Dr Christof Rampitsch

Image Christof Rampitsch
Chercheur scientifique

Chercheur scientifique en protéomique et en spectrométrie de masse appliquée à la biologie

Recherche et / ou projets en cours

Mon programme utilise la protéomique, la peptidomique, la bioinformatique et la spectrométrie de masse appliquée à la biologie pour étudier les interactions entre les végétaux et les agents pathogènes. La recherche est principalement axée sur Puccinia triticina (rouille brune), en particulier les protéines et peptides effecteurs, et sur Fusarium graminearum, en particulier la régulation de la biosynthèse des mycotoxines.

Notre laboratoire collabore étroitement avec d’autres chercheurs qui utilisent la protéomique, mais qui n’ont pas l’expertise, l’équipement et les logiciels nécessaires pour traiter des questions biologiques complexes. À l’heure actuelle, ces projets consistent à effectuer des analyses complexes à l’aide d’étiquettes marquées par des isotopes stables, des quantifications sans étiquette et des analyses des modifications post-traductionnelles (phosphorylation et redox).

Énoncés de recherches/projets

Projets

  • Voies de signalisation des stomates pour augmenter le potentiel de rendement du blé
  • Atténuation des nouvelles menaces pour le blé au Canada
  • Recherche en matière de génomique intégrée, de phytopathologie et de sélection en vue de l’amélioration de la résistance des céréales canadiennes à la fusariose de l’épi
  • Développement de la « tolérance au froid des prairies » pour la germination et l’établissement en début de saison dans les cultures des prairies

 

Activités professionnelles / intérêts

Host-pathogen interactions

Proteomics

Peptidomics

Biological Mass Spectrometry

Prix et études

Ph.D. en phytologie, Université de la Colombie-Britannique, à Vancouver, en Colombie-Britannique, au Canada.

M.Sc. en biotechnologie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

B.Sc. (avec distinction) en biochimie, Université de Witwatersrand, à Johannesburg, en Afrique du Sud.

Expérience et / ou de travail international

  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse LTQ (Thermo Training Centre, Palm Beach FL)
  • Formation sur le matériel : CLHP nano (Dionex Training Centre, Chicago IL)
  • Formation sur les logiciels : Mascot (cours MatrixScience, Savannah GA)
  • Congé sabbatique, Université de Zürich/ETH Functional Genomics Centre Zürich CH
  • Formation sur le matériel : spectromètre de masse Q Exactive (Thermo, sur place)
  • Formation sur les logiciels : MaxQuant, Berlin (cours d’été)
  • Formation : imagerie MALDI, Technische Universität Wien, Autriche

Principales publications

  1. Rampitsch M, Huang M, Zhen Y, Radovanovic N, Xu W, Rampitsch C, Bykova NV (2019). Profiling of histone acetylation and methylation marks associated with embryo and aleurone tissue-specific epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics. Atlanta, Georgia, June 2 - 6, 2019. Poster presentation, Abstract ID number: 299846.

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  2. Fernando, U., Chatur, S., Joshi, M., Thomas Bonner, C., Fan, T., Hubbard, K., Chabot, D., Rowland, O., Wang, L., Subramaniam, R., Rampitsch, C. (2019). Redox signalling from NADPH oxidase targets metabolic enzymes and developmental proteins in Fusarium graminearum, 20(1), 92-106. http://dx.doi.org/10.1111/mpp.12742

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  3. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, González-Peña Fundora D, Schultz EA, Foroud NA. 2018. Characterization of three cysteine-rich proteins from the secretome of Fusarium graminearum. 9th Canadian Workshop of Fusarium Head Blight and the 4th Canadian Wheat Symposium Joint Meeting, Winnipeg MB, CANADA. Nov 19-22, 2018. (Oral Presentation)

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  4. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. 2018. Overexpression of the Fusarium graminearum mitogen-activated protein kinase, Mgv1, does not affect vegetative growth or virulence. 4th Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 15, 2018. Award Winning Presentation.

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  5. Eranthodi A, Subramaniam R, Ouellet T, Rampitsch C, Shostak K, González-Peña Fundora D, Schultz EA, Foroud NA. 2018. The role of three secreted cysteine-rich proteins of Fusarium graminearum fungal growth and host infection. 4th Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 15, 2018.

