Benjamin Mimee

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Chercheur scientifique - Nématologