Dr Christof Rampitsch

Image Christof Rampitsch
Chercheur scientifique

Chercheur scientifique en protéomique et en spectrométrie de masse appliquée à la biologie

Recherche et / ou projets en cours

Mon programme utilise la protéomique, la peptidomique, la bioinformatique et la spectrométrie de masse appliquée à la biologie pour étudier les interactions entre les végétaux et les agents pathogènes. La recherche est principalement axée sur Puccinia triticina (rouille brune), en particulier les protéines et peptides effecteurs, et sur Fusarium graminearum, en particulier la régulation de la biosynthèse des mycotoxines.

Notre laboratoire collabore étroitement avec d’autres chercheurs qui utilisent la protéomique, mais qui n’ont pas l’expertise, l’équipement et les logiciels nécessaires pour traiter des questions biologiques complexes. À l’heure actuelle, ces projets consistent à effectuer des analyses complexes à l’aide d’étiquettes marquées par des isotopes stables, des quantifications sans étiquette et des analyses des modifications post-traductionnelles (phosphorylation et redox).

Énoncés de recherches/projets

Projets

  • Voies de signalisation des stomates pour augmenter le potentiel de rendement du blé
  • Atténuation des nouvelles menaces pour le blé au Canada
  • Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi
  • Développement de la « tolérance au froid des prairies » pour la germination et l’établissement en début de saison dans les cultures des prairies

 

Activités professionnelles / intérêts

Host-pathogen interactions

Proteomics

Peptidomics

Biological Mass Spectrometry

Prix et études

Ph.D. en phytologie, Université de la Colombie-Britannique, à Vancouver, en Colombie-Britannique, au Canada.

M.Sc. en biotechnologie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

B.Sc. (avec distinction) en biochimie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

Expérience et / ou de travail international

  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse LTQ (Thermo Training Centre, Palm Beach FL)
  • Formation sur le matériel : CLHP nano (Dionex Training Centre, Chicago IL)
  • Formation sur les logiciels : Mascot (cours MatrixScience, Savannah GA)
  • Congé sabbatique, Université de Zürich/ETH Functional Genomics Centre Zürich CH
  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse Q Exactive (Thermo, sur place)
  • Formation sur les logiciels : MaxQuant, Berlin (cours d’été)
  • Formation : imagerie MALDI, Technische Universität Wien, Autriche

Principales publications

  1. *Foroud NA, González-Peña Fundora D, Stasiuk S, Sridhar PS, Sharma T, Loewen MC, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N. Unravelling the cell wall integrity pathway of Fusarium graminearum. 12th International Congress of Plant Pathology. Paris, FRANCE. August 20-25, 2023.

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  2. *Foroud NA, González-Peña Fundora D, Stasiuk S, Eranthodi A, Ryabova D, Shostak K, Subramaniam R, Rampitsch C, Sridhar P, Sharma T, Loewen M, Thakor N. Modification of the mitogen-activation protein kinase kinase 1 (Mkk1) activation loop in Fusarium graminearum. 16th European Fungal Genetics Congress; Fusarium Workshop. Innsbruck, AUSTRIA. March 5-8, 2023. (Oral Presentation)

    2023 - Consulter les détails de la publication

  3. Natalia V. Bykova, Christof Rampitsch, Abir U. Igamberdiev, Plant proteomics: From the molecular basis of biological processes to a systems biology perspective, Journal of Plant Physiology, Volume 280, 2023, 153880, ISSN 0176-1617, https://doi.org/10.1016/j.jplph.2022.153880.

    2023 - Consulter les détails de la publication

  4. *Foroud NA, González-Peña Fundora D, Stasiuk S, Eranthodi A, Ryabova D, Shostak K, Subramaniam R, Rampitsch C, Sridhar P, Sharma T, Loewen M, Thakor N. Unravelling the cell wall integrity cascade in Fusarium graminearum. 43rd Annual Meeting of the Plant Pathology Society of Alberta. Brooks AB. November 2-4, 2022. (Oral Presentation)

    2022 - Consulter les détails de la publication

  5. Gonzàlez-Peña Fundora D, Shostak K, Subramaniam R, Eranthodi A, Rampitsch C, Thakor N, *Foroud NA. The over-expression of Fusarium graminearum MAPK, Mgv1, alters fungal biochemistry but does not affect morphocultural phenoptypes ore virulence in wheat heads. 15th European Fusarium Symposium (Virtual meeting) Ghent, Belgium. May 31 - June 1, 2021. (Oral Presentaion)

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  6. Bykova NV, Rampitsch C, McCallum B, Bakkeren G, Wang X, Huang M, Fernando U, Radovanovic N, Rampitsch M, Linning R (2021) Profiling the total and nuclear proteomes of host-pathogen interactions of the wheat Thatcher near-isogenic line for Lr2a resistance gene with virulent and avirulent races of Puccinia triticina. 4th International Plant Proteomics Organization (INPPO) Conference. Virtual Conference hosted from Winnipeg, Canada, March 9-11, 2021. Poster http://www.inppo2020.org/

