121, p. 59-65. doi : 10.1016/j.mimet.2015.12.017

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    18. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Topp, E., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. DRDC-RDDC-2015-C148. Final Close-Out Report. (Rapport)

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    19. Archambault, M., Boerlin, P., Campbell, J.M., Dumont, M., Hutchinson, J.J., Landals, D., McClure, J., McEwen, S.A., Prescott, J.F., Rubin, J., Slavic, D., Stemshorn, B., Skippon, W., Weese, S., Szkotnicki, J., et Topp, E. (2015). « Antibiotic stewardship’s golden moment: Resistance or change? », Canadian Veterinary Journal, 56(2), p. 115-119.

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    20. Delaquis, P.J., Nadya, S., Chen, J., Allen, K.J., Johnson, R.P., Ziebell, K.A., Bach, S.J., et Topp, E. (2015). « Prevalence, phenotypic and genotypic characteristics of Shiga toxin-producing Escherichia coli isolated from irrigation waters in a Canadian urban-agricultural landscape. », VTEC 2015, Boston, MA, USA, September 13-16, 2015.

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    Installation de recherche

    1391, rue Sandford
    London, ON N5V 4T3
    Canada

    Affiliations

    Adjoint, Université Western Ontario, Département de biologie.

    Faculté des études supérieures spéciales, Université de Guelph, Collège vétérinaire de l'Ontario, Département de pathobiologie

    Language

    Anglais
    Français