David De Koeyer, Ph. D.

Image David De Koeyer
Chercheur scientifique

Sélectionneur de pommes de terre et généticien. Directeur du Programme national d’amélioration de la pomme de terre d’AAC, dont les activités de recherche ont lieu aux Centres de recherche et de développement de Fredericton et de Lethbridge. 

Recherche et / ou projets en cours

Travaux de recherche liés à l’amélioration de la pomme de terre, la génomique, la génétique quantitative et la bioinformatique pour augmenter la productivité agricole et maximiser les rendements économiques pour les producteurs et autres participants de l’industrie. Développer de nouvelles variétés de pommes de terre pour renforcer la durabilité dans la production de pommes de terre.

Énoncés de recherches/projets

  • Améliorer l’efficacité de l’amélioration du matériel générique de la pomme de terre en ayant recours à de nouvelles stratégies de sélection, notamment la sélection assistée par marqueurs, la sélection génomique et la sélection diploïde;
  • Utiliser les outils de bioinformatique et de génomique pour améliorer la connaissance sur les gènes qui influent sur la tolérance aux stress abiotiques et biotiques de la pomme de terre;
  • Développer un matériel génétique de pomme de terre nouveau et amélioré afin de réduire l’incidence des maladies et des parasites de la pomme de terre importants sur le plan économique;
  • Développer des clones de pommes de terre élites avec de meilleures caractéristiques (facilité de stockage et qualité) pour la transformation et les marchés du frais;
  • Octroyer des licences d’exploitation de variétés de pommes de terre à des partenaires de l’industrie.

Activités professionnelles / intérêts

  • Collaboration avec les équipes internationales de sélection et de génétique de la pomme de terre pour développer des méthodes de sélection et du matériel génétique améliorés; 
  • Formation d’étudiants diplômés et de post-doctorants;
  • Membre de la Potato Association of America;
  • Leadership et participation dans le cadre de projets avec AAC, ainsi que des techniciens, des employés de soutien, des étudiants et des professionnels externes.

Prix et études

Ph.D. en sélection végétale, Université du Minnesota, 1996

M.Sc. en sélection végétale, Université du Minnesota, 1992

B.Sc. (Agr.) science des cultures, Université de Guelph, 1988

Expérience et / ou de travail international

2015 - 2018. Gestionnaire du projet AfricaYam, et scientifique et sélectionneur d’igname, Institut international d’agriculture tropicale, Ibadan, Nigeria.

Principales publications

  1. De Koeyer, D.L., Douglass, K., Lague, M., Bizimungu, B., Murphy, A.M., Bonierbale, M., et Mosquera, T. (2014). « Next-generation SNP genotyping platforms for characterizing potato germplasm. », dans S. Dias, E. Dulloo, N. Maxted, S. Kell, E. Thörn, L. Smith, J. Preston, S. Hutchinson (dir.) - International Conference on ENHANCED GENEPOOL UTILIZATION - Capturing wild relative and landrace diversity for crop improvement, Cambridge University Press, UK, p. 17.

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  2. Tai, H.H., De Koeyer, D.L., Goyer, C., Nolan, L., Davidson, C., Lague, M., Murphy, A.M., Sonderkaer, M., Hedegaard, S., Halterman, D., et Lehman Neilsen, K. (2014). « Expression QTL analysis of genetic variation in potato responses to Verticillium wilt. », 11th Solanaceae Conference, Porto Seguro, Brazil, November 2-6, 2014. (Résumé)

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  3. Zebarth, B.J., Tai, H.H., Luo, S., De Koeyer, D.L., et Li, X.-Q. (2014). « Gene expression-based diagnostics: A new way to optimize crop fertilizer nitrogen management? », 18th Nitrogen Workshop. The nitrogen challenge: Building blueprint for nitrogen use efficiency and food security, Lisbon, Portugal, June 30-July 3, 2014. (Résumé)

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  4. Tai, H.H., Worrall, K., Pelletier, Y., De Koeyer, D.L., et Calhoun, L.A. (2014). « Comparative metabolite profiling of solanum tuberosum against six wild solanum species with Colorado potato beetle resistance. », Journal of Agricultural and Food Chemistry, 62(36), p. 9043-9055. doi : 10.1021/jf502508y

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  5. Xiang, H., Zhang, R., De Koeyer, D.L., Pan, G., Li, T., Liu, T., et Zhou, Z. (2014). « New evidence on the relationship between Microsporidia and Fungi: A genome-wide analysis by DarkHorse software. », Canadian Journal of Microbiology, 60(9), p. 557-568. doi : 10.1139/cjm-2014-0209

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  6. Peters, R.D., Al-Mughrabi, K.I., Kalischuk, M.L., Dobinson, K.F., Conn, K.L., Alkher, H.A., Islam, M.R., Daayf, F., Lynn, J., Bizimungu, B., De Koeyer, D.L., Lévesque, C.A., et Kawchuk, L.M. (2014). « Characterization of Phytophthora infestans population diversity in Canada reveals increased migration and genotype recombination. », Canadian Journal of Plant Pathology, 36(1), p. 73-82. doi : 10.1080/07060661.2014.892900

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  7. Lindqvist-Kreuze, H., Gastelo, M., Pérez, W., Forbes, G., De Koeyer, D.L., et Bonierbale, M. (2014). « Phenotypic stability and genome wide association study of late blight resistance in potato genotypes adapted to the tropical highlands. », Phytopathology, 104(6), p. 624-633. doi : 10.1094/PHYTO-10-13-0270-R

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  8. Caraza, M., De Koeyer, D.L., Mihovilovich, E,, Bonierbale, M., et Wang-Pruski, G. (2013). « Identification of candidate genes associated with photoperiod for improving adaptation of potatoes to diverse environments. », 9th Canadian Plant Genomics Workshop, Halifax, NS, Canada, August 12-15, 2013.

