Dr. Christopher P. Garnham

Image Christopher Garnham
Chercheur scientifique

Biochimie

Biologie structurale

Génie protéique

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Recherche et / ou projets en cours

  • Dissection mécaniste de la synthèse de mycotoxines et détoxification des champignons filamenteux pathogènes.

  • Mise au point de nouveaux vaccins sous-unitaires en vue de réduire les pertes financières associées aux maladies virales au sein du cheptel canadien.

Énoncés de recherches/projets

Les mycotoxines sont des métabolites secondaires toxiques produits par diverses espèces de champignons filamenteux qui infectent les cultures canadiennes. L’ingestion d’aliments contenant des mycotoxines peut nuire à la santé de l’humain ou de l’animal qui les consomment. Mon laboratoire cherche à mettre au point des outils enzymatiques inédits capables d’atténuer la contamination des aliments pour animaux et des produits agroalimentaires canadiens par les mycotoxines. Nous nous intéressons plus particulièrement à la biotransformation enzymatique des mycotoxines en des versions non toxiques qui seraient sans danger pour la consommation. 

 

We also seek to develop novel subunit vaccines that target both bacterial and viral pathogens of Canadian livestock, and in particular Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus (PRRSV) and Bovine Respiratory Disease (BRD). Using a combination of structure-based vaccine design as well as several naturally-occuring and synthetically-designed display platforms, our aim is to develop genetically-programmable subunit vaccines that present antigens in a multivalent virus-like manner, therefore inducing potent humoral and cell-based immune responses upon livestock administration.

Prix et études

Études et formation

2011-2016     Boursier postdoctoral (directrice : Antonina Roll-Mecak) National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NINDS), Bethesda, Md.

2005-2011      Ph. D., Biochimie (directeur : Peter L. Davies), Université Queen’s, Kingston, Ont.

2000-2004      B. Sc. (spécialisé), Biochimie, Université Queen's, Kingston, Ont.

 

Bourses d’études et de recherche

2013-2016     Bourse postdoctorale concurrentielle interne du NINDS

2013-2015     Bourse postdoctorale du Conseil de recherches en sciences naturelles et en                                                           génie du Canada (CRSNG) (refusée)

2010-2011     Bourse postdoctorale R. S. McLaughlin

2010               Bourse postdoctorale estivale de la Société japonaise pour la promotion de la science

2010               Bourse du Doyen des études supérieures pour les recherches doctorales sur le terrain

2007-2010     Bourse d’études supérieures du CRSNG — doctorat

2007                Bourse du Tri-Council Recipient Recognition Award de l’Université Queen’s

2005-2007      Bourse d’études supérieures de l’Université Queen’s

 

Prix

2015                1re place, concours de présentation de communications par affichage, 2e retraite interne annuelle du NINDS

2011                Nomination de la thèse de doctorat pour l’obtention de la médaille d’or du Gouverneur général

2011                1re place, Concours de rédaction des chaires de recherche du Canada, Université Queen’s

2011                Prix Linkam pour la présentation d’une affiche (1re conférence internationale sur les protéines de liaison avec la glace [protéines antigel])

2010                Prix du Doyen pour l’excellence en recherche (Prix de l’Université Queen’s pour la présentation d’une affiche dans le cadre de la Journée des stagiaires de recherche en sciences de la santé)

Principales publications

Pour une liste complète de publications, visitez : AAC en ligne

Garnham CP, Yu I, Li Y, Roll-Mecak A. (2017) Crystal structure of tubulin tyrosine ligase-like 3 reveals essential architectural elements unique to tubulin monoglycylases. Proc. Natl. Acad. Sci. 114(25):6545-6550.

Garnham CP, Vemu A, Wilson-Kubalek EM, Yu I, Szyk A, Lander GC, Milligan RA, and Roll-Mecak A. (2015) Multivalent Microtubule recognition by tubulin tyrosine ligase-like family glutamylases.  Cell. 161(5):1112-23.

Yu I, Garnham CP, and Roll-Mecak A. (2015) Writing and Reading the Tubulin Code.  J. Biol. Chem.  290(28):17163-72.

