Ed Topp, Ph.D.

Directeur de Recherche

Microbiologie et chimie de l'environnement

1391, rue Sandford, London, ON, Canada N5V 4T3

Recherche et / ou projets en cours

Évaluation et gestion des risques pour l'environnement et la santé humaine associés aux engrais organiques agricoles d'origine animale, avicole et humaine: devenir et impacts des produits pharmaceutiques, des agents pathogènes microbiens et des bactéries résistantes aux antibiotiques dans les systèmes de production agricole.

Énoncés de recherches/projets

-Atténuer la résistance aux antimicrobiens dans les systèmes de production alimentaire.

-Initiative de recherche et développement en génomique sur la résistance aux antimicrobiens [GRDI-AMR]

Activités professionnelles / intérêts

Membre, Comité consultatif scientifique de l'Initiative de programmation conjointe sur la RAM (JPIAMR) (2019-)

Président, Comité d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens, les cultures et l'environnement (Rome, juin 2018)

Membre de la liste d'experts FAO / OMS sur la résistance aux antimicrobiens d'origine alimentaire (2019-)

Membre du groupe de travail de l'Autorité européenne de sécurité des aliments (EFSA) concernant «Le rôle de l'environnement dans l'émergence et la propagation de la résistance aux antimicrobiens (RAM) à travers la chaîne alimentaire» (2019-20)
Membre Agence nationale de sécurité sanitaire de l'alimentation, de l'environnement et du travail (ANSES, France) collectif d'expertise: «Antibiorésistance et environnement - État et causes possibles de la contamination des milieux en France par les antibiotiques et par les bactéries résistantes aux antibiotiques et les supports génétiques de la résistance aux antibiotiques »(2019-2021)

Société canadienne des microbiologistes (Président 2010-2011)

Société canadienne des sciences du sol

American Society for Microbiology

Soil Science Society of America

International Society for Microbial Ecology

Society of Environmental Toxicology and Chemistry

Prix et études

Ph.D., Département de microbiologie, Université du Minnesota, États-Unis

M.Sc., Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

B.Sc. (Agriculture). Département de microbiologie, Collège Macdonald de l'Université McGill, Canada

Élu Membre Correspondant de l'Académie d'Agriculture de France 2016

Prix d'excellence de la fonction publique du gouvernement du Canada pour contribution scientifique 2016

Prix Gold Harvest d'AAC pour la réussite professionnelle 2015

Prix d'excellence en recherche de l'Association des eaux et de l'environnement de l'Ontario 2014

