Clifford Clark

Image Sarah London
Chercheur scientifique, Division des maladies entériques

Recherche sur les agents pathogènes entériques et leur impact sur la population humaine

Recherche et / ou projets en cours

Le Dr Clark s’intéresse à tous les aspects de la biologie des agents pathogènes entériques qui peuvent affecter l’introduction de ces agents dans la population humaine pour provoquer des maladies. Ses recherches visent à comprendre les propriétés génétiques ou adaptatives des bactéries entériques pathogènes qui leur permettent de traverser la chaîne alimentaire, ainsi que les facteurs de virulence ou autres facteurs adaptatifs associés aux maladies humaines courantes ou graves. Dans ses recherches, il vise à fournir des renseignements utiles pour déterminer la structure de la population des agents pathogènes, et améliorer les évaluations des risques ou les interventions pour réduire les maladies humaines.

Énoncés de recherches/projets

  • Séquençage du génome et analyse de la nouvelle variante monophasique de Salmonella Typhimurium, et de la salmonelle, pour élaborer la première description claire du fonctionnement de ces agents pathogènes entériques.
    • On s’attend à ce que les données permettent de comprendre la proportion de la charge de morbidité causée par ces variantes et comment et pourquoi ces organismes sélectionnés contribuent aux maladies humaines.
    • Des marqueurs génomiques trouvés sont associés à l’introduction de ces éléments utiles pour la surveillance et les enquêtes sur les épidémies.
    • Les marqueurs visibles dans les séquences entières du génome sont précieux pour suivre et contrôler ces agents pathogènes.
  • Des variantes de protéines de type transducteur peuvent être un marqueur important des effets des isolats de Campylobacter jejuni sur la population humaine.
    • Les espèces de campylobacter sont les agents pathogènes bactériens les plus couramment associés aux maladies entériques humaines dans le monde entier, et ont de graves conséquences sur les maladies.
    • Des efforts sont déployés pour déterminer la teneur en Tlp des isolats provenant de différentes sources animales et environnementales.
    • Les récents travaux publiés par le laboratoire ont d’abord décrit la variabilité au sein de chaque type de Tlp.

Activités professionnelles / intérêts

Prend la parole lors de réunions et de conférences au Canada et aux États-Unis.

Prix et études

Éducation

Boursier postdoctoral du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, 1995

Boursier postdoctoral du ministère de la Santé de l’Ontario, 1993

Doctorat en microbiologie médicale et maladies infectieuses, Université de l’Alberta, 1992

Maîtrise en génétique bactérienne, Université de Calgary, 1985.

Baccalauréat en biologie cellulaire et microbienne, Université de Calgary, 1979.

Prix

Bourse postdoctorale du Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, 1993-1995.

Boursier postdoctoral du ministère de la Santé de l’Ontario, 1992-1993.

Bourse d’études supérieures de l’Alberta Heritage Foundation for Medical Research, 1989-1991.

Expérience et / ou de travail international

Membre de l’American Society for Microbiology.

Mise en œuvre d’instruments de détermination automatisée de la résistance aux antimicrobiens compatibles avec ceux utilisés par NARMS aux États-Unis, ce qui a grandement facilité l’échange des données entre les États-Unis et le Canada.

Principales publications

Clark C, Berry C, Demczuk W. 2019. Diversity of transducer-like proteins (Tlps) in Campylobacter. PLoS One. 2019 Mar 25;14(3):e0214228

http://doi.org/10.1371/journal.pone.0214228

Clark CG, Chen CY, Berry C, Walker M, McCorrister SJ, Chong PM, Westmacott GR. 2018. Comparison of genomes and proteomes of four whole genome-sequenced Campylobacter jejuni from different phylogenetic backgrounds. PLoS One. 2018 Jan 2;13(1):e0190836. 

http://doi.org/10.1371/journal.pone.0190836   

Clark CG, Berry C, Walker M, Petkau A, Barker DOR, Guan C, Reimer A, Taboada EN. 2016, Genomic insights from whole genome sequencing of four clonal outbreak Campylobacter jejuni assessed within the global C. jejuni population. BMC Genomics 17:990.

http://doi.org/10.1186/s12864-016-3340-8  

Clark CG, Chong P, McCorrister SJ, Mabon P, Westmacott GR. 2014. DNA sequence heterogeneity of Campylobacter jejuni CJIE4 prophages and expression of prophage genes. PLoS One 9(4):e95349

http://doi.org/10.1371/journal.pone.0095349

Clark CG, Chong P, McCorrister SJ, Simon P, Walker M, Lee DM, Nguy K, Cheng K, Gilmour MW, Westmacott GR. 2014. The CJIE1 prophage of Campylobacter jejuni affects protein expression in growth media with and without bile salts. BMC Microbiol 14:70.

http://doi.org/10.1186/1471-2180-14-70

Clark CG, Kruczkiewicz P, Guan C, McCorrister SJ, Wylie J, van Caeseele P, Tabor H, Snarr P, Taboada EN, Westmacott GR, Gilmour MW. 2013. Evaluation of MALDI-TOF mass spectroscopy methods for determination of Escherichia coli pathotypes. J. Microbiol. Methods 94:180-191.

http://doi.org/10.1016/j.mimet.2013.06.020

Clark CG, Grant CCR, Pollari F, Marshall B, Moses J, Tracz DM, Gilmour M. 2012. Effects of the Campylobacter jejuni CJIE1 prophage homologs on affect adherence and invasion in culture, patient symptoms, and source of infection. BMC Microbiol 12:269

http://doi.org/10.1186/1471-2180-12-269