Dr. Eveline M. Ibeagha-Awemu

Image Eveline Ibeagha-Awemu
Chercheuse en génomique animale

Mme Ibeagha-Awemu a obtenu un doctorat en génomique animale de l’Université Justus-Liebig de Giessen, en Allemagne, en 2003, et a fait ensuite des études postdoctorales à l’Université McGill. Elle s’est jointe à AAC en 2011 en tant que chercheuse en génomique animale.

Son programme de recherche vise à améliorer a) la productivité et la résistance aux maladies et b) la salubrité des chaînes de valeurs laitières et porcines.

Mme Ibeagha-Awemu utilise des technologies avancées et le séquençage de nouvelle génération (p. ex. le génotypage par séquençage, le génotypage haute densité par puce, le génotypage ciblé, le séquençage du génome complet, le séquençage au bisulfite du génome complet, le séquençage ciblé au bisulfite des amplicons, etc.) afin de détecter les marqueurs génétiques et épigénétiques à l’échelle génomique, ainsi que le profilage de l’expression génétique (séquençage de l’ARNm et de l’ARNlnc) et des microARN régulateurs (séquençage des miARN) afin de détecter les réseaux de gènes, les voies géniques et les marqueurs géniques et épigénétiques de la production de lait et des traits de maladie (mammite bovine et paratuberculose bovine).

Elle étudie aussi la façon dont les nutriments interagissent avec le génome et l’épigénome (neutrigénomique) pour augmenter la productivité et la teneur des composants souhaitables (p. ex. les acides gras polyinsaturés, le cholestérol, etc.) du lait de vache.

Un autre volet de sa recherche consiste à manipuler le microbiote intestinal au moyen de différentes stratégies (probiotiques, transplantation du microbiote fécal, etc.) pour stimuler l’établissement microbien précoce, le développement immunitaire, l’amélioration de la santé intestinale et la productivité. Cela pourrait également réduire l’utilisation des antibiotiques et la contamination de l’environnement de l’étable par des pathogènes.

Recherche et / ou projets en cours

  • Rôle des marques de la méthylation de l’ADN dans la mammite bovine et la production laitière

  • Biomarqueurs microARN de la mammite bovine

  • Rôle du microbiote du lait dans la pathogenèse de la mammite à Staphylococcus aureus

  • Rôles de la méthylation de l’ADN et des microARN dans la paratuberculose

 

Activités professionnelles / intérêts

  • Membre : GRESABO (Groupe de recherche en santé bovine)

  • Membre : Comité des essais biologiques de FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes)

  • Membre : Comité de la santé animale de l’American Society of Animal Science/Société canadienne de science animale

  • Membre : Groupement de recherche Op+lait sur la qualité du lait grâce au programme de groupement stratégique FQRNT 

  • Membre : Dairy Cattle Breeding and Genetics Committee, Canada

  • Membre : Agriculture et Agroalimentaire Canada

  • Membre :

  • Membre du comité de rédaction : BMC Genomics

  • Membre du comité de rédaction : Scientific Reports

  • Membre du comité de rédaction : Frontiers in Genetics

  • Ancienne présidente de la Société canadienne de science animale

  • Membre : Société canadienne de science animale 

  • Membre : American Dairy Science Association 

  • Membre : International Society of Animal Genetics 

  • Membre : International Association for Paratuberculosis  

Expérience et / ou de travail international

Membre : Scientific and Industrial Advisory Board du National Steering Committee du National Center for Livestock Breeding, Genetics and Genomics, Pir Mehr Ali Shah Arid Agriculture University, Rawalpindi, Pakistan

Projets de collaboration internationale

- Profilage transcriptionnel des glandes mammaires des bovins Kashmiri et des bovins Kashmiri croisés Jersey du point de vue de la qualité du lait et du rendement (Inde)

- Rôle du microbiote dans la pathogenèse des pestes des petits ruminants (Nigéria)

Principales publications

  1. Ariel, O. Ibeagha-Awemu, N. Gévry, and N. Bissonnette. Johnes disease bovine monocyte-derived macrophages are insensitive to ex vivo infection by Mycobacterium avium ssp. paratuberculosis. 2016 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France, June 19-24th.

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  2. Li, R., Dudemaine, P.-L., Zhao, X., Lei, C., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2016). « Comparative Analysis of the miRNome of Bovine Milk Fat, Whey and Cells. », PLoS ONE, 11(4: e0154129), p. 1-21. doi : 10.1371/journal.pone.0154129

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  3. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., Ammah, A.A., Dudemaine, P.-L., Bissonnette, N., Benchaar, C., et Zhao, X. (2016). « Transcriptome adaptation of the bovine mammary gland to diets rich in unsaturated fatty acids shows greater impact of linseed oil over safflower oil on gene expression and metabolic pathways. », BMC Genomics, 17(104), p. 1-23. doi : 10.1186/s12864-016-2423-x

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  4. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., Ammah, A.A., Bissonnette, N., Benchaar, C., et Zhao, X. (2015). « Transcriptome adaptation of the bovine mammary gland to a diet supplemented with linseed oil. », Journal of Animal Science, 93(Suppl. S3), p. 410. (Résumé)

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  5. Ibeagha-Awemu, E.M., Dudemaine, P.-L., Chiquette, J., Talbot, G., et Bissonnette, N. (2015). « Involvement of microRNAs in calves’ intestinal growth and development and probable modulatory role of Saccharomyces cerevisiae. », Symposium on Gut Health in Production of Food Animals, Kansas City, Missouri, USA, November 9-11, 2015. (Affiche)

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  6. Fomenky, B., Beaudoin, F., Chiquette, J., Talbot, G., Bissonnette, N., Chouinard, P.Y., Lessard, M., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « Amélioration du développement immunitaire chez les veaux laitiers par les probiotiques. », Symposium sur les bovins laitiers 2015, Drummondville, QC, Canada, Octobre 29, 2015.