Bourse d'études supérieures du CRSNG 1984

Bourse Busch, The Graduate School, Université du Minnesota 1984

Prix Walter M. Stewart, Faculté d'agriculture, Université McGill 1983

Liens additionnels

https://www.researchgate.net/profile/Edward_Topp

https://scholar.google.ca/citations?user=gERlCUQAAAAJ&hl=en

Principales publications

Zaidi, S., Zaheer, R., Poulin-Laprade, D., Scott, A., Diarra, M. S., Church, D., Topp, E., Van Domselaar, G., Zovoilis., A. and McAllister T.A. 2023. Comparative Genomic investigation of Enterococcus faecium and Enterococcus faecalis across One-Health Sectors. AMR-One Health Consortium Second Annual Retreat. Banff Alberta
2022 - Consulter les détails de la publication
Arcand, Y., Bittman, S., Britten, M., Champagne, C., Daneshfar, B., David, S., Davidson, A., Derdall, E. Drury, C., Eden, J., Handyside, P., Hung, Y., Javorek, S., Jiang, Y., Jingui, Y., Jordan, C., Joosse, P., Li, S., McAuley, E., McNairn, H., MacDonald, D., Pacheco, A., Powers, J., Reid, K., Smith, E. L., Topp, E., Vanrobaeys, J., Villeneuve, S., Wilson, H., Yang, J. Agricultural Land Use. Synthesis of Science. Canada Water Agency Report. Freshwater Science Assessment-Line of Inquiry. Nov. 20, 2020.
2020 - Consulter les détails de la publication
Zambri, M., Cloutier, M., Adam, Z., Lapen, D.R., Wilkes, G., Sunohara, M., Topp, E., Talbot, G., Khan, I.U.H. (2019). Novel virulence, antibiotic resistance and toxin gene-specific PCR-based assays for rapid pathogenicity assessment of Arcobacter faecis and Arcobacter lanthieri. BMC Microbiology, [online] 19(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12866-018-1357-7
2019 - Consulter les détails de la publication
Khan, I.U.H., Miltenburg, M.G., Cloutier, M., Islam, O., Lapen, D.R., Wilkes, G., Talbot, G., Topp, E. 2018. Quantitative assessment of agricultural water quality, human and animal feces for prevalence of Arcobacter faecis and A. lanthieri. ASM (American Society for Microbiology) Microbe 2018. June 07-11, 2018, Atlanta, GA.
2018 - Consulter les détails de la publication
Goulas, A., Sabourin, L., Asghar, F., Haudin, C.S., Benoit, P., Topp, E. (2018). Explaining the accelerated degradation of ciprofloxacin, sulfamethazine, and erythromycin in different soil exposure scenarios by their aqueous extractability. Environmental Science and Pollution Research, [online] 25(16), 16236-16245. http://dx.doi.org/10.1007/s11356-018-1834-4
2018 - Consulter les détails de la publication
Liu, L., Cloutier, M., Craiovan, E., Edwards, M., Frey, S.K., Gottschall, N., Lapen, D.R., Sunohara, M., Topp, E., Khan, I.U.H. (2018). Quantitative real-time PCR-based assessment of tile drainage management influences on bacterial pathogens in tile drainage and groundwater. Science of the Total Environment, [online] 624 1586-1597. http://dx.doi.org/10.1016/j.scitotenv.2017.10.200
2018 - Consulter les détails de la publication
Chen, W., Wilkes, G., Khan, I.U.H., Pintar, K.D.M., Thomas, J.L., Lévesque, C.A., Chapados, J.T., Topp, E., Lapen, D.R. (2018). Aquatic bacterial communities associated with land use and environmental factors in agricultural landscapes using a metabarcoding approach. Frontiers in Microbiology, [online] 9 http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2018.02301
2018 - Consulter les détails de la publication
Jones, T.H., Brassard, J., Topp, E., Wilkes, G., Lapen, D.R. (2017). Waterborne viruses and F-specific coliphages in mixed-use watersheds: Microbial associations, host specificities, and affinities with environmental/land use factors. Applied and Environmental Microbiology, [online] 83(3), http://dx.doi.org/10.1128/AEM.02763-16
2017 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Thow et al. 2017. Comparison of commercial DNA extraction kits and quantitative PCR systems for better sensitivity in detecting the causative agent of paratuberculosis in dairy cow fecal samples. Journal of Dairy Science 100(1):572-581.
2017 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Tho, D., Topp, E., Ibeagha-Awemu, E.M., et Bissonnette, N. (2016). « Comparison of commercial DNA extraction and QPCR systems for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. », 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France, 19-24 June, 2016, P-03.18, p. 98. (Résumé)
2016 - Consulter les détails de la publication
Simmons, K., Islam, R., Rempel, H., Block, G.S., Topp, E., et Diarra, M.S. (2016 in press). « Antimicrobial Resistance of Escherichia fergusonii Isolated from Broiler Chickens. », Journal of Food Protection.
2016 - Consulter les détails de la publication
Sunohara, M.D., Gottschall, N., Craiovan, E., Wilkes, G., Topp, E., Frey, S.K., Lapen, D.R. (2016). Controlling tile drainage during the growing season in Eastern Canada to reduce nitrogen, phosphorus, and bacteria loading to surface water. Agricultural Water Management, [online] 178 159-170. http://dx.doi.org/10.1016/j.agwat.2016.08.030
2016 - Consulter les détails de la publication
Fernando, D.M., Khan, I.U.H., Patidar, R., Lapen, D.R., Talbot, G., Topp, E., Kumar, A. (2016). Isolation and characterization of acinetobacter baumannii recovered from campylobacter selective medium. Frontiers in Microbiology, [online] 7(NOV), http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2016.01871
2016 - Consulter les détails de la publication
Topp, E., Irwin, R., McAllister, T.A., Lessard, M., Joensuu, J.J., Kolotilin, I., Conrad, U., Stöger, E., Mor, T., Warzecha, H., Hall, J.C., McLean, M.D, Cox, E., Devriendt, B., Potter, A., Depicker, A., Virdi, V., Holbrook, L., Doshi, K., Dussault, M., Friendship, R.M., Yarosh, O., Yoo, H.S., MacDonald, J.D., et Menassa, R. (2016). « The case for plant-made veterinary immunotherapeutics. », Biotechnology Advances. doi : 10.1016/j.biotechadv.2016.02.007
2016 - Consulter les détails de la publication
Coors, A., Edwards, M., Lorenz, P., Römbke, J., Schmelz, R.M., Topp, E., Waszak, K., Wilkes, G.A., et Lapen, D.R. (2016). « Biosolids applied to agricultural land: Influence on structural and functional endpoints of soil fauna on a short- and long-term scale. », Science of the Total Environment, 562, p. 312-326. doi : 10.1016/j.scitotenv.2016.03.226
2016 - Consulter les détails de la publication
Topp, E., Renaud, J.B., Sumarah, M.W., et Sabourin, L. (2016). « Reduced persistence of the macrolide antibiotics erythromycin, clarithromycin and azithromycin in agricultural soil following several years of exposure in the field. », Science of the Total Environment, 562, p. 136-144. doi : 10.1016/j.scitotenv.2016.03.210
2016 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Tho, D. E. Topp, E. Ibeagha-Awemu, and N. Bissonnette. Comparison of commercial DNA extraction and QPCR systems for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. International Congress on Paratuberculosis, Nantes, France, June 19-24th.
2016 - Consulter les détails de la publication
Holman, D.B., Hao, X., Topp, E., Yang, H.E., Alexander, T.W. (2016). Effect of co-composting cattle manure with construction and demolition waste on the archaeal, bacterial, and fungal microbiota, and on antimicrobial resistance determinants. PLoS ONE, [online] 11(6), 1-21. http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0157539
2016 - Consulter les détails de la publication
Laprade, N., Cloutier, M., Lapen, D.R., Topp, E., Wilkes, G.A., Villemur, R., et Khan, I.U.H. (2016). « Detection of virulence, antibiotic resistance and toxin (VAT) genes in Campylobacter species using newly developed multiplex PCR assays. », Journal of Microbiological Methods. doi : 10.1016/j.mimet.2016.03.009
2016 - Consulter les détails de la publication
Rahube, T.O., Marti, R., Scott, A., Tien, Y.C., Murray, R.L., Sabourin, L., Duenk, P.W., Lapen, D.R., et Topp, E. (2016). « Persistence of Antibiotic Resistance and Plasmid-Associated Genes in Soil Following Application of Sewage Sludge and Abundance on Vegetables at Harvest. », Canadian Journal of Microbiology, 62(7), p. 600-607. doi : 10.1139/cjm-2016-0034
2016 - Consulter les détails de la publication