Dr. Eveline M. Ibeagha-Awemu

Chercheuse en génomique animale

Mme Ibeagha-Awemu a obtenu un doctorat en génomique animale de l’Université Justus-Liebig de Giessen, en Allemagne, en 2003, et a fait ensuite des études postdoctorales à l’Université McGill. Elle s’est jointe à AAC en 2011 en tant que chercheuse en génomique animale.

Son programme de recherche vise à améliorer a) la productivité et la résistance aux maladies et b) la salubrité des chaînes de valeurs laitières et porcines.

Mme Ibeagha-Awemu utilise des technologies avancées et le séquençage de nouvelle génération (p. ex. le génotypage par séquençage, le génotypage haute densité par puce, le génotypage ciblé, le séquençage du génome complet, le séquençage au bisulfite du génome complet, le séquençage ciblé au bisulfite des amplicons, etc.) afin de détecter les marqueurs génétiques et épigénétiques à l’échelle génomique, ainsi que le profilage de l’expression génétique (séquençage de l’ARNm et de l’ARNlnc) et des microARN régulateurs (séquençage des miARN) afin de détecter les réseaux de gènes, les voies géniques et les marqueurs géniques et épigénétiques de la production de lait et des traits de maladie (mammite bovine et paratuberculose bovine).

Elle étudie aussi la façon dont les nutriments interagissent avec le génome et l’épigénome (neutrigénomique) pour augmenter la productivité et la teneur des composants souhaitables (p. ex. les acides gras polyinsaturés, le cholestérol, etc.) du lait de vache.

Un autre volet de sa recherche consiste à manipuler le microbiote intestinal au moyen de différentes stratégies (probiotiques, transplantation du microbiote fécal, etc.) pour stimuler l’établissement microbien précoce, le développement immunitaire, l’amélioration de la santé intestinale et la productivité. Cela pourrait également réduire l’utilisation des antibiotiques et la contamination de l’environnement de l’étable par des pathogènes.

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Sherbrooke, Quebec

Recherche et / ou projets en cours

Rôle des marques de la méthylation de l’ADN dans la mammite bovine et la production laitière
Biomarqueurs microARN de la mammite bovine
Rôle du microbiote du lait dans la pathogenèse de la mammite à Staphylococcus aureus
Rôles de la méthylation de l’ADN et des microARN dans la paratuberculose

Activités professionnelles / intérêts

Membre : GRESABO (Groupe de recherche en santé bovine)
Membre : Comité des essais biologiques de FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes)
Membre : Comité de la santé animale de l’American Society of Animal Science/Société canadienne de science animale
Membre : Groupement de recherche Op+lait sur la qualité du lait grâce au programme de groupement stratégique FQRNT
Membre : Dairy Cattle Breeding and Genetics Committee, Canada
Membre : Agriculture et Agroalimentaire Canada
Membre :
Membre du comité de rédaction : BMC Genomics
Membre du comité de rédaction : Scientific Reports
Membre du comité de rédaction : Frontiers in Genetics
Ancienne présidente de la Société canadienne de science animale
Membre : Société canadienne de science animale
Membre : American Dairy Science Association
Membre : International Society of Animal Genetics
Membre : International Association for Paratuberculosis

Expérience et / ou de travail international

Membre : Scientific and Industrial Advisory Board du National Steering Committee du National Center for Livestock Breeding, Genetics and Genomics, Pir Mehr Ali Shah Arid Agriculture University, Rawalpindi, Pakistan

Projets de collaboration internationale

- Profilage transcriptionnel des glandes mammaires des bovins Kashmiri et des bovins Kashmiri croisés Jersey du point de vue de la qualité du lait et du rendement (Inde)

- Rôle du microbiote dans la pathogenèse des pestes des petits ruminants (Nigéria)

Liens additionnels

Google scholar: https://scholar.google.ca/citations?hl=en&user=q5fNcCkAAAAJ&sortby=pubdate&view_op=list_works&gmla=AJsN-F5Uu1pkX9wZ4nA4n1PkFtrUE3EOwSvumqrfGF29OvAloKqaEPTRCXi-xHnTv1t-VZAni25AcwoYeE23ayVZG-RcjUJiwQ

