Dion Lepp, Ph.D.

Image Dion Lepp
Biologiste

Gestionnaire du laboratoire de génomique de Guelph RDC

Agriculture et Agroalimentaire Canada
93, chemin Stone Ouest, Guelph, ON N1G 5C9

Recherche et / ou projets en cours

Les travaux de M. Lepp se concentrent sur le rôle du microbiote intestinal dans la santé et la maladie, et sa modulation par des interventions alimentaires chez les humains et les animaux de production. Il a également contribué de manière significative à notre compréhension des maladies de la volaille, comme l’entérite nécrotique, et a mis au point des stratégies alternatives pour contrôler la maladie afin de limiter l’utilisation des antibiotiques dans la production de volaille. Ses travaux contribuent de manière importante à la croissance et à la rentabilité du secteur agroalimentaire par la caractérisation des attributs alimentaires bénéfiques et l’atténuation des risques de production.

Énoncés de recherches/projets

  • Effets de régimes alimentaires à base de légumineuses sur le taux de cholestérol, le microbiote intestinal et les métabolites connexes  chez les humains
  • Effets des lentilles sur la santé de l’intestin et l’obésité
  • Élaboration d’approches de substitution pour lutter contre l’entérite nécrotique chez la volaille
  • Recherche d’enzymes bactériennes pour détoxifier les mycotoxines

Activités professionnelles / intérêts

  • Séquençage de prochaine génération et analyse bioinformatique axés sur l’analyse du microbiote, la pathogénomique et la transcriptomique des bactéries
  • Étude du microbiote intestinal et de son rôle dans la santé et les processus pathologiques des humains et des animaux de production
  • Comprendre la pathogénèse de l’entérite nécrotique chez la volaille causée par Clostridium perfringens pour mettre au point des solutions de rechange aux antibiotiques

Prix et études

Doctorat en biopathologie, Université de Guelph, 2012

Maîtrise ès sciences en biologie moléculaire et la génétique, Université de Guelph, 2000

Principales publications

  1. Monk, J.M., Lepp, D., Zhang, C., Wu, W., Zarepoor, L., Lu, J., Pauls, K.P., Tsao, R., Wood, G.A., Robinson, L.E., et Power, K.A. (2016). « Diets enriched with cranberry beans alter the microbiota and mitigate colitis severity and associated inflammation. », Journal of Nutritional Biochemistry, 28, p. 129-139. doi : 10.1016/j.jnutbio.2015.10.014

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  2. Power, K.A., Lepp, D., Zarepoor, L., Monk, J.M., Wu, W., Tsao, R., et Liu, R. (2016). « Dietary flaxseed modulates the colonic microenvironment in healthy C57Bl/6 male mice which may alter susceptibility to gut-associated diseases. », Journal of Nutritional Biochemistry, 28, p. 61-69. doi : 10.1016/j.jnutbio.2015.09.028

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  3. Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Devosia soli strain GH2-10, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LAJG00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000970455.1 ».

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  4. Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Genome Assemblies of Three Soil-Associated Devosia species: D. insulae, D. limi, and D. soli. », Genome Announcements, 3(3: Article e00514-15).

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  5. Chakravarty, B., Yin, X., Lepp, D., Gagnon, N., Auffret, M., Talbot, G., et Diarra, M.S. (2015). « Antibiotic-susceptibility and genome analysis of Acinetobacter baumannii isolated from dairy cattle manures. », Guelph Food Safety Seminar Series - Food Safety: Compliance to Commitment (GFSS 11th Annual Symposium), Guelph, Ontario, Canada, October 21, 2015. (Affiche)

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  6. Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Devosia insulae DS-56, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LAJE00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000970465.1 ».

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  7. Power, K.A., Monk, J.M., Lepp, D., et Wu, W. (2015). « Bean-supplemented diet alters the colonic microenvironment to enhance barrier integrity and reduce colitis-associated inflammation and tissue damage. », FASEB: Gastrointestinal Tract XVI: GI Homeostasis: The Microbiome and the Barrier, Development, and Disease, Steamboat Springs, CO, USA, August 2-7, 2015.

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  8. Monk, J.M., Lepp, D., Wu, W., Pauls, K.P., et Power, K.A. (2015). « Navy bean supplementation attenuates obesity-related impairments in gut barrier function. », Bean Improvement Cooperatives 2015, Niagara Falls, ON, Canada, November 1-4, 2015, Oral presentation.

