D. Wade Abbott, Ph. D.

Image Wade Abbott
Chercheur scientifique

Votre rôle

Glycomique agricole

Génomique fonctionnelle de l’utilisation des glucides

Microbiomes intestinaux

Enzymes glucidiques

Agriculture et Agroalimentaire Canada
5403-1ère Avenue, Lethbridge, Alberta

Recherche et / ou projets en cours

  1. Chercheur principal. Abbott DW, Zandberg WF, Inglis GD, TA, T, Thomas, D., Ortega Polo, R. Titre : Muco-Screen: A platform technology to evaluate commercial and agriproduct based inhibitors for mitigation of necrotic enteritis in broiler chickens (Muco-Screen : Plateforme technologique pour évaluer les inhibiteurs commerciaux et ceux à base de produits agricoles dans l’atténuation de l’entérite nécrotique chez les poulets de chair). Agriculture et foresterie 325 000 $, avril 2020 – mars 2023.

  2. Co-demandeur. Beauchemin, K, McAllister, TW, Abbott, DW, Gruninger, R. Seaweeds and seaweed-ingredients to reduce enteric methane emissions from pasture-based sheep, cattle, and dairy cows (SeaSolutions) (Algues marines et ingrédients à base d’algues marines pour réduire les émissions entériques de méthane chez les bovins, les ovins et les vaches laitières en pâturage [SeaSolutions]). Services votes : 500 000 $, avril 2019 – mars 2022.

  3. Co-demandeur. Inglis, GD, Abbott, DW, Carrillo, C, Hodges, L, Richman, M. Rationale-based mitigation of relevant Campylobacter jejuni strains within the broiler production continuum (Atténuation rationnelle des souches de Campylobacter jejuni pertinentes dans le continuum de la production de poulets de chair). CA2 Grappe de la volaille 559 000 $, avril 2018 – mars 2023.

  4. Co-chercheur principal. Zandberg, WF, Abbott, DW, Inglis, GD, Boraston, AB, Smith, SP, Capicciotti, C. Mitigation of Necrotic Enteritis by improving the Integrity of intestinal mucin through small molecules and stress management (Atténuation de l’entérite nécrotique par l’amélioration de l’intégrité de la mucine intestinale grâce aux petites molécules et à la gestion du stress). GlycoNet 370 000 $, avril 2020 – mars 2022.

  5. Co-demandeur. Brumer H, Inglis, GD (Co-PI), Abbott, DW, Sheedy, C, Boras, V. Sly, L. Titre : Development of next-generation glyco-caged drugs to treat enteric inflammatory diseases in humans and livestock (Mise au point d’une nouvelle génération de médicaments entourés d’une structure de protection glucidique pour le traitement de maladies inflammatoires chez l’humain et le bétail). GlycoNet 400 000 $, avril 2020 –mars 2022.

  6. Chercheur principal. Abbott DW, Beauchemin, K, McAllister, TA, T, Thomas, D., Ortega Polo, R. Titre : Structural and functional characterization of bovine rumen microbiomes adapted to the consumption of seaweed in natural and farm-intensive systems (Caractérisation structurale et fonctionnelle des microbiomes du rumen des bovins adaptés à la consommation d'algues dans les systèmes naturels et les systèmes d'élevage intensif). Services votés – AAC 360 000 $, avril 2019 – mars 2022.

  7. Chercheur principal. Abbott DW, Alexander, T, Thomas, D. Titre : Evidence-based prebiotic-probiotic solutions for improving gut health and feed efficiency in cattle (Solutions prébiotiques et probiotiques démontrées pour améliorer la santé intestinale et l’efficacité alimentaire du bétail). Conseil de recherche sur le bœuf et le bétail. Conseil de recherche sur les bovins de boucherie 576 000 $, avril 2018 – mars 2023.

  8. Chercheur principal. Abbott DW, Inglis GD, Slominski B. Titre : Discovery pipeline for rapid development of tailored fibrolytic enzymes that improve the digestibility of canola meal for monogastric livestock (Pipeline de découverte pour la mise au point rapide d’enzymes fibrolytiques adaptées qui améliorent la digestibilité du tourteau de canola chez le bétail monogastrique). Agriculture Funding Consortium. 234 600 $ avril 2018 – mars 2020.

  9. Co- chercheur principal. McAllister, TA (PI), Abbott, DW (Co-PI), Yang WZ. Titre : Development of novel feed enzymatic products to enhance ruminal digestion of low quality forage fiber (Mise au point de nouveaux produits enzymatiques pour les aliments du bétail destinés à améliorer la digestion ruminale des fibres fourragères de faible qualité). Ministère de l’Agriculture et des Forêts de l’Alberta. 315 000 $, avril 2018 – mars 2020.