Vemu A, Garnham CP, Lee DY, Roll-Mecak A.  (2014) Generation of differentially modified microtubules using in vitro enzymatic approaches.  Meth. Enzymol.  540:149-66.

Basu K, Garnham CP, Nishimiya Y, Tsuda S, Braslavsky I, Davies PL.  (2014) Determining the ice-binding planes of antifreeze proteins by fluorescence-based ice plane affinity.  J. Vis. Exp. Jan 15(83):e51185.

Guo S, Garnham CP, Karunan Partha S, Campbell RL, Allingham JS, Davies PL.  (2013) Role of Ca²⁺ in folding the tandem β-sandwich extender domains of a bacterial ice-binding adhesin.  FEBS J. 280(22):5919-32.

Liu Y, Garnham CP, Roll-Mecak A, and Tanner ME.  (2013) Phosphinic Acid-Based Inhibitors of Tubulin Polyglutamylases.  Bioorg. & Med. Chem. Letters.  23(15):4408-12.  

Guo S, Garnham CP, Whitney J, Graham L, and Davies PL.  (2012) Re-evaluation of a bacterial antifreeze protein as an adhesin with ice-binding activity.  PLOS ONE.  7(11):e48805

Garnham CP, Nishimiya Y, Tsuda S, and Davies PL.  (2012) Engineering a naturally inactive isoform of type III antifreeze protein into one that can stop the growth of ice.  FEBS letters.  586(21):3876-81

Kondo H, Hanada Y, Sugimoto H, Hoshino T, Garnham CP, Davies PL, and Tsuda S.  (2012) Ice-binding site of snow mold fungus antifreeze protein deviates from structural regularity and high conservation. Proc. Natl. Acad. Sci. 109(24):9360-65.

Garnham CP, Roll-Mecak A.  (2012) The chemical complexity of cellular microtubules: Tubulin post-translational modification enzymes and their roles in tuning microtubule functions.  Cytoskeleton. 69(7):442-463.

Garnham CP, Campbell RL, Walker VK, and Davies PL.  (2011) Novel dimeric β-helical model of an ice nucleation protein with bridged active sites.  BMC Structural Biology.  11(1):36.

Garnham CP, Campbell RL, and Davies PL.  (2011) Anchored Clathrate Waters Bind Antifreeze Proteins to Ice. Proc. Natl. Acad. Sci. 108(18):7363-67.

Garnham CP, Natarajan A, Middleton AJ, Kuiper MJ, Braslavsky I, Davies PL.  (2010) Compound ice-binding site of an antifreeze protein revealed by mutagenesis and fluorescent tagging.  Biochemistry.  49(42):9063-71.

Garnham CP, Hanna RA, Chou JS, Low KE, Gourlay K, Campbell RL, Beckmann JS, Davies PL. (2009) Limb-girdle muscular dystrophy type 2A can result from accelerated autoproteolytic inactivation of calpain 3.  Biochemistry. 48(15):3457-67.

Garnham CP, Gilbert JA, Hartman CP, Campbell RL, Laybourn-Parry J, Davies PL.  (2008) A Ca2+-dependent bacterial antifreeze protein domain has a novel beta-helical ice-binding fold.  Biochem J. 411(1):171-80.

Scotter AJ, Marshall CB, Graham LA, Gilbert JA, Garnham CP, Davies PL.  (2006) The basis for hyperactivity of antifreeze proteins.  Cryobiology.  53(2):229-239.

Fu Q, Garnham CP, Elliott ST, Bovenkamp DE, Van Eyk JE.  (2005) A robust, streamlined, and reproducible method for proteomic analysis of serum by delipidation, albumin and IgG depletion, and two-dimensional gel electrophoresis.  Proteomics.  5(10):2656-64.

Graham DR, Garnham CP, Fu Q, Robbins J, Van Eyk JE.  (2005) Improvements in two-dimensional gel electrophoresis by utilizing a low cost "in-house" neutral pH sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis system.  Proteomics.  5(9):2309-14.

Elliott ST, Crider DG, Garnham CP, Boheler KR, Van Eyk JE.  (2004) Two-dimensional gel electrophoresis database of murine R1 embryonic stem cells.  Proteomics.  4(12):3813-32

Affiliations

Professeur associé, Département de biochimie, Université Western

Langue

Anglais