Dr. Eveline M. Ibeagha-Awemu

Image Eveline Ibeagha-Awemu
Chercheuse en génomique et épigénomique animale

Le programme de recherche du Dre Ibeagha-Awemu se concentre sur l'amélioration de la productivité, de la résistance aux maladies et de la sécurité des chaînes de valeur laitières et porcines. Elle utilise une approche multiomique et d'autres technologies avancées afin de caractériser et découvrir des éléments et mécanismes moléculaires régulant, les marqueurs génétiques et épigénétiques associés aux traits de santé, de production et d'adaptation environnementale des animaux. Les résultats de ses travaux permettront de développer des biomarqueurs pour mieux gérer les maladies et l’état de santé des animaux, ainsi que leur adaptation environnementale.

Les recherches du Dre Ibeagha-Awemu visent également à comprendre comment le microbiote interagit avec le génome et l’épigénome en réponse aux nutriments et aux agents pathogènes pour influencer les caractéristiques de santé et de maladie. Plus précisément, l'identification/le développement de souches microbiennes favorisant  l'atténuation des maladies et des émissions de gaz à effet de serre. Le but étant de développer des alternatives à l'utilisation d'antibiotiques dans la production animale.

Ses recherches portent également sur les aspects réglementaires du domaine émergent de l'agriculture cellulaire au Canada à travers des études sur la composition nutritionnelle des aliments cultivés afin d’informer les intervenants réglementaires. Le développement d'outils/protocoles de dépistage pour les aliments cultivés et des études visant à améliorer la croissance cellulaire et la capacité de production à l'aide des techniques d'édition des gènes seront aussi mis de l’avant.

Avant de se joindre à AAC en 2011 en tant que chercheur scientifique en génomique animale,  Dre Ibeagha-Awemu a obtenu une maîtrise en sélection et génétique animales de l'Université du Nigéria Nsukka, au Nigéria, ainsi qu'un doctorat en génétique animale de l'Université Justus Liebig de Giessen, en Allemagne, en 2003. Elle  poursuivit par la suite des études postdoctorales à l'Université McGill.

Recherche et / ou projets en cours

  • Rôle des biomarqueurs épigénétiques (méthylation de l'ADN et miARN) dans la mammite et la production laitière
  • Caractérisation des éléments régulateurs (miRNA, lncRNA, snoRNA et circRNA, etc.) et transposables du génome bovin
  • Rôle du microbiote dans les maladies infectieuses des animaux
  • Aspects réglementaires de l'agriculture cellulaire

 

Activités professionnelles / intérêts

  • Membre: African Animal Breeding network

  • Membre : GRESABO (Groupe de recherche en santé bovine)

  • Membre : Comité des essais biologiques de FAANG (Functional Annotation of Animal Genomes)

  • Membre : Comité de la santé animale de l’American Society of Animal Science/Société canadienne de science animale

  • Membre : Groupement de recherche Op+lait sur la qualité du lait grâce au programme de groupement stratégique FQRNT 

  • Membre : Dairy Cattle Breeding and Genetics Committee, Canada

  • Membre : Réseau des femmes et des sciences, Agriculture et Agroalimentaire Canada

  • Membre du comité de rédaction : Genome (CSP)

  • Membre du comité de rédaction : BMC Genomics

  • Membre du comité de rédaction : Scientific Reports

  • Membre du comité de rédaction : Frontiers in Genetics

  • Ancienne présidente de la Société canadienne de science animale

  • Membre : Société canadienne de science animale 

  • Membre : American Dairy Science Association 

  • Membre : International Society of Animal Genetics 

  • Membre : International Association for Paratuberculosis  

Prix et études

Recipient of 2021 CSAS (Canadian Society for Animal Science) Award for Technical Innovation in Enhancing Production of Safe and Affordable Food.

Expérience et / ou de travail international

Membre : Steering committee of the African Animal Breeding Network

Membre: Working Group on Animal Seed of the African Seed and Biotechnology Partnership Platform (ASB PP) of the African union [2021 – Present]

Projets de collaboration internationale

  • Profilage transcriptionnel des glandes mammaires des bovins Kashmiri et des bovins Kashmiri croisés Jersey du point de vue de la qualité du lait et du rendement (Inde)
  • Rôle du microbiote dans la pathogenèse des pestes des petits ruminants (Nigéria)

Principales publications

  1. Wang, M., M. Laterrière, P.-L. Dudemaine, N. Bissonnette, D. Gagné, and E. M. Ibeagha-Awemu. 2022. PSVIII-B-15 Potential Involvement of DNA Methylation of First Intron in Transcriptional Regulation During Bovine Subclinical Mastitis Caused by Staphylococcus Aureus. Journal of Animal Science 100(Supplement_3):310-311. doi: 10.1093/jas/skac247.565 %J Journal of Animal Science

    2022 - Consulter les détails de la publication

  2. Bissonnette, N., D. Kelton, G. Fecteau, K. Tahlan, E. Ibeagha-Awemu, and P. Griebel. 2022. Identification of disease tolerant and susceptible cows to Mycobacterium avium subspecies paratuberculosis infection for genetic analyses of disease resistance. 15th International Colloquium on Paratuberculosis. Dublin, Irland, June 12-16 2022.