    2021 - Consulter les détails de la publication

  7. Eranthodi A, Gonzàlez-Peña Fundora D, Subramaniam R, Ouellet T, Rampitsch C, Smith M, Schultz E, *Foroud NA. Role of a secreted cerato-platanin protein in growth, infection and DON accumulation by Fusarium graminearum. 41st Annual Meeting of the Plant Pathology Society of Alberta. On-line meeting, through Lethbridge AB. November 4-5, 2020. (Oral Presentation)

    2020 - Consulter les détails de la publication

  8. Gonzàlez-Peña Fundora D, Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, *Foroud NA. Characterization of Fusarium graminearum transformants over-expressing the mitogen-activated protein kinase kinase, MKK2, and a phosphomimic thereof. 41st Annual Meeting of the Plant Pathology Society of Alberta. On-line meeting, through Lethbridge AB. November 4-5, 2020. (Oral Presentation)

    2020 - Consulter les détails de la publication

  9. Wang, X., Che, M.Z., Khalil, H.B., McCallum, B.D., Bakkeren, G., Rampitsch, C., Saville, B.J. (2020). The role of reactive oxygen species in the virulence of wheat leaf rust fungus Puccinia triticina. Environmental Microbiology, [online] 22(7), 2956-2967. http://dx.doi.org/10.1111/1462-2920.15063

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  10. Rampitsch, C., Huang, M., Djuric-Cignaovic, S., Wang, X., Fernando, U. (2019). Temporal Quantitative Changes in the Resistant and Susceptible Wheat Leaf Apoplastic Proteome During Infection by Wheat Leaf Rust (Puccinia triticina). Frontiers in Plant Science, [online] 10 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2019.01291

    2019 - Consulter les détails de la publication

  11. Rampitsch M, Huang M, Zhen Y, Radovanovic N, Xu W, Rampitsch C, Bykova NV (2019). Profiling of histone acetylation and methylation marks associated with embryo and aleurone tissue-specific epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Atlanta, Georgia, June 2 - 6, 2019. Poster presentation, Abstract ID number: 299846.

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  12. Fernando, U., Chatur, S., Joshi, M., Thomas Bonner, C., Fan, T., Hubbard, K., Chabot, D., Rowland, O., Wang, L., Subramaniam, R., Rampitsch, C. (2019). Redox signalling from NADPH oxidase targets metabolic enzymes and developmental proteins in Fusarium graminearum. Molecular Plant Pathology, [online] 20(1), 92-106. http://dx.doi.org/10.1111/mpp.12742

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  13. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, González-Peña Fundora D, Schultz EA, Foroud NA. 2018. Characterization of three cysteine-rich proteins from the secretome of Fusarium graminearum. 9th Canadian Workshop of Fusarium Head Blight and the 4th Canadian Wheat Symposium Joint Meeting, Winnipeg MB, CANADA. Nov 19-22, 2018. (Oral Presentation)

    2018 - Consulter les détails de la publication

  14. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. 2018. Overexpression of the Fusarium graminearum mitogen-activated protein kinase, Mgv1, does not affect vegetative growth or virulence. 4th Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 15, 2018. Award Winning Presentation.

    2018 - Consulter les détails de la publication

  15. Eranthodi A, Subramaniam R, Ouellet T, Rampitsch C, Shostak K, González-Peña Fundora D, Schultz EA, Foroud NA. 2018. The role of three secreted cysteine-rich proteins of Fusarium graminearum fungal growth and host infection. 4th Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 15, 2018.

    2018 - Consulter les détails de la publication

  16. Bykova NV, Rampitsch M, Rampitsch C, Huang M (2018) Histone posttranslational modification landscape related to epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Poster presentation

    2018 - Consulter les détails de la publication

  17. Rampitsch C, Bykova NV, Wang X, Huang M, Djuric-Ciganovic S (2018) Candidate Effector Proteome of the apoplastic space of wheat leaves infected with leaf rust (Puccinia triticina). 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation

    2018 - Consulter les détails de la publication

  18. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. 2018. Effects of over-expressing the Mgv1 mitogen-activated protein kinase in Fusarium graminearum. 2018 Canadian Phytopathological Society Annual Meeting. Québec QC, CANADA, June 18-22, 2018. Published Abstract in the Canadian Journal of Plant Pathology. DOI:10.1080/07060661.2019.1519163

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  19. Huang M, Fernando U, Djuric-Ciganovic S, Wang X, Bakkeren G, Linning R, Bykova NV, Rampitsch C (2018) Quantitative proteomic approaches to characterize the dynamic and comprehensive defence responses of wheat to leaf rust. 66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, San Diego, CA, USA, June 3-7, 2018. Poster

    2018 - Consulter les détails de la publication

  20. González-Peña Fundora D, Subramaniam R, Rampitsch C, Eranthodi A, Thakor N, Foroud NA. 2018. MAPK overexpression in Fusarium graminearum—towards characterization of the Mgv1 signalling pathway. 14th European Fusarium Seminar, Tulln, AUSTRIA, April 8-12, 2018.

    2018 - Consulter les détails de la publication

Installation de recherche

101, Route 100, Unité 100
Morden, MB R6M 1Y5
Canada

Affiliations

Comité de rédaction, Proteomics.

Rédacteur adjoint (génétique microbienne, génomique et protéomique), BMC Microbiology.

Langue

Anglais

Autres langues

Deutsch