Principales publications

Wang, M., M. Laterrière, P.-L. Dudemaine, N. Bissonnette, D. Gagné, and E. M. Ibeagha-Awemu. 2022. PSVIII-B-15 Potential Involvement of DNA Methylation of First Intron in Transcriptional Regulation During Bovine Subclinical Mastitis Caused by Staphylococcus Aureus. Journal of Animal Science 100(Supplement_3):310-311. doi: 10.1093/jas/skac247.565 %J Journal of Animal Science
2022 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., D. Kelton, G. Fecteau, K. Tahlan, E. Ibeagha-Awemu, and P. Griebel. 2022. Identification of disease tolerant and susceptible cows to Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis infection for genetic analyses of disease resistance. 15th International Colloquium on Paratuberculosis. Dublin, Irland, June 12-16 2022.
2022 - Consulter les détails de la publication
Ariel O. Brouard J.-S., Marete A., Miglior F. Ibeagha-Awemu E., and Bissonnette N. 2021. L’analyse d’association à l’échelle du génome a permis d'identifier des variations génétiques issues d’ARN-seq et biopuce à ADN associées à la paratuberculose chez des bovins Holstein canadiens à l'aide de macrophages infectés expérimentalement «in vitro»
2021 - Consulter les détails de la publication
Oladokun, S., Koehler, A., MacIsaac, J., Ibeagha-Awemu, E.M., Adewole, D.I. (2021). Bacillus subtilis delivery route: effect on growth performance, intestinal morphology, cecal short-chain fatty acid concentration, and cecal microbiota in broiler chickens. Poultry Science, [online] 100(3), http://dx.doi.org/10.1016/j.psj.2020.10.063
2021 - Consulter les détails de la publication
Are some cows genetically susceptible to Johne’s Disease?
2021 - Consulter les détails de la publication
Wang, M., and Ibeagha-Awemu, E.M. (2021). Impacts of Epigenetic Processes on the Health and Productivity of Livestock. Frontiers in Genetics 11, 1812.
2021 - Consulter les détails de la publication
Peters, S.O., Kızılkaya, K., Ibeagha-Awemu, E.M., Sinecen, M., Zhao, X. (2021). Comparative accuracies of genetic values predicted for economically important milk traits, genome-wide association, and linkage disequilibrium patterns of Canadian Holstein cows. Journal of Dairy Science (JDS), [online] 104(2), 1900-1916. http://dx.doi.org/10.3168/jds.2020-18489
2021 - Consulter les détails de la publication
Nathalie Bissonnette, Andrew Marete, Dave Kelton, Flavio Schenkel, Eveline M Ibeagha-Awemu, Gilles Fecteau, Filippo Miglior, Conditional GWAS using sequence-based genotypes for susceptibility to Mycobacterium avium subsp paratuberculosis infection in Canadian Holstein, Journal of Animal Science, Volume 98, Issue Supplement 4, November 2020, Page 17.
2020 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., D. Gendron, O. Ariel, P.-L. Dudemaine, and E. Ibeagha-Awemu. Transcriptome profiling of primary bovine macrophages from cows with Johne’s disease suggests a tolerance state induced by convergent signalling via NF-κB and its synergistic tolerized genes. ASAS-CSAS Annual Meeting & Trade Show, Vancouver, Canada, July 8-12th.
2018 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., J.-S. Brouard, O. Ariel, N. Gévry, E. Ibeagha-Awemu, and F. Miglior. 2018. Discovery of expression quantitative trait loci associated with Johne’s disease using both RNA-seq and DNA variants. 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. February 10th-16th 2018, Auckland, New-Zealand.
2018 - Consulter les détails de la publication
Do D.N., Fomenky B.E., Dudemaine P-L., Bissonnette N. and Ibeagha-Awemu E.M. (2018) Weighted gene co-expression network analysis reveal gene clusters and pathways related to rumen development in calves. Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Productio, 11.945, February 11 to 16, 2018, Auckland New Zealand. 5 pages.
2018 - Consulter les détails de la publication
Do, D.N., Dudemaine, P.L., Li, R., Ibeagha-Awemu, E.M. (2017). Co-expression network and pathway analyses reveal important modules of miRNAs regulating milk yield and component traits. International Journal of Molecular Sciences, [online] 18(7), http://dx.doi.org/10.3390/ijms18071560
2017 - Consulter les détails de la publication
Ibeagha-Awemu, E.M.; Khatib, H., Chapter 29 - Epigenetics of Livestock Breeding. In Handbook of Epigenetics. The New Molecular and Medical Genetics (second edition), Edited by Tollefsbol, trygve o. Academic Press: 2017; pp 441-463.
2017 - Consulter les détails de la publication
Brouard et al. 2017. Génotypage par séquençage de faible profondeur (GBS) d'une population bovine: stratégies pour maximiser la sélection des génotypes de haute qualité et la précision de l'imputation. BMC Genetics 18:32.
2017 - Consulter les détails de la publication
Do DN, Bissonnette N, Lacasse P, Miglior F, Sargolzaei M, Zhao X & Ibeagha-Awemu EM 2017 Genome-wide association analysis and pathways enrichment for lactation persistency in Canadian Holstein cattle. J Dairy Sci 100(3) 1955-1970
2017 - Consulter les détails de la publication
Bissonnette, N., J.-S. Brouard, B. Boyle, and E. Ibeagha-Awemu. 2017. Low-Depth Genotyping-by-Sequencing (GBS) in a Bovine Population: Strategies to Maximize the Selection of High Quality Genotypes and Accuracy of Imputation. Plant & Animal Genome Plant & Animal Genome Conference, San Diego 2017/01/14 - 2017/01/18
2017 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Thow et al. 2017. Comparison of commercial DNA extraction kits and quantitative PCR systems for better sensitivity in detecting the causative agent of paratuberculosis in dairy cow fecal samples. Journal of Dairy Science 100(1):572-581.
2017 - Consulter les détails de la publication
Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., et Dudemaine, P.-L. (2016). « Long non-coding RNA (lncRNA) is abundantly expressed in the gastro intestinal tract of calves. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016, https://pag.confex.com/pag/xxiv/meetingapp.cgi/Paper/21424. (Affiche)
2016 - Consulter les détails de la publication
Fock-Chow-Tho, D., Topp, E., Ibeagha-Awemu, E.M., et Bissonnette, N. (2016). « Comparison of commercial DNA extraction and QPCR systems for a better sensitivity in detecting the causative paratuberculosis pathogen in dairy cow fecal samples. », 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France, 19-24 June, 2016, P-03.18, p. 98. (Résumé)
2016 - Consulter les détails de la publication
Ariel, O., Gevry, N.Y., Ibeagha-Awemu, E.M., et Bissonnette, N. (2016). « Johnes disease bovine monocyte-derived macrophages are insensitive to ex vivo infection by Mycobacterium avium ssp. Paratuberculosis. », 13th International Colloquium on Paratuberculosis, Nantes, France, 19-24 June, 2016, P-01.11, p. 45. (Résumé)
2016 - Consulter les détails de la publication