    2022 - Consulter les détails de la publication

  3. Ariel O. Brouard J.-S., Marete A., Miglior F. Ibeagha-Awemu E., and Bissonnette N. 2021. L’analyse d’association à l’échelle du génome a permis d'identifier des variations génétiques issues d’ARN-seq et biopuce à ADN associées à la paratuberculose chez des bovins Holstein canadiens à l'aide de macrophages infectés expérimentalement «in vitro»

    2021 - Consulter les détails de la publication

  4. Zhao, X., E. Ibeagha-Awemu, And P. Lacasse. 2021. A One-health Perspective on S. aureus Induced Mastitis. Journal of Animal Science 99(Supplement_3):39-40 DOI: 10.1093/jas/skab235.068

    2021 - Consulter les détails de la publication

  5. Oladokun, S., Koehler, A., MacIsaac, J., Ibeagha-Awemu, E.M., Adewole, D.I. (2021). Bacillus subtilis delivery route: effect on growth performance, intestinal morphology, cecal short-chain fatty acid concentration, and cecal microbiota in broiler chickens. Poultry Science, [online] 100(3), http://dx.doi.org/10.1016/j.psj.2020.10.063

    2021 - Consulter les détails de la publication

  6. Are some cows genetically susceptible to Johne’s Disease?

    2021 - Consulter les détails de la publication

  7. Wang, M., and Ibeagha-Awemu, E.M. (2021). Impacts of Epigenetic Processes on the Health and Productivity of Livestock. Frontiers in Genetics 11, 1812.

    2021 - Consulter les détails de la publication

  8. Peters, S.O., Kızılkaya, K., Ibeagha-Awemu, E.M., Sinecen, M., Zhao, X. (2021). Comparative accuracies of genetic values predicted for economically important milk traits, genome-wide association, and linkage disequilibrium patterns of Canadian Holstein cows. Journal of Dairy Science (JDS), [online] 104(2), 1900-1916. http://dx.doi.org/10.3168/jds.2020-18489

    2021 - Consulter les détails de la publication

  9. Nathalie Bissonnette, Andrew Marete, Dave Kelton, Flavio Schenkel, Eveline M Ibeagha-Awemu, Gilles Fecteau, Filippo Miglior, Conditional GWAS using sequence-based genotypes for susceptibility to Mycobacterium avium subsp paratuberculosis infection in Canadian Holstein, Journal of Animal Science, Volume 98, Issue Supplement 4, November 2020, Page 17.

    2020 - Consulter les détails de la publication

  10. Ibeagha-Awemu EM (2018) Epigenetics, a neglected source of variation for livestock improvement breeding. Invited presentation at the 2018 Yangling International Agri-Science Forum, Nov 5th to 8th, 2018, Yangling, China

    2018 - Consulter les détails de la publication

  11. Bissonnette, N., D. Gendron, O. Ariel, P.-L. Dudemaine, and E. Ibeagha-Awemu. Transcriptome profiling of primary bovine macrophages from cows with Johne’s disease suggests a tolerance state induced by convergent signalling via NF-κB and its synergistic tolerized genes. ASAS-CSAS Annual Meeting & Trade Show, Vancouver, Canada, July 8-12th.

    2018 - Consulter les détails de la publication

  12. Bissonnette, N., J.-S. Brouard, O. Ariel, N. Gévry, E. Ibeagha-Awemu, and F. Miglior. 2018. Discovery of expression quantitative trait loci associated with Johne’s disease using both RNA-seq and DNA variants. 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Production. February 10th-16th 2018, Auckland, New-Zealand.

    2018 - Consulter les détails de la publication

  13. Do D.N., Fomenky B.E., Dudemaine P-L., Bissonnette N. and Ibeagha-Awemu E.M. (2018) Weighted gene co-expression network analysis reveal gene clusters and pathways related to rumen development in calves. Proceedings of the 11th World Congress on Genetics Applied to Livestock Productio, 11.945, February 11 to 16, 2018, Auckland New Zealand. 5 pages.

    2018 - Consulter les détails de la publication

  14. Do, D.N., Dudemaine, P.L., Li, R., Ibeagha-Awemu, E.M. (2017). Co-expression network and pathway analyses reveal important modules of miRNAs regulating milk yield and component traits. International Journal of Molecular Sciences, [online] 18(7), http://dx.doi.org/10.3390/ijms18071560

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  15. Ibeagha-Awemu, E.M.; Khatib, H., Chapter 29 - Epigenetics of Livestock Breeding. In Handbook of Epigenetics. The New Molecular and Medical Genetics (second edition), Edited by Tollefsbol, trygve o. Academic Press: 2017; pp 441-463.

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  16. Brouard et al. 2017. Génotypage par séquençage de faible profondeur (GBS) d'une population bovine: stratégies pour maximiser la sélection des génotypes de haute qualité et la précision de l'imputation. BMC Genetics 18:32.

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  17. Do DN, Bissonnette N, Lacasse P, Miglior F, Sargolzaei M, Zhao X & Ibeagha-Awemu EM 2017 Genome-wide association analysis and pathways enrichment for lactation persistency in Canadian Holstein cattle. J Dairy Sci 100(3) 1955-1970

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  18. Bissonnette, N., J.-S. Brouard, B. Boyle, and E. Ibeagha-Awemu. 2017. Low-Depth Genotyping-by-Sequencing (GBS) in a Bovine Population: Strategies to Maximize the Selection of High Quality Genotypes and Accuracy of Imputation. Plant & Animal Genome Plant & Animal Genome Conference, San Diego 2017/01/14 - 2017/01/18

    2017 - Consulter les détails de la publication

  19. Fock-Chow-Thow et al. 2017. Comparison of commercial DNA extraction kits and quantitative PCR systems for better sensitivity in detecting the causative agent of paratuberculosis in dairy cow fecal samples. Journal of Dairy Science 100(1):572-581.

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  20. Ibeagha-Awemu, E.M., Li, R., et Dudemaine, P.-L. (2016). « Long non-coding RNA (lncRNA) is abundantly expressed in the gastro intestinal tract of calves. », XXIV Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, January 9-13, 2016, https://pag.confex.com/pag/xxiv/meetingapp.cgi/Paper/21424. (Affiche)

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