Dr. Ian King

Image King, Ian
Chercheur scientifique
Agence canadienne d'inspection des aliments

Recherche et / ou projets en cours

Membre de l’équipe du projet sur l’Initiative de recherche et développement en génomique (IRDG) :

« Écobiomique : Biosurveillance des écosystèmes fondée sur la métagénomique »

Énoncés de recherches/projets

Le projet d’Écobiomique vise trois grands objectifs :

1. Mettre au point des méthodes normalisées pour prélever des échantillons de sol et d’eau, extraire l’ADN, le séquençage de nouvelle génération, les pipelines d’analyse bioinformatique de même qu’une plateforme fédérale de bioinformatique pour harmoniser l’analyse des données de métagénomique dans les ministères fédéraux et communiquer les résultats aux utilisateurs finaux.

2. Sites pilots d’observations génomiques pour établir des références en métagénomique afin de pouvoir évaluer les changements qui toucheront la biodiversité de l’eau et du sol des sites de surveillance à long terme au Canada.

3. Produire de nouvelles connaissances par le séquençage de nouvelle génération afin de mieux caractériser les microbiomes aquatiques, ceux du sol ainsi que les zoobiomes invertébrés, et de vérifier des hypothèses visant à améliorer la surveillance environnementale ainsi que les activités d’évaluation et de restauration de la qualité des eaux et de la santé des sols partout au Canada.

Prix et études

Études

Ph.D. – Écologie, évolution et biologie des organismes 

Département de biologie / Département de nématologie

Université de la Californie, Riverside

Titre de la thèse : Nematode ecological study of a wetland restoration-in-progress at Bolsa Chica, California: Implications for biomonitoring (Écologie des nématodes de terres humides en voie de restauration à Bolsa Chica, en Californie : Répercussions en matière de biosurveillance) [Traduction]

 

B.Sc. (spécialisé) – Biologie

Département de biologie

Université Memorial de Terre-Neuve

Titre de la thèse : Two new species of the genus Monhystera (Nematoda: Monhysteridae)

from the Humber Arm, Newfoundland (Deux nouvelles espèces du genre Monhystera (Nematoda: Monhysteridae) découvertes dans le bras Humber, à Terre-Neuve) [Traduction]

 

Prix

Bourse de recherche postdoctorale industrielle de Mitacs Elevate 

Principales publications

REMARQUE : Les articles sont disponibles en format PDF sur demande.

Hajibabaei M, King I (2016) "Next generation biodiversity analysis" in Next Generation Systematics (eds. Olsen PD, Hughes J, Cotton JA) Cambridge: Cambridge University Press, pgs 175-194 (book chapter)

 

Shokralla S, Gibson J, King I, Baird D, Janzen D, Hallwachs W, Hajibabaei M (2016) Environmental DNA barcode sequence capture: targeted, PCR-free sequence capture for biodiversity analysis from bulk environmental samples. bioRxiv 087437 (preprint) DOI: 10.1101/087437

 

Elansary HO, Skalicka-Woźniak K, King I (2016) Enhancing stress growth traits as well as phytochemical and antioxidant contents of Spiraea and Pittosporum under seaweed extract treatments. Plant Physiology and Biochemistry 105: 310-320 DOI: 10.1016/j.plaphy.2016.05.024

 

Gibson JF, Shokralla S, Curry C, Baird DJ, Monk WA, King I, Hajibabaei M (2015) Large-scale biomonitoring of remote and threatened ecosystems via high-throughput sequencing. PLoS One 10 (10): e0138432 DOI: 10.1371/journal.pone.0138432

 

Shokralla S, Hellberg RS, Handy SM, King I, Hajibabaei M (2015) A DNA mini-barcoding system for authentication of processed fish products. Scientific Reports 5:15894 DOI: 10.1038/srep15894

 

Gibson JF, Shokralla S, Porter TM, King I, van Konynenburg S, Janzen DH, Hallwachs W, Hajibabaei M (2014) Simultaneous assessment of the macrobiome and microbiome in a bulk sample of tropical arthropods through DNA metasystematics. Proceedings of the National Academy of Sciences of the USA 111(22): 8007-8012 DOI: 10.1073/pnas.1406468111

 

Neira C, King I, Mendoza G, Sellanes J, De Ley P, Levin L (2013) Nematode community structure along a central Chile margin transect influenced by the oxygen minimum zone. Deep-Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers 78: 1-15 DOI: 10.1016/j.dsr.2013.04.002

 

King I, Mundo-Ocampo M, De Ley P (2010) Xyala finneyae sp. n. (Nematoda: Xyalidae), from the intertidal region of the eastern Gulf of California, Mexico. Nematology 12(5): 673-680 DOI: 10.1163/138855409X12571623969682

 

King I (2009) The need for the incorporation of phylogeny in the measurement of biological diversity, with special reference to ecosystem functioning research. BioEssays 31(1): 107-116 DOI: 10.1002/bies.080011

 

Mundo-Ocampo M, Lambshead PJD, Debenham N, King I, De Ley P, Baldwin JG, Tandingan De Ley I, Rocha Olivares A, Waumann D, Thomas WK, Packer M, Boucher G (2007) Biodiversity of littoral nematodes from two sites in the Gulf of California. Hydrobiologia 586: 179-189 DOI: 10.1007/s10750-006-0624-z

 

Yoder M, Tandingan De Ley I, King I, Mundo-Ocampo M, Mann J, Blaxter M, Poiras L, De Ley P (2006) DESS: a versatile solution for preserving morphology and extractable DNA of nematodes. Nematology 8(3): 367-376 DOI: 10.1163/156854106778493448

 

Yeow H-W, Finney-Crawley JR, Lawlor J, King I (1999) Free-living nematode assemblages downstream from a pulp and paper mill in Humber Arm, Newfoundland. Russian Journal of Nematology 7(2): 95-103

Affiliations

Chercheur Scientifique, Agence Canadienne d'Inspection des Aliment (ACIA)

Langue

Anglais