Dr. Xianqin Yang

Image Xianqin Yang
Chercheure scientifique

Je suis chercheuse dans le domaine de la salubrité et de la conservation de la viande.

Recherche et / ou projets en cours

Depuis 2007, les recherches de Mme Yang portent principalement sur la réduction de la contamination microbiologique de la viande au cours des processus de production primaire et de distribution, c’est-à-dire depuis l’abattage des animaux jusqu’aux steaks dans l’assiette, y compris l’identification, le suivi et l’élimination de la source de contamination, les mécanismes de survie et de persistance d’E. coli dans les environnements de transformation de la viande, les stratégies d’intervention efficaces pour lutter contre les pathogènes entériques et la prolongation de la durée de conservation de la viande.

Principales publications

  1. Fang, Y., Visvalingam, J., Zhang, P., Yang, X. (2022). Biofilm formation by Non-O157 Shiga toxin-producing Escherichia coli in monocultures and co-cultures with meat processing surface bacteria. Food Microbiology, [online] 102 http://dx.doi.org/10.1016/j.fm.2021.103902

    2022 - View publication details

  2. Alexander Gill, Sandeep Tamber and Xianqin Yang. 2022. Standard Methods for the Bacteriological Analysis of Meat in Encyclopedia of Meat Sciences

    2022 - View publication details

  3. Zhang P, Yang X, Björkroth J. 2022. Genetic Characteristics of the Transmissible Locus of Stress Tolerance (tLST) and tLST Harboring Escherichia coli as Revealed by Large-Scale Genomic Analysis. Appl Environ Microbiol 0:e02185-21.

    2022 - View publication details

  4. Xu, Z.S., Yang, X., Gänzle, M.G. (2021). Resistance of biofilm- and pellicle-embedded strains of Escherichia coli encoding the transmissible locus of stress tolerance (tLST) to oxidative sanitation chemicals. International Journal of Food Microbiology, [online] 359 http://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2021.109425

    2021 - View publication details

  5. Zhang, P., Essendoubi, S., Keenliside, J., Reuter, T., Stanford, K., King, R., Lu, P., Yang, X. (2021). Genomic analysis of Shiga toxin-producing Escherichia coli O157:H7 from cattle and pork-production related environments. npj Science of Food, [online] 5(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41538-021-00097-0

    2021 - View publication details

  6. Stanford, K., Tran, F., Zhang, P., Yang, X. (2021). Biofilm-forming capacity of Escherichia coli isolated from cattle and beef packing plants: Relation to virulence attributes, stage of processing, antimicrobial interventions, and heat tolerance, 87(23), http://dx.doi.org/10.1128/AEM.01126-21

    2021 - View publication details

  7. Chez Escherichia coli, le locus de résistance à la chaleur (LRC) peut conférer différents degrés de résistance à la chaleur. Cette étude a porté sur les relations phylogénétiques ainsi que les caractéristiques génomiques et phénotypiques de bactéries E. coli avec ou sans LRC isolées de viande de bœuf par étalement direct sur gélose ou par culture dans un bouillon d’enrichissement à 42 °C. Les isolats d’E. coli LRC positifs (n = 24) ont été soumis à un séquençage du génome entier par lectures courtes et longues. Les isolats LRC négatifs (n = 18) provenant de sources équivalentes aux isolats LRC positifs ont été soumis à un séquençage par lectures courtes. Le temps de réduction décimale à 60 °C [D(60 °C)] a été évalué pour tous les isolats, ainsi que leur sensibilité aux désinfectants E-SAN et Perox-E. La croissance à 42 °C de certains isolats a aussi été évaluée. Les isolats LRC positifs et négatifs étaient bien séparés sur l’arbre génomique central, avec 22 des 24 isolats positifs regroupés en trois clades. Malgré des valeurs D(60 °C) différentes, les isolats des clades 1 et 2 étaient des isolats clonaux, comme l’a montré le sous-typage (typage par séquence multilocus [MLST]), MLST du génome de base et sérotypage). Les isolats de chaque clade étaient du même sérotype. Les isolats LRC négatifs étaient génétiquement diversifiés. Chez les isolats LRC positifs, la taille médiane du génome était de 0,3 Mbp plus grande (P < 0,001) (5,0 vs 4,7 Mbp), et on a constaté chez ces isolats une surreprésentation des gènes liés au maintien des plasmides, à la réponse au stress et aux prophages cryptiques, de même qu’une sous-représentation des gènes intervenant dans l’attachement épithélial et la virulence. Tous les isolats LRC positifs hébergeaient une copie chromosomique du LRC, et tous les isolats du clade 2 avaient une copie partielle supplémentaire du LRC sur des plasmides conjugatifs. À 42 °C, les taux de croissance étaient de 0,71 ± 0,02 et 0,65 ± 0,02 log(DO) h(-1) pour les isolats LRC positifs et négatifs, respectivement. Aucune différence significative dans la sensibilité aux désinfectants n’a été observée entre les isolats LRC positifs et négatifs.
    IMPORTANCE. Les bactéries résistantes constituent un grave problème de salubrité alimentaire et de santé publique. La résistance à la chaleur conférée par le LRC varie largement entre les différentes souches d’E. coli. Les résultats de cette étude montrent que le bagage génomique et la composition du LRC, en plus de sa présence, jouent un rôle important dans le degré de résistance à la chaleur chez E. coli, et que les souches avec un certain bagage génétique sont plus susceptibles d’acquérir et de maintenir le LRC. Il faut également faire preuve de prudence lors de la récupération d’E. coli à des températures élevées, car la présence du LRC peut conférer des avantages de croissance à certaines souches. Il est intéressant de noter que les souches qui possèdent le LRC semblent avoir évolué davantage que les souches sans LRC chez l’hôte animal primaire pour s’adapter à leur habitat secondaire, comme en témoigne le nombre réduit de gènes impliqués dans la virulence et la fixation épithéliale. Les relations phylogénétiques entre les isolats semblent indiquer de plusieurs mécanismes d’acquisition du LRC par E. coli, probablement avant que la bactérie ne soit déposée sur la viande.

