Dr Christof Rampitsch

Image Christof Rampitsch
Chercheur scientifique

Chercheur scientifique en protéomique et en spectrométrie de masse appliquée à la biologie

Recherche et / ou projets en cours

Mon programme utilise la protéomique, la peptidomique, la bioinformatique et la spectrométrie de masse appliquée à la biologie pour étudier les interactions entre les végétaux et les agents pathogènes. La recherche est principalement axée sur Puccinia triticina (rouille brune), en particulier les protéines et peptides effecteurs, et sur Fusarium graminearum, en particulier la régulation de la biosynthèse des mycotoxines.

Notre laboratoire collabore étroitement avec d’autres chercheurs qui utilisent la protéomique, mais qui n’ont pas l’expertise, l’équipement et les logiciels nécessaires pour traiter des questions biologiques complexes. À l’heure actuelle, ces projets consistent à effectuer des analyses complexes à l’aide d’étiquettes marquées par des isotopes stables, des quantifications sans étiquette et des analyses des modifications post-traductionnelles (phosphorylation et redox).

Énoncés de recherches/projets

Projets

  • Voies de signalisation des stomates pour augmenter le potentiel de rendement du blé
  • Atténuation des nouvelles menaces pour le blé au Canada
  • Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi
  • Développement de la « tolérance au froid des prairies » pour la germination et l’établissement en début de saison dans les cultures des prairies

 

Activités professionnelles / intérêts

Host-pathogen interactions

Proteomics

Peptidomics

Biological Mass Spectrometry

Prix et études

Ph.D. en phytologie, Université de la Colombie-Britannique, à Vancouver, en Colombie-Britannique, au Canada.

M.Sc. en biotechnologie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

B.Sc. (avec distinction) en biochimie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

Expérience et / ou de travail international

  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse LTQ (Thermo Training Centre, Palm Beach FL)
  • Formation sur le matériel : CLHP nano (Dionex Training Centre, Chicago IL)
  • Formation sur les logiciels : Mascot (cours MatrixScience, Savannah GA)
  • Congé sabbatique, Université de Zürich/ETH Functional Genomics Centre Zürich CH
  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse Q Exactive (Thermo, sur place)
  • Formation sur les logiciels : MaxQuant, Berlin (cours d’été)
  • Formation : imagerie MALDI, Technische Universität Wien, Autriche

Principales publications

  1. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. Over-expression of a Fusarium graminearum mitogen activated protein kinase, Mgv1. National Fusarium Head Blight Forum. Milwaukee WI, UNITED STATES, December 3-5, 2017. Poster Presentation

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  2. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, González-Peña Fundora D, Shostak K, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. The role of three small secreted cysteine-rich proteins of Fusarium graminearum on fungal growth and plant infection. National Fusarium Head Blight Forum. Milwaukee WI, UNITED STATES, December 3-5, 2017. Poster Presentation

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  3. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, González-Peña Fundora D, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Characterization of three secreted cysteine-rich proteins from the secretome of Fusarium graminearum. 3rd Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 22, 2017. (Award Winning Presentation) (Oral Presentation)

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  4. Gonzàlez-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, R. Subramaniam, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. Generation and characterization of a Fusarium graminearum mutant overexpressing the MAPK, Mgv1. 2017 Joint Meeting of the Canadian Phytopathological Society and the Canadian Society of Agronomy. Winnipeg MB, Canada, June 18-22, 2017. Award Winning Presentation.

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  5. Sivagnanam, K., Komatsu, E., Rampitsch, C., Perreault, H., Gräfenhan, T. (2017). Rapid screening of Alternaria mycotoxins using MALDI-TOF mass spectrometry, 97(1), 357-361. http://dx.doi.org/10.1002/jsfa.7703

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  6. Eranthodi, A., Subramaniam, R., Ouellet, T., Rampitsch, C., Foroud, N.A., et Schultz, E.A. (2016). « Mutant-based screening for pathogen-associated molecular patterns involved in Fusarium head blight disease resistance in wheat. », Prairie University Biology Symposium 2016, The University of Lethbridge, Lethbridge, AB, Canada, February 18-20, 2016. (Affiche)

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  7. Gonzalez-Pena Fundora, D., Thakor, N., Subramaniam, R., Rampitsch, C., et Foroud, N.A. (2016). « Towards the identification of the Mgv1 MAPK pathway in Fusarium graminearum. », Prairie University Biology Symposium 2016, The University of Lethbridge, Lethbridge, AB, Canada, February 18-20, 2016. (Affiche)

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  8. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, Gonzàlez-Peña Fundora D, Vivar M, Zhao W, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Fusarium graminearum mutants towards identification of pathogenesis-associated molecular patterns. 2nd Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 30, 2016. Award Winning Presentation

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  9. Foroud, N.A., Eranthodi, A., Goyal, R.K., Gonzàlez-Peña Fundora, D., Zhao, W., Vivar, M., Ouellet. T., Subramaniam, R., Rampitsch, C. 2016. Characterization of a secreted Fusarium graminearum elongation factor – an elicitor of host defence? Proceedings of the 8th Canadian Workshop on Fusarium Head Blight, Ottawa, ON, November 20-22 2016. P 19. Invited Oral Presentation.