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  9. Tai, H.H., De Koeyer, D.L., Goyer, C., Sønderkær, M., Hedegaard, S., Nolan, L., Laguë, M., Murphy, A.M., et Nielsen, K.L. (2013). « Analysis of genetic variation in gene expression associated with Verticillium dahliae infection in potato. », 10th Solanaceae Conference, Beijing, China, October 13-17, 2013.

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  10. Mihovilovich, E,, De Koeyer, D.L., et Bonierbale, M. (2013). « Response of short day-length adapted potato breeding lines to long photoperiod. », 97th Annual Meeting of the Potato Association of America (PAA), Québec City, QC, Canada, July 28-August 2, 2013.

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  11. Tai, H.H., Goyer, C., Platt, H.W., De Koeyer, D.L., Murphy, A.M., Uribe, P., et Halterman, D. (2013). « Decreased defense gene expression in a potato clone with tolerance to Verticillium dahliae. », 9th Canadian Plant Genomics Workshop, Halifax, NS, Canada, August 12-15, 2013.

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  12. Tai, H.H., Worrall, K., Pelletier, Y., De Koeyer, D.L., et Calhoun, L.A. (2013). « Metabolites from CPB-resistant wild Solanum species. », 97th Annual Meeting of the Potato Association of America (PAA), Québec City, QC, Canada, July 28-August 2, 2013.

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  13. Li, X.-Q., Xu, C., Liu, X., Haroon, M., Liu, J., Xie, C.Y., Meng, F., De Koeyer, D.L., Leclerc, Y., Donnelly, D.J., et Murphy, A.M. (2013). « Identification of the major enzyme and genes controlling cold sweetening in potato tubers during storage. », 97th Annual Meeting of the Potato Association of America (PAA), Québec City, QC, Canada, July 28-August 2, 2013, Oral presentation.

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  14. Goyer, C., Tai, H.H., Gustafson, V., De Koeyer, D.L., et Rothwell, C. (2013). « Analysis of gene expression of two potato cultivars during common scab infection using microarrays. », 97th Annual Meeting of the Potato Association of America (PAA), Québec City, QC, Canada, July 28-August 2, 2013.

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  15. Tai, H.H., Goyer, C., Platt, H.W., De Koeyer, D.L., Murphy, A.M., Uribe, P., et Halterman, D. (2013). « Decreased defense gene expression in tolerance versus resistance to Verticillium dahliae in potato. », Functional and Integrative Genomics, 13(3), p. 367-378. doi : 10.1007/s10142-013-0329-0

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  16. Wang-Pruski, G., Babin, S., Murphy, P., Kong, F., Wu, Y., Douglass, K., Murphy, A.M., De Koeyer, D.L., et Pinto, D.M. (2012). « Identification of Genes and Gene Markers by Genomics, Genome Mapping and Comparative Proteomics and Their Relationship to Potato Tuber Qualities. », Acta Horticulturae (ISHS), 929, p. 237-244.

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  17. Tai, H.H., Zebarth, B.J., Luo, S., Li, X.-Q., Millard, P., De Koeyer, D.L., et Xiong, X. (2012). « Development of gene expression indicators for nitrogen sufficiency in potato plants. », Potato Association of America Annual meetings, Denver, Colorado, USA.

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  18. De Koeyer, D.L., Nie, X., Douglass, K., Laguë, M., Gustafson, V., Albert, L., et Singh, M. (2012). « Next Generation Sequencing for Detection of Viruses Infecting Potato. », 96th Annual Meeting of the Potato Association of America (PAA), Crowne Plaza Denver International Airport, Denver, CO, USA, August 12-16, 2012, Amer. J. Potato Res. (2013) 90:129-130.

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  19. Tai, H.H., Worrall, K., De Koeyer, D.L., Pelletier, Y., et Calhoun, L.A. (2012). « Comparative gene expression profiling of diploid potato parents with variation in susceptibility to verticillium wilt and eqtl mapping of the progeny. », 9th Solanaceae Conference (SOL 2012), University of Neuchâtel, Neuchâtel, Switzerland, August 25-30, 2012, Oral presentation, p. 91.

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  20. Tai, H.H., Worrall, K., De Koeyer, D.L., Pelletier, Y., et Calhoun, L.A. (2012). « Metabolomics and transcriptomics of Colorado Potato Beetle resistance in wild Solanum species. », 9th Solanaceae Conference (SOL 2012), University of Neuchâtel, Neuchâtel, Switzerland, August 25-30, 2012, P65, p. 207. (Affiche)

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Installation de recherche

95 chemin Innovation
PO Box 20280
Fredericton, NB E3B 4Z7
Canada

Affiliations

Professeur adjoint à la Faculté de l’Agriculture, Université Dalhousie;

Membre du corps professoral externe, Université du Maine

Language

Anglais