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  6. Bykova NV, Rampitsch M, Rampitsch C, Huang M (2018) Histone posttranslational modification landscape related to epigenetic regulation of seed dormancy in wheat. 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Poster presentation

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  7. Rampitsch C, Bykova NV, Wang X, Huang M, Djuric-Ciganovic S (2018) Candidate Effector Proteome of the apoplastic space of wheat leaves infected with leaf rust (Puccinia triticina). 3rd International Plant Proteomics Organization (INPPO) World Congress. Padova, Italy, September 9-12, 2018. Oral presentation

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  8. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. 2018. Effects of over-expressing the Mgv1 mitogen-activated protein kinase in Fusarium graminearum. 2018 Canadian Phytopathological Society Annual Meeting. Québec QC, CANADA, June 18-22, 2018. Published Abstract in the Canadian Journal of Plant Pathology. DOI:10.1080/07060661.2019.1519163

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  9. Huang M, Fernando U, Djuric-Ciganovic S, Wang X, Bakkeren G, Linning R, Bykova NV, Rampitsch C (2018) Quantitative proteomic approaches to characterize the dynamic and comprehensive defence responses of wheat to leaf rust. 66th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics, San Diego, CA, USA, June 3-7, 2018. Poster

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  10. González-Peña Fundora D, Subramaniam R, Rampitsch C, Eranthodi A, Thakor N, Foroud NA. 2018. MAPK overexpression in Fusarium graminearum—towards characterization of the Mgv1 signalling pathway. 14th European Fusarium Seminar, Tulln, AUSTRIA, April 8-12, 2018.

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  11. González-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, Subramaniam R, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. Over-expression of a Fusarium graminearum mitogen activated protein kinase, Mgv1. National Fusarium Head Blight Forum. Milwaukee WI, UNITED STATES, December 3-5, 2017. Poster Presentation

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  12. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, González-Peña Fundora D, Shostak K, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. The role of three small secreted cysteine-rich proteins of Fusarium graminearum on fungal growth and plant infection. National Fusarium Head Blight Forum. Milwaukee WI, UNITED STATES, December 3-5, 2017. Poster Presentation

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  13. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, González-Peña Fundora D, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Characterization of three secreted cysteine-rich proteins from the secretome of Fusarium graminearum. 3rd Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 22, 2017. (Award Winning Presentation) (Oral Presentation)

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  14. Gonzàlez-Peña Fundora D, Eranthodi A, Goyal RK, R. Subramaniam, Rampitsch C, Thakor N, Foroud NA. Generation and characterization of a Fusarium graminearum mutant overexpressing the MAPK, Mgv1. 2017 Joint Meeting of the Canadian Phytopathological Society and the Canadian Society of Agronomy. Winnipeg MB, Canada, June 18-22, 2017. Award Winning Presentation.

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  15. Sivagnanam, K., Komatsu, E., Rampitsch, C., Perreault, H., Gräfenhan, T. (2017). Rapid screening of Alternaria mycotoxins using MALDI-TOF mass spectrometry, 97(1), 357-361. http://dx.doi.org/10.1002/jsfa.7703

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  16. Eranthodi, A., Subramaniam, R., Ouellet, T., Rampitsch, C., Foroud, N.A., et Schultz, E.A. (2016). « Mutant-based screening for pathogen-associated molecular patterns involved in Fusarium head blight disease resistance in wheat. », Prairie University Biology Symposium 2016, The University of Lethbridge, Lethbridge, AB, Canada, February 18-20, 2016. (Affiche)

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  17. Gonzalez-Pena Fundora, D., Thakor, N., Subramaniam, R., Rampitsch, C., et Foroud, N.A. (2016). « Towards the identification of the Mgv1 MAPK pathway in Fusarium graminearum. », Prairie University Biology Symposium 2016, The University of Lethbridge, Lethbridge, AB, Canada, February 18-20, 2016. (Affiche)

    2016 - Consulter les détails de la publication

  18. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, Gonzàlez-Peña Fundora D, Vivar M, Zhao W, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Fusarium graminearum mutants towards identification of pathogenesis-associated molecular patterns. 2nd Lethbridge Research & Development Centre Graduate Symposium. Lethbridge AB, CANADA, November 30, 2016. Award Winning Presentation

    2016 - Consulter les détails de la publication

  19. Foroud, N.A., Eranthodi, A., Goyal, R.K., Gonzàlez-Peña Fundora, D., Zhao, W., Vivar, M., Ouellet. T., Subramaniam, R., Rampitsch, C. 2016. Characterization of a secreted Fusarium graminearum elongation factor – an elicitor of host defence? Proceedings of the 8th Canadian Workshop on Fusarium Head Blight, Ottawa, ON, November 20-22 2016. P 19. Invited Oral Presentation.

    2016 - Consulter les détails de la publication

  20. Eranthodi A, Subramaniam R, Rampitsch C, Ouellet T, Vivar M, Gonzàlez-Peña Fundora D, Zhao W, Goyal RK, Schultz EA, Foroud NA. Characterization of three Fusarium graminearum overexpression mutants and their ability to elicit host defence response in cereals. 8th Canadian Workshop of Fusarium Head Blight, Ottawa ON, CANADA, November 20-22, 2016. p.61

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Installation de recherche

101, Route 100, Unité 100
Morden, MB R6M 1Y5
Canada

Affiliations

Comité de rédaction, Proteomics.

Rédacteur adjoint (génétique microbienne, génomique et protéomique), BMC Microbiology.

Language

Anglais

Other languages

Deutsch