Dr. Miao (Mindy) Liu

Image Miao (Mindy) Liu
Chercheuse, Mycologue
  • Systématique des champignons (taxonomie et nomenclature, phylogénétique moléculaire)
  • Biologie des populations de champignons (évolution des populations et spéciation)
  • Détection moléculaire d’agents pathogènes des végétaux 
  • Évolution et composition de gènes 

Recherche et / ou projets en cours

  • Biosystématique des champignons et des bactéries – Pont entre la taxonomie et les sciences « omiques » pour la recherche et la réglementation dans le secteur agricole;
    J-002272; Chefs de projet : Sarah Hambleton, Keith Seifert; Budgets : 2 495 000 $ (157 500 $ pour ML); Durée : du 1er mai 2019 au 31 mars 2024; Volet de proposition : Appel annuel de propositions de RDT fait par la DGST.

Énoncés de recherches/projets

Identifier des espèces de champignons pathogènes liés aux végétaux et en comprendre la viabilité génétique afin d’aider le programme de sélection des cultures à concevoir de nouveaux cultivars résistants aux maladies qui permettront d’accroître la productivité agricole. Comprendre la structure génétique des populations de pathogènes des végétaux afin de fournir de l’information permettant de mettre en place des stratégies écologiques de lutte contre les maladies visant à accroître la performance environnementale. Accroître les connaissances sur la systématique, la génomique, la détection, le chémotype et la distribution des champignons toxinogènes (c’est-à-dire, Claviceps spp.) dans les grains afin de renforcer les bases du contrôle de la qualité des aliments à l’aide de la biosurveillance, des lois et règlements nationaux et de l’évaluation des risques.

Activités professionnelles / intérêts

  1. Rédactrice en chef, Canadian Journal of Plant Pathology (2019 à maintenant).
  2. Chef de rubrique, Canadian Journal of Plant Pathology (2016 à 2019).
  3. Membre d’un groupe d’experts au 4e Forum national sur les espèces envahissantes organisé par le Conseil canadien sur les espèces envahissantes, à Ottawa, les 12 et 13 février 2019.
  4. Réviseure de manuscrits pour diverses publications, dont les suivantes : Canadian Journal of Plant Pathology; Carnets de bryolgie; Genome Biology and Evolution; Mycologia; Plant Disease.

Prix et études

  • Doctorat en phytopathologie, Université Cornell, 2005         
  • Maîtrise ès sciences, Université de foresterie de Beijing, 1990

Expérience et / ou de travail international

Collaboration avec des chercheurs en République tchèque (Miroslav Kolarik, Ph. D.), au Japon (Eiji Tanaka, Ph. D.), au Royaume-Uni (Anna Gordon, Ph. D.) et aux États-Unis (Kirk Broders, Ph. D.) dans le cadre d’études sur l’ergot (Claviceps), et collaboration avec des chercheurs en l’Allemagne (Uwe Braun, Ph. D.) et au Japon (Susumu Takamatsu, Ph. D.) dans le cadre d’études sur l’oïdium.

Principales publications

  1. Wyka, S.A., Mondo, S.J., Liu, M., Dettman, J., Nalam, V., Broders, K.D. (2021). Whole-Genome Comparisons of Ergot Fungi Reveals the Divergence and Evolution of Species within the Genus Claviceps Are the Result of Varying Mechanisms Driving Genome Evolution and Host Range Expansion. Genome biology and evolution, [online] 13(2), http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evaa267

    2021 - Consulter les détails de la publication

  2. Hambleton, S., Liu, M., Eggertson, Q., Wilson, S., Carey, J., Anikster, Y., Kolmer, Y.A.J.A. (2020). Crown rust fungi with short lifecycles-the puccinia mesnieriana species complex. Sydowia, [online] 71 47-63. http://dx.doi.org/10.12905/0380.sydowia71-2019-0047

    2020 - Consulter les détails de la publication

  3. Nguyen HDT, Grunwald NJ, Abad ZG, Martin FN, Crouch J, Hambleton S, Dettman J, Liu M, Harris LJ, Castlebury L, Salagado-Salazar C, Cowger C, Ellouz O, Mollov D, Fall ML, Ling K, Griffifths J, Mahaffee W, Chen W, Sultata T, Yu Q, Carta LK, Skantar AM, Tambong J, Rogers E, Li S, Dumonceaux TJ, Widmer TL. The 2019 AAFC-USDA meeting on genotyping and monitoring of high-risk plant pathogens.