Énoncés de recherches/projets

Glycomique agricole

Génomique fonctionnelle de l’utilisation des glucides

Microbiomes intestinaux

Enzymes glucidiques

Prix et études

Doctorat en biochimie, Université de Victoria (2005). Sa thèse de doctorat (Université de Victoria) lui a permis de recevoir la médaille d’or du gouverneur général (2006) et lui a valu une mise en candidature pour la médaille d’argent du CRSNG (2006).

Baccalauréat ès sciences (mention d’excellence), biologie (majeure), géographie (spécialisation), Université Trinity Western (2000).

Principales publications

  1. McLean, R., Hobbs, J.K., Suits, M.D., Tuomivaara, S.T., Jones, D.R., Boraston, A.B., et Abbott, D.W. (2015). « Functional analyses of resurrected and contemporary enzymes illuminate an evolutionary path for the emergence of exolysis in polysaccharide lyase family. », Journal of Biological Chemistry, 290(35), p. 21231-21243. doi : 10.1074/jbc.M115.664847

    2015 - Consulter les détails de la publication

  2. Cuskin, F., Lowe, E.C., Temple, M.J., Zhu, Y., Cameron, E.A., Pudlo, N.P., Abbott, D.W., et les autres (2015). « Human gut Bacteroidetes can utilize yeast mannan through a selfish mechanism. », Nature, 517(7533), p. 165-169. doi : 10.1038/nature13995

    2015 - Consulter les détails de la publication

  3. Abbott, D.W., Martens, E.C., Gilbert, H.J., Cuskin, F., et Lowe, E.C. (2015). « Coevolution of yeast mannan digestion: Convergence of the civilized human diet, distal gut microbiome, and host immunity. », Gut Microbes, 6(5), p. 334-339. doi : 10.1080/19490976.2015.1091913

    2015 - Consulter les détails de la publication

  4. Abbott, D.W., Farnell, B.J., et Yamashita, J.W. (2014). « Pectins: structure, function, and the human distal gut microbiota. », - Pectin: Chemical Properties, Uses and Health Benefits, Nova Publishers.

    2014 - Consulter les détails de la publication

  5. Thomas, D.K., Lone, A.G., Selinger, L.B., Taboada, E.N., Uwiera, R.R.E., Abbott, D.W., et Inglis, G.D. (2014). « Comparative Variation within the Genome of Campylobacter jejuni NCTC 11168 in Human and Murine Hosts. », PLoS ONE, 9(2:e88229). doi : 10.1371/journal.pone.0088229

    2014 - Consulter les détails de la publication

  6. Abbott, D.W. et Lammerts van Bueren, A. (2014). « Using structure to inform carbohydrate binding module function. », Current Opinion in Structural Biology, 28, p. 32-40. doi : 10.1016/j.sbi.2014.07.004

    2014 - Consulter les détails de la publication

  7. Abbott, D.W., Thomas, D.K., Pluvinage, B., et Boraston, A.B. (2013). « An ancestral member of the polysaccharide Lyase Family 2 displays endolytic activity and magnesium dependence. », Applied Biochemistry and Biotechnology, 171(7), p. 1911-1923. doi : 10.1007/s12010-013-0483-9

    2013 - Consulter les détails de la publication

  8. Pluvinage, B., Chitayat, S., Ficko-Blean, E., Abbott, D.W., Kunjachen, J.M., Grondin, J., Spencer, H.L., Smith, S.P., et Boraston, A.B. (2013). « Conformational Analysis of StrH, the Surface-Attached exo-β-D-N-Acetylglucosaminidase from Streptococcus pneumoniae. », Journal of Molecular Biology, 425(2), p. 334-349. doi : 10.1016/j.jmb.2012.11.005

    2013 - Consulter les détails de la publication

  9. Abbott, D.W. et Boraston, A.B. (2012). « Quantitative approaches to the analysis of carbohydrate-binding module function in “Cellulases (Glycoside Hydrolases). », dans Gilbert, H.J. (dir.) - Methods in Enzymology, Elsevier, p. 211-231.