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  9. Monk, J.M., Lepp, D., Zhang, C., Wu, W., Wood, G.A., Robinson, L.E., et Power, K.A. (2015). « Cranberry beans alter gut micriobial activity and community structure, improve gut health and mitigate colitis severity. », Canadian Nutrition Society Annual Meeting, Winnipeg, Canada, May 28-30, 2015. (Résumé)

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  10. Islam, M.R., Lepp, D., Yin, X., Ross, K.A., Delaquis, P.J., Erhet, D., et Diarra, M.S. (2015). « Gut Microbiota of Organic Broiler Chickens Fed with or without Blueberry Pomace », Guelph Food Safety Seminar Series - Food Safety: Compliance to Commitment (GFSS 11th Annual Symposium), Guelph, Ontario, Canada, October 22, 2015, Poster presentation. (Résumé)

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  11. Hassan, Y.I., He, J., Li, X.-Z., Lepp, D., Zhu, H., et Zhou, T. (2015). « Deoxynivalenol epimerization - A novel biotransformation with potential applications in improving crop resistance against Fusarium diseases. », 18th International Plant Protection Congress, Berlin, Germany, August 24-27, 2015, Oral presentation # OBT6, p. 89. (Résumé)

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  12. Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Devosia limi DSM 17137, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LAJF00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000970435.1 ».

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  13. Hassan, Y.I., Lepp, D., Li, X.-Z., et Zhou, T. (2015). « Devosia geojensis strain BD-c194, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: JZEX00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000969415.1 ».

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  14. Lepp, D., Hassan, Y.I., Li, X.-Z., et Zhou, T. (2015). « Devosia subaequoris strain HST3-14, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LANK00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCA_000971285.1 ».

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  15. Islam, R., Yin, X., Lepp, D., Topp, E., et Diarra, M.S. (2015). « Comparative genomics of Escherichia coli isolated from soil fertilized with litter of chicken fed with or without tetracycline. », 2015 International Association of Food Protection (IAFP), Portland, Oregon, USA, July 25-28, 2015. (Résumé)

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  16. Lepp, D., Hassan, Y.I., Li, X.-Z., et Zhou, T. (2015). « Devosia psychrophila strain Cr7-05, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LAPV00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000971275.1 ».

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  17. Monk, J.M., Lepp, D., Wu, W., et Power, K.A. (2015). « Navy bean supplementation alters microbial activity and community structure and improves gut barrier integrity in lean and obese mice. », 8th Probiotics, Prebiotics and New Foods for Microbiota and Human Health, Rome, Italy, September 13-15, 2015.

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  18. Lepp, D., Hassan, Y.I., Li, X.-Z., et Zhou, T. (2015). « Devosia epidermidihirudinis strain E84, whole genome shotgun sequencing project; GenBank: LANJ00000000.1. http://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/GCF_000971295.1 ».

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  19. Hassan, Y.I., Lepp, D., et Zhou, T. (2015). « Next-generation whole-genome sequencing platforms and factors to consider for bacterial applications. », Journal of Microbiology, Biotechnology and Food Sciences, 5(1), p. 29-33. doi : 10.15414/jmbfs.2015.5.1.29-33

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  20. Power, K.A., Monk, J.M., Lepp, D., Wu, W., et Pauls, K.P. (2015). « Bean supplementation enhances the colonic microenvironment and barrier integrity resulting in reduced colitis-associated tissue damage. », Bean Improvement Cooperatives 2015, Niagara Falls, ON, Canada, November 1-4, 2015.

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Contact

Installation de recherche

Centre de recherche et de développement de Guelph
93, chemin Stone Ouest
Guelph, ON N1G 5C9
Canada

Expertise

Agriculture›Bactériologie›Bactériologie moléculaire
Agriculture›Nutrition›Régimes alimentaires et santé intestinale
Agriculture›Secteur agroalimentaire
Agriculture›le cheptel volaille
Aliments›Microbiologie›Pathogènes
Animal›Microbiologie animale›Bactéries
Technologie›Bioinformatique

Affiliations

  • Membre auxiliaire du corps professoral,  Département de biopathologie, Université de Guelph
  • Professeur auxiliaire, Département de la science de l’alimentation, Université du Manitoba

Language

Anglais