    2019 - Consulter les détails de la publication

  4. Shoukouhi, P., Hicks, C., Menzies, J.G., Popovic, Z., Chen, W., Seifert, K.A., Assabgui, R., Liu, M. (2019). Phylogeny of Canadian ergot fungi and a detection assay by real-time polymerase chain reaction. Mycologia, [online] 111(3), 493-505. http://dx.doi.org/10.1080/00275514.2019.1581018

    2019 - Consulter les détails de la publication

  5. Wingfield, B.D., Liu, M., Nguyen, H.D.T., Lane, F.A., Morgan, S.W., De Vos, L., Markus Wilken, P., Duong, T.A., Aylward, J., Coetzee, M.P.A., Dadej, K., De Beer, Z.W., Findlay, W., Havenga, M., Kolarík, M., Menzies, J.G., Naidoo, K., Pochopski, O., Shoukouhi, P., Santana, Q.C., Seifert, K.A., Soal, N., Steenkamp, E.T., Tatham, C.T., van der Nest, M.A., Wingfield, M.J. (2018). Nine draft genome sequences of Claviceps purpurea s.lat., including C. arundinis, C. humidiphila, and C. cf. spartinae, pseudomolecules for the pitch canker pathogen Fusarium circinatum, draft genome of Davidsoniella eucalypti, Grosmannia galeiformis, Quambalaria eucalypti, and Teratosphaeria destructans. IMA Fungus, [online] 9(2), 401-418. http://dx.doi.org/10.5598/imafungus.2018.09.02.10

    2018 - Consulter les détails de la publication

  6. Demers, J.E., Liu, M., Hambleton, S., Castlebury, L.A. (2017). Rust fungi on panicum. Mycologia, [online] 109(1), 1-17. http://dx.doi.org/10.1080/00275514.2016.1262656

    2017 - Consulter les détails de la publication

  7. Liu, M., McCabe, E., Chapados, J.T., Carey, J., Wilson, S.K., Tropiano, R., Redhead, S.A., Lévesque, C.A., et Hambleton, S. (2015). « Detection and identification of selected cereal rust pathogens by TaqMan® real-time PCR. », Canadian Journal of Plant Pathology, 37(1), p. 92-105. doi : 10.1080/07060661.2014.999123

    2015 - Consulter les détails de la publication

  8. Liu, M. et Hambleton, S. (2013). « Laying the foundation for a taxonomic review of Puccinia coronata s.l. in a phylogenetic context. », Mycological Progress, 12(1), p. 63-89. doi : 10.1007/s11557-012-0814-1

    2013 - Consulter les détails de la publication

  9. Liu, M., Szabo, L.J., Hambleton, S., Anikster, Y., et Kolmer, J.A. (2013). « Molecular phylogenetic relationships of the brown leaf rust fungi on wheat, rye and other grasses. », Plant Disease, 97(11), p. 1408-1417. doi : 10.1094/PDIS-02-13-0152-RE

    2013 - Consulter les détails de la publication

  10. Liu, M. et Hambleton, S. (2012). « Puccinia chunjii, a close relative of the cereal stem rusts revealed by molecular phylogeny and morphological study. », Mycologia, 104(5), p. 1056-1067. doi : 10.3852/11-251

    2012 - Consulter les détails de la publication

  11. Liu, M. et Hambleton, S. (2010). « Taxonomic study of stripe rust, Puccinia striiformis sensu lato, based on molecular and morphological evidence. », Fungal Biology, 114(10), p. 881-899. doi : 10.1016/j.funbio.2010.08.005

    2010 - Consulter les détails de la publication

  12. Chaverri, P., Liu, M., et Hodge, K.T. (2008). « A monograph of the entomopathogenic genera Hypocrella, Moelleriella, and Samuelsia gen. nov. (Ascomycota, Hypocreales, Clavicipitaceae), and their aschersonia-like anamorphs in the Neotropics. », Studies in Mycology, 60(1), p. 1-66. doi : 10.3114/sim.2008.60.01

    2008 - Consulter les détails de la publication

Installation de recherche

960, avenue Carling
Ottawa, ON K1A 0C6
Canada

Affiliations

  • Représentante régionale et membre de la Société canadienne de phytopathologie (depuis 2016)
  • Membre de la Mycological Society of America (depuis 2016)
  • Membre de l’International Mycological Congress (depuis 2018)
  • Membre de l’Asian Mycological Congress (depuis 2019)

Langue

Anglais

Autres langues

Mandarin