Bourlaye Fofana, Ph.D.

Image Bourlaye Fofana
Chercheur Scientifique

Physiologie Moléculaire et Génomique Végétale

Recherche et / ou projets en cours

Projets actuels

1. 2019-2023  J-002269 – Evaluate effects of  manure application in combination  with cover on  plant endophytes using metagenomics, PEI Living Labs project - Using living laboratory approach to develop and transfer innovative soil and water quality BMPs in Prince Edward Island, $102,700

2. 2019- 2022  J-002235 – Quality attributes in small fruit crops - Improvement of quality attributes in strawberry, raspberry and blackberry using metabolomic and genomic approaches, $40,000

3. 2019-2023  J-002214 – Lupuloides hops development - Evaluating phytochemical and agronomic traits of native hops (Humulus lupulus ssp lupuloides) for Eastern Canadian production systems, $33,360

4. 2018-2021    J-001776 – Cover Crops, Disease & Soil Biodiversity - Impact of cover cropping on soil microbial biodiversity, disease and pathogen load. Adam Forster (Lead), $100,000

5. 2018-2023  J-002035 – ASC-05 Diverse FC Cluster Activity 4A - ASC-05 Diverse FC Cluster Activity 4A: Genomics and molecular markers to identify resistance genes in flax, $80,000.

 

Projets récemment complétés

6. 2015-2019  J-000991 – Integrated research-development-technology-transfer approach to enhance productivity and sustainability of potato production in Canada, $340,000

7. 2015-2018  J-001005 –Developing eastern hop (Humulus lupulus var. lupuloides) germplasm resources for improved quality traits and disease resistance, $36,000

8. 2013-2017  J-000916 – Understanding the bio-insecticidal properties of buckwheat for wireworm control and the benefits associated with growing it as a rotation crop/Understanding the microbial diversity in the buckwheat rhizosphere when compared to other rotation crops and to understand the potential interactions between the plant, the soil microbiomes and wireworm.. $ 121,300

9. 2013-2016.  J-000076 – Development of a proof-of-concept for the generation and use of mutagenized dihaploid potato lines for accelerated breeding of potato cultivars low in glycoalkaloid content and acrylamide in processed product, $121,000

10 2009-2014 – Flax Total Utilization Flax GENomics (TUFGEN) project/. Flax lignan biosynthesis, bioavailability and bioactivity, $308,750.

11. 2009-2011 – Rosehip – Innovative Canadian bioActives and Nutraceuticals  (ICAN)-rosehip project”/Rosehip genomic and germplasm characterization aspects, $316,569; Dr. Fofana : $194,269 (RBPI #1636).

Énoncés de recherches/projets

Le programme de recherche de Dr. Fofana est axé sur le développement et la caractérisation des ressources phylogénétique pour l’amélioration génétique des cultures, sur le développement de bioprocédés et de ressources génomiques à partir de ressources phylogénétiques et microbiennes pour la mise à disposition des améliorateurs, des biologistes et de l’industrie agroalimentaire, de la santé et du bien-être, de ressources végétales oléagineuses et horticoles, et de bioproduits à hautes valeurs ajoutées.  Il utilise la physiologie moléculaire, la génomique et la metagénomique comme outils pour atteindre ses objectifs incluant:

  • Remodelage des cultures

  • Re-ingénierie de voies métaboliques

  • Qualité des graines

  • Ingénierie ds biomasses de biocarburants

  • Qualité Pre- et post-recolte

  • Developpement de ressources phytogénétiques

Activités professionnelles / intérêts

Fonctions éditoriales

  • Editeur Technique, Section Horticulture, Canadian Journal of Plant Science  2019-present

  • Editeur Associé, Botany  2018-present

  • Editeur Associé, Canadian Journal of Plant Science  2016-present

  • Réviseur Invité  pour de nombreux journaux scientifiques

Prix et études

Education

2006   Certification en Enseignement Superieur (CHET)- Université du Manitoba, Winnipeg, Canada

1999    PhD, Biologie et génétique moleculare végétale -Université Agronomique de Gembloux ,Belgium

1995    MSc, Biologie et génétique moleculare végétale -Université Agronomique de Gembloux ,Belgium

1993    AEA, Amélioration des plantes- Université Nationale  de Côte d’Ivoire, Abidjan, Côte d’Ivoire

1992    Msc, Génétique – Université Nationale  de Côte d’Ivoire, Abidjan,Côte d’Ivoire

1991,   Bsc, Biologie et Cciences Naturelles- Université Nationale  de Côte d’Ivoire, Abidjan,Côte d’Ivoire

 

Prix décernés

Bourse de Recherches, Conseil de recherches en sciences naturelles et en génie du Canada, 2002-2005

Prix de recherche, Prix du Secrétaire d’Etat Belge pour la coopération au développement , 1998

Bourse de voyage, Fonds National Belge pour la recherche Scientifique, 1998

Bourse d'études étrangères, Gouvernement Ivoirien, Ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche scientifique, 1993 – 1999.

Expérience et / ou de travail international

Conseiller Volontaire - CESO-SACO: Missions de travail au Burkina Faso et en Côte d’Ivoire, 2017, 2018.