    2012 - Consulter les détails de la publication

  10. Boraston, A.B. et Abbott, D.W. (2012). « Structure of a pectin methylesterase from Yersinia enterocolitica. », Acta Crystallographica Section F, 68(2), p. 129-133. doi : 10.1107/S1744309111055400

    2012 - Consulter les détails de la publication

  11. Martens, E.C., Lowe, E.C., Chiang, H., Pudlo, N.P., Wu, M., McNulty, N.P., Abbott, D.W., Henrissat, B., Gilbert, H.J., Bolam, D.N., et Gordon, J.I. (2011). « Recognition and degradation of plant cell wall polysaccharides by two human gut symbionts. », PLoS Biology, 9(12, Article No. e1001221). doi : 10.1371/journal.pbio.1001221

    2011 - Consulter les détails de la publication

  12. Pluvinage, B., Lowe, E.C., Higgins, M.A., Abbott, D.W., Robb, C., Dalia, A.B., Deng, L., Weiser, J.N., Parsons, T.B., Fairbanks, A.J., Vocadlo, D.J., Boraston, A.B. (2011). « Inhibition of the pneumococcal virulence factor StrH and molecular insights into N-glycan recognition and hydrolysis. », Structure, 19(11), p. 1603-1614. doi : 10.1016/j.str.2011.08.011

    2011 - Consulter les détails de la publication

  13. Abbott, D.W. et Boraston, A.B. (2011). « Structural analysis of a putative family 32 carbohydrate-binding module from the Streptococcus pneumoniae enzyme, EndoD. », Acta Crystallographica Section F, 67(4), p. 429-433. doi : 10.1107/S1744309111001874

    2011 - Consulter les détails de la publication

  14. Abbott, D.W., Gilbert, H.J., et Boraston, A.B. (2010). « The Active Site of Oligogalacturonate Lyase Provides Unique Insights into Cytoplasmic Oligogalacturonate β-Elimination. », Journal of Biological Chemistry, 285(50), p. 39029-39038. doi : 10.1074/jbc.M110.153981

    2010 - Consulter les détails de la publication

  15. Correia, M.A.S., Abbott, D.W., Gloster, T.M., Fernandes, V.O., Prates, J.A.M., Montanier, C., Dumon, C., Williamson, M.P., Tunnicliffe, R.B., Liu, Z., Flint, J.E., Davies, G.J., Henrissat, B., Coutinho, P.M., Fontes, C.M.G.A., et Gilbert, H.J. (2010). « Signature active site architectures illuminate the molecular basis for ligand specificity in family 35 carbohydrate binding modules. », Biochemistry, 49(29), p. 6193-6205. doi : 10.1021/bi1006139

    2010 - Consulter les détails de la publication

  16. Abbott, D.W., Higgins, M.A., Hyrnuik, S., Pluvinage, B., Lammerts van Bueren, A., et Boraston, A.B. (2010). « The molecular basis of glycogen breakdown and transport in Streptococcus pneumonia. », Molecular Microbiology, 77(1), p. 183-199. doi : 10.1111/j.1365-2958.2010.07199.x

    2010 - Consulter les détails de la publication

  17. Abbott, D.W. et Boraston, A.B. (2009). « Interactions between proteins and (1,3)-beta-glucans and related polysaccharides. », dans Bacic, A., Fincher, G., and Stone, B. (dir.) - Chemistry, Biochemistry, and Biology of 1-3 Beta Glucans and Related Polysaccharides, Academic Press, Chapitre 5, p. 179-207.

    2009 - Consulter les détails de la publication

  18. Ishibashi, T., Li, A., Eirín-López, J.M., Zhao, M., Missiaen, K., Abbott, D.W., Meistrich, M., Hendzel, M.J., et Ausió, J. (2010). « H2A.Bbd: an X-chromosome-encoded histone involved in mammalian spermiogenesis. », Nucleic Acids Research, 38(6), p. 1780-1789. doi : 10.1093/nar/gkp1129

    2009 - Consulter les détails de la publication

  19. Abbott, D.W., Ficko-Blean, E., Lammerts van Bueren, A., Rogowski, A., Cartmell, A., Coutinho, P.M., Henrissat, B., Gilbert, H.J., et Boraston, A.B. (2009). « Analysis of the structural and functional diversity of plant cell wall specific family 6 carbohydrate binding modules. », Biochemistry, 48(43), p. 10395-10404. doi : 10.1021/bi9013424

    2009 - Consulter les détails de la publication

  20. Higgins, M.A., Abbott, D.W., Boulanger, M.J., et Boraston, A.B. (2009). « Blood group antigen recognition by a solute-binding protein from a serotype 3 strain of Streptococcus pneumoniae. », Journal of Molecular Biology, 388(2), p. 299-309. doi : 10.1016/j.jmb.2009.03.012

    2009 - Consulter les détails de la publication

Contact

Installation de recherche

Centre de recherche et de développement de Lethbridge
5403 1st Avenue South
Lethbridge, AB T1J 4B1
Canada

Expertise

Aliments›Microbiologie›Probiotiques
Sciences›Biologie
Technologie›Microbiologie

Affiliations

Université de Lethbridge, départements de sciences biologiques, de chimie et de biochimie

Canadian Glycomics Network (chercheur)

Alberta Glycomics Centre (chercheur associé)

Langue

Anglais