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  10. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, Vivar M, Gonzàlez-Peña Fundora D, Zhao W, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Characterization of three Fusarium graminearum overexpression mutants and their ability to elicit host defence response in cereals. 8th Canadian Workshop of Fusarium Head Blight, Ottawa ON, CANADA, November 20-22, 2016. p.61

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  11. Fan, T., Bykova, N.V., Rampitsch, C., Xing, T. (2016). Identification and characterization of a serine protease from wheat leaves. European Journal of Plant Pathology, [online] 146(2), 293-304. http://dx.doi.org/10.1007/s10658-016-0914-x

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  12. Rampitsch, C., Bacala, R., Tekauz, A., McCallum, B.D. (2016). Inhibition of Fusarium graminearum and other Fusarium species by Cochlioblolus sativus in culture and on barley plants. Canadian Journal of Plant Pathology, [online] 38(4), 422-429. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2016.1243583

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  13. Sivagnanam, K., Komatsu, E., Patrick, S., Rampitsch, C., Perreault, H., Gräfenhan, T. (2016). Rapid screening of ergot alkaloids in sclerotia by maldi-tof mass spectrometry, 99(4), 895-898. http://dx.doi.org/10.5740/jaoacint.16-0117

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  14. McCallum, B.D., Hiebert, C.W., Cloutier, S., Bakkeren, G., Rosa, S.B., Humphreys, D.G., Marais, G.F., McCartney, C.A., Panwar, V., Rampitsch, C., Saville, B.J., et Wang, X. (2016). « A review of wheat leaf rust research and the development of resistant cultivars in Canada. », Canadian Journal of Plant Pathology, 38(1), p. 1-18. doi : 10.1080/07060661.2016.1145598

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  15. Eranthodi, A., Subramaniam, R., Ouellet, T., Rampitsch, C., Schultz, E.A., et Foroud, N.A. (2015). « Towards the identification and characterization of pathogen-associated molecular patterns from the Fusarium graminearum secretome. », 1st Lethbridge Research Centre Graduate Student Symposium, Lethbridge, AB, Canada, November 26, 2015, Award Winning: 2nd Place for Oral Presentation.

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  16. Eranthodi, A., Subramaniam, R., Ouellet, T., Rampitsch, C., Schultz, E.A., et Foroud, N.A. (2015). « Fusarium graminearum mutant screening towards identification of pathogen-associated molecular patterns in the Fusarium head blight-wheat interaction. », 36th Annual Meeting of the Plant Pathology Society of Alberta, Lethbridge, AB, Canada, November 16-18, 2015, Oral Presentation.

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  17. Eranthodi, A., Subramaniam, R., Rampitsch, C., Ouellet, T., Schultz, E.A., et Foroud, N.A. (2015). « Generation of Fusarium graminearum mutants to screen candidate pathogen-associated molecular patterns. », National Fusarium Head Blight Forum, St. Louis, MO, USA, December 6-8, 2015. (Affiche)

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  18. Hu, J., Rampitsch, C., et Bykova, N.V. (2015). « Advances in plant proteomics toward improvement of crop productivity and stress resistance. », Frontiers in Plant Science, 6(209), p. 1-15. doi : 10.3389/fpls.2015.00209

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  19. Rampitsch, C., Günel, A., Beimcik, E., et Mauthe, W.R. (2015). « Proteome of monoclonal antibody-purified haustoria from Puccinia triticina Race-1. », Proteomics, 15(7), p. 1307-1315. doi : 10.1002/pmic.201400241

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  20. Day, J., Gietz, R.D., et Rampitsch, C. (2015). « Proteomic changes induced by Pyrenophora tritici-repentis ToxA in both insensitive and sensitive wheat indicate senescence-like signalling. », Proteome Science, 13(1: Article number 3). doi : 10.1186/s12953-014-0060-3

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Installation de recherche

101, Route 100, Unité 100
Morden, MB R6M 1Y5
Canada

Affiliations

Comité de rédaction, Proteomics.

Rédacteur adjoint (génétique microbienne, génomique et protéomique), BMC Microbiology.

Langue

Anglais

Autres langues

Deutsch