Cathryn Abbott

Image Abbott, Cathryn
Chercheur scientifique

Science réglementaire et stratégique, axée sur : (1) le développement et l’application d’outils environnementaux d’ADN pour la biosurveillance; et (2) la détection moléculaire des agents pathogènes d’animaux aquatiques réglementés.

Recherche et / ou projets en cours

Dr Abbott a dirigé plusieurs projets sur le développement d’outils d’ADN environnemental (ADNe) et s’intéresse vivement à leur mise en œuvre pour appuyer la prise de décisions. Elle est également experte en laboratoire de référence de l’Organisation mondiale de la santé animale (pour l’infection à Mikrocytos mackini) et gestionnaire technique dans un laboratoire de diagnostic moléculaire réglementaire ISO 17025 du Programme national sur la santé des animaux aquatiques du Canada.

Énoncés de recherches/projets

  • Le laboratoire de Dr Abbott a mis au point un portail en ligne (https://NAMERS.ca) Novel Applied eDNA Metabarcoding Reference Sequences qui contient les mitogénomes de tous les poissons d’eau douce de la Colombie-Britannique; fournit des données de référence complètes et facilement accessibles pour la conception d’enquêtes ADNe défendables et l’analyse des données
  • Le laboratoire de Dr Abbott a mis au point des méthodes de métacodage à barres de l’ADNe pour l’étude des zones de protection marine du Canada
  • Le laboratoire du Dr Abbott a validé une méthode d’ADNe pour la détection qPCR du crabe vert européen 
  • Dr Abbott a corédigé un avis scientifique officiel sur l’analyse ciblée de l’ADNe afin d’éclairer la gestion des espèces aquatiques envahissantes et des espèces en péril (https://publications.gc.ca/collections/collection_2021/mpo-dfo/fs70-5/Fs70-5-2021-019-fra.pdf)
  • Dr Abbott a été membre du comité technique de l’Association canadienne de normalisation pour l’élaboration d’une norme nationale sur les critères de performance pour les analyses environnementales de l’ADN et de l’ARN par réaction en chaîne de la polymérase quantitative ciblée (accessible au public d’ici la fin de 2023).

Prix et études

Ph.D. Écologie, évolution et systématique (2005) Université nationale australienne

B.Sc.H, biologie (1997) Université Queen’s

Prix de distinction du sous-ministre adjoint du MPO 2022 

Prix d’excellence de la fonction publique 2016 

Expérience et / ou de travail international

Dr Abbott est expert en laboratoire de référence de l’Organisation mondiale de la santé animale pour l’infection par Mikrocytos mackini (un parasite protistanique des huîtres), collabore avec des scientifiques américains à des travaux liés à l’élaboration d’une stratégie nationale sur l’ADNe pour les États-Unis et est membre du Groupe de travail international sur la normalisation de l’ADNe.

Principales publications

  1. Sequence homogeneity of internal transcribed spacer rDNA in Mikrocytos mackini and detection of Mikrocytos sp. in a new location
  2. Twelve microsatellite markers in the invasive tunicate, Didemnum vexillum, isolated from low coverage 454 pyrosequencing reads
  3. Development of a SNP-based genetic marker system based on variation in microsatellite flanking regions of Phytophthora infestans
  4. A New Genus and Species of Gyrodactylid (Monogenea) From Silver Hake, Merluccius Bilinearis, in the Bay of Fundy, New Brunswick, Canada
  5. The placement of Gyrodactylus salmonis (Yin and Sproston) in the molecular phylogeny of studied members of the Gyrodactylus (Monogenea) wageneri-group parasitizing salmonids.
  6. Health status of Olympia Oysters (Ostrea lurida) in British Columbia, Canada.
  7. Initial investigation of population and conservation genetics in the coastal giant salamander, Dicamptodon tenebrosus, using microsatellite markers.
  8. A global assessment of the impact of fisheries-related mortality on shy and white-capped albatrosses: conservation implications
  9. Molecular provenance analysis for shy and white-capped albatrosses killed by fisheries interactions in Australia, New Zealand, and South Africa
  10. Copulation behaviour and paternity in shy albatrosses (Thalassarche cauta)
  11. An unusual source of apparent mitochondrial heteroplasmy: Duplicate mitochondrial control regions in Thalassarche albatrosses
  12. Phylogeography of shy and white-capped albatrosses inferred from mitochondrial DNA sequences: implications for population history and taxonomy
  13. Genetic structure, conservation genetics and evidence of speciation by range expansion in shy and white-capped albatrosses
  14. Morphometric comparison of Australian Shy and New Zealand White-capped Albatrosses
  15. Hierarchical analysis of population structure in the noisy miner using DNA microsatellite markers