    2021 - View publication details

  8. Zhang, P., Britton, A.P., Visser, K.A., Welke, C.A., Wassink, H., Prins, E., Yang, X., Martin-Visscher, L.A. (2021). Genome Sequences of Bacteriophages cd2, cd3, and cd4, which Specifically Target Carnobacterium divergens. Microbiology Resource Announcements, [online] 10(34), http://dx.doi.org/10.1128/MRA.00636-21

    2021 - View publication details

  9. Yang, X., Wang, H., Hrycauk, S., Klassen, M.D. (2021). Effects of Peroxyacetic Acid Spray and Storage Temperature on the Microbiota and Sensory Properties of Vacuum-Packed Subprimal Cuts of Meat, 87(11), 1-16. http://dx.doi.org/10.1128/AEM.03143-20

    2021 - View publication details

  10. Chen, Y.Y., Kommadath, A., Vahmani, P., Visvalingam, J., Dugan, M.E.R., Yang, X. (2021). Transcriptome Analysis of Listeria monocytogenes Exposed to Beef Fat Reveals Antimicrobial and Pathogenicity Attenuation Mechanisms. Applied and Environmental Microbiology, [online] 87(9), 1-18. http://dx.doi.org/10.1128/AEM.03027-20

    2021 - View publication details

  11. Zhang, P., Essendoubi, S., Keenliside, J., Reuter, T., Stanford, K., King, R., Lu, P., Yang, X. (2021). Genome sequences of 104 Escherichia coli O157:H7 isolates from pigs, cattle, and pork production environments in Alberta, Canada. Microbiology Resource Announcements, [online] 10(4), http://dx.doi.org/10.1128/MRA.01320-20

    2021 - View publication details

  12. Peipei Zhang, Saida Essendoubi, Julia Keenliside, Tim Reuter, Kim Stanford, Robin King, Patricia Lu and Xianqin Yang. 2021. Phylogenetic and genomic analysis of Shiga toxin-producing Escherichia coli O157:H7 from pigs, cattle and pig production-related environments in Alberta, Canada. Banff Pork Seminar, Banff, AB, Canada, January 05-07, 2021.

    2021 - View publication details

  13. Essendoubi, S., Yang, X., King, R., Keenliside, J., Bahamon, J., Diegel, J., Lu, P., Cassis, R., Gensler, G., Stashko, N., Rolheiser, D. 83(11), 1909-1917. http://dx.doi.org/10.4315/JFP-20-146

    2020 - View publication details

  14. Zhang, P., Tran, F., Stanford, K., Yang, X. (2020). Are antimicrobial interventions associated with heat-resistant Escherichia coli on meat?, 86(13), http://dx.doi.org/10.1128/AEM.00512-20

    2020 - View publication details

  15. Yang, X., Wang, H., Badoni, M., Zawadski, S., McLeod, B., Holman, D., Uttaro, B. (2020). Effects of a novel three-step sous-vide cooking and subsequent chilled storage on the microbiota of beef steaks, 159 http://dx.doi.org/10.1016/j.meatsci.2019.107938

    2020 - View publication details

  16. Visvalingam, J., P. Zhang, T. C. Ells, and X. Yang. 2018. Dynamics of Biofilm Formation by Salmonella Typhimurium and Beef Processing Plant Bacteria in Mono- and Dual-Species Cultures. Microbial Ecology. https://doi.org/10.1007/s00248-018-1304-z

    2019 - View publication details

  17. Laidlaw, AM, Gänzle, MG, Yang, X, 2018. Comparative assessment of qPCR enumeration methods that discriminate between live and dead Escherichia coli O157:H7 on beef. Food Microbiology 79, 41-47. https://doi.org/10.1016/j.fm.2018.11.002

    2019 - View publication details

  18. Zhang, P., Badoni, M., Gänzle, M., Yang, X. (2018). Growth of Carnobacterium spp. isolated from chilled vacuum-packaged meat under relevant acidic conditions. International Journal of Food Microbiology, [online] 286 120-127. http://dx.doi.org/10.1016/j.ijfoodmicro.2018.07.032

    2018 - View publication details

  19. Yang, X., Wang, H., He, A., Tran, F. (2018). Biofilm formation and susceptibility to biocides of recurring and transient Escherichia coli isolated from meat fabrication equipment, 90 205-211. http://dx.doi.org/10.1016/j.foodcont.2018.02.050

    2018 - View publication details

  20. Wang, H., Badoni, M., Zawadski, S, McLeod, B., Uttaro, B., Yang, X. (2018) Storage life at 2° C or -1.5° C of beef steaks cooked by a three-step sous-vide method. CMSA/CMC Annual Meeting, May 29-31, 2018, Montreal PQ

    2018 - View publication details

Installation de recherche

6000, sentiers C et E
Lacombe, AB T4L 1W1
Canada

Language

Anglais

Other languages

Chinese