Principales publications

  1. Mutational genetics in the CRISPR era: where do we stand at AAFC?

    2022 - View publication details

  2. Gene expression study of the flax-powdery mildew interaction

    2021 - View publication details

  3. The Search for Powdery Mildew Resistance Genes in Flax

    2021 - View publication details

  4. The Search for Powdery Mildew Resistance Genes in Flax

    2020 - View publication details

  5. Till BJ, Aravena Abarzua GA, Howard-Till R, Qian R, Gajardo H, Cloutier S, Fofana B, Soto-Cerda BJ (2020) Genomic improvement of flax using natural variation and induced mutations. Proc 28th Plant and Animal Genome Conference, San Diego, USA, Jan 11-15, W436

    2020 - View publication details

  6. Cultivated potato (Solanum tuberosum L.) is the third most consumed food crop after rice and wheat. Potato is an auto tetraploid crop species having a highly heterozygous genetic base and a complex genome making its genetic studies tedious. Recently, diploid potato breeding has regained interest in the potato genetics community. Genetically, diploid potatoes are easy to work with and can be used in the cultivated potato breeding process as genetic resources and also they can be grown on their own as varieties. However, diploid breeding continuum faces many challenges including anti-nutritional factors and self-incompatibilities. Whereas conventional breeding strategies contributed to the releasing of varieties with low SGA, substantial resources are still required to minimizing these anti-nutritional factors. Recently, we developed and characterized an ethyl methane sulfonate mutagenized pre-breeding diploid potato population for identifying lines with low anti-nutritional factors. The data will be presented and discussed in relation to the high potential for diploid potatoes as a complement to tetraploid potatoes and in pre-and post-harvest management contexts.

    2019 - View publication details

  7. https://pag.confex.com/pag/xxvii/meetingapp.cgi/Session/5691

    2019 - View publication details

  8. Somalraju, A., Ghose, K., Main, D., Bizimungu, B., Fofana, B. (2019). Development of pre-breeding diploid potato germplasm displaying wide phenotypic variations as induced by ethyl methane sulfonate mutagenesis. Canadian Journal of Plant Science, [online] 99(2), 138-151. http://dx.doi.org/10.1139/cjps-2018-0189

    2019 - View publication details

  9. https://www.eventscribe.com/2018/ASPB/searchbyposterbucket.asp?pfp=PosterBucket

    2018 - View publication details

  10. Pommes de terre : de semence à semence – pouvons-nous changer l’approche?

    2018 - View publication details

  11. https://pag.confex.com/pag/xxvi/meetingapp.cgi/Paper/30375

    2018 - View publication details

  12. https://pag.confex.com/pag/xxvi/meetingapp.cgi/Paper/30386

    2018 - View publication details

  13. Gènes du transcriptome (ARN) exprimés de manière différentielle permettant de distinguer les cultivars de pomme de terre résistants à la gale commune de ceux qui y sont sensibles

    2018 - View publication details

  14. Fofana, B., Ghose, K., Somalraju, A., McCallum, J., Main, D., Deyholos, M.K., Rowland, G.G., Cloutier, S. (2017). Induced mutagenesis in UGT74S1 gene leads to stable new flax lines with altered secoisolariciresinol diglucoside (SDG) profiles. Frontiers in Plant Science, [online] 8 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2017.01638

    2017 - View publication details

  15. Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J., You, F.M., Cloutier, S. (2017). UGT74S1 is the key player in controlling secoisolariciresinol diglucoside (SDG) formation in flax. BMC Plant Biology, [online] 17(1), http://dx.doi.org/10.1186/s12870-017-0982-x

    2017 - View publication details

  16. Cloutier S, Ghose K, Somalraju A, McCallum J, Fofana B (2017) Further evidence that mutations in UGT74S1 alter SDG lignan glucoside profiles in EMS flax mutant lines. Proc 25th Plant and Animal Genome meeting, San Diego, CA, 14-18 Jan, P232

    2017 - View publication details

  17. Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., Somalraju, A., Cloutier, S., Deyholos, M.K., et Rowland, G.G. (2016). « Developing EMS flax mutant lines with altered SDG lignan glucosides. », PAGXXIV, San Diego, USA, January 9-13, 2015. (Affiche)

    2016 - View publication details

  18. Fofana, B., Ghose, K., McCallum, J.L., Somalraju, A., Cloutier, S., Deyholos, M.K., et Rowland, G.G. (2016). « Developing EMS flax mutant lines with altered SDG lignan glucosides. », PAGXXIV 2016, San Diego, USA, January 9-13, 2016.

    2016 - View publication details

  19. Bizimungu, B., B Fofana, D. Main, J. McCallum, L. Kawchuk, and H. Tai. (2016) Development and characterization of diploid potato lines with agronomic and processing traits. “Breeding”, 100th Annual Meeting of The Potato Association of America, July 31- August 4, 2016, Amway Grand Plaza Hotel, Grand Rapids, Michigan, USA. (Presentation) http://potatoassociation.org/

    2016 - View publication details

  20. Somalraju, A., Alkhnajari, A., Ghose, K., Main, D., et Fofana, B. (2015). « Characterizing EMS-Mutagenized pre-breeding potato lines using NGS and Phenotyping. », UPEI Graduate Day, UPEI, MacDougall Hall, May 2015. (Affiche)

    2015 - View publication details

Installation de recherche

440, avenue University
Charlottetown, PE C1A 4N6
Canada

Affiliations

Affiliations

  • Professeur Auxilliaire, Departement de Biologie, UPEI, 2008 – present

  • Professeur Auxilliaire,  Departement des Sciences Végétales, Alimentaires, et Environmentales, Faculte d'Agriculture Université Dalhousie , April 2020 - Présent

  • Membre de la Société Canadienne de Biologie végétale, Octobre 2006-présent

  • Membre de la Societé Américaine de Biologie végétale, Octobre 2008-présent

  • Membre et Secrétaire de la Société Canadienne des Sciences Horticoles, April 2016 - présent

Language

Anglais
Français