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  7. Fomenky, B., Chiquette, J., Chouinard, P.Y., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « The effect of two direct fed microbials on calf’s performance and oxidative burst capacity during the early period of growth. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  8. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., et Dudemaine, P.-L. (2015). « The long non-coding RNA transcriptome of the bovine mammary gland and potential regulatory roles in fatty acid synthesis. », 6th International Symposium on Animal Functional Genomics (ISFAG), Piacenza, Italy, July 27-29, 2015, #82, p. 91. (Résumé)

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  9. Ariel, N., Gévry, G., Fecteau, G., Ibeagha-Awemu, E.M., Karrow, N.A., et Bissonnette, N. (2015). « Genetic association of Johne's disease susceptible cows through transcriptome profiling of MAP infected macrophages. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  10. Ibeagha-Awemu, E.M., Peters, S.O., Imumorin, I.G., et Zhao, X. (2015). « Genome-wide association study of milk protein percent in Canadian Holstein cows. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  11. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., Ammah, A.A., Bissonnette, N., Benchaar, C., et Zhao, X. (2015). « Transcriptome adaptation of the bovine mammary gland to a diet supplemented with linseed oil. », ADSA-ASAS 2015 JAM (Joint Annual Meeting), Orlando, Florida, USA, July 12-16, 2015, Invited to present at the ASAS Presidents' Picks Poster Session at JAM 2015. (Affiche)

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  12. Ariel, O., Gevry, N.Y., Fecteau, G., Ibeagha-Awemu, E.M., Karrow, N.A., et Bissonnette, N. (2015). « Bovine paratuberculosis monocyte-derived macrophages are insensitive to ex vivo MAP infection. », 65th Annual Canadian Society of Microbiologists Annual Conference, University of Regina, Regina, Saskatchewan, Canada, June 15-18, 2015.

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  13. Ibeagha-Awemu, E.M., Beaudoin, F., Chiquette, J., Talbot, G., Bissonnette, N., et Lessard, M. (2015). « Probiotics administration enhances calves’ lymphoproliferation responses to vaccination during the early weeks of growth. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  14. Ammah, A.A., Beaudoin, F., Marier, L., Benchaar, C., Bissonnette, N., Gévry, G., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « Effects of dietary supplementation with safflower oil on milk components and fat acid composition of Canadian Holstein cows. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  15. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., Dudemaine, P.-L., Ammah, A.A., Bissonnette, N., Benchaar, C., et Zhao, X. (2015). « Mammary gland transcriptome profiling of cows fed safflower oil reveals a potential modulatory role for SREBP1 in fatty acid synthesis. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  16. Constant, E., Ibeagha-Awemu, E.M., Miglior, F., Robitaille, G., et Bissonnette, N. (2015). « Improving the genotyping-by-sequencing (GBS) approach for the identification of SNPs associated with Johne’s disease. », ADSA-ASAS JAM (Joint Annual Meeting) 2015, Orlando, Florida, USA, July 12-16, 2015, 2-15, Poster Session, p. 651-652.

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  17. Chiquette, J., Veilleux, L., Brochu, J., Beaudoin, F., Fomenky, B., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « Viability of the direct-fed Saccharomyces cerevisiae boulardii in the digestive tract of calves. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  18. Li, R., Dudemaine, P.-L., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « isomiR selection and cross detection will affect accurate quantification of miRNA expression. », 2015 Conference of the Canadian Society of Animal Science and the Canadian Meat Council, Ottawa, Canada, May 6-8, 2015.

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  19. Li, R., Beaudoin, F., Ammah, A.A., Bissonnette, N., Benchaar, C., Zhao, X., Lei, C., et Ibeagha-Awemu, E.M. (2015). « Deep sequencing shows microRNA involvement in bovine mammary gland adaptation to diets supplemented with linseed oil or safflower oil. », BMC Genomics, 16(1: Article 884), p. 1-16. doi : 10.1186/s12864-015-1965-7

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  20. Ibeagha-Awemu, E.M. et Zhao, X. (2015). « Epigenetic marks: regulators of livestock phenotypes and conceivable sources of missing variation in livestock improvement programs. », Frontiers in Genetics, 6(Article 302), p. 1-17. doi : 10.3389/fgene.2015.00302

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Installation de recherche

2000, rue du Collége
Sherbrooke, QC J1M 1Z3
Canada

Affiliations

Professeure auxiliaire, Université Laval

Language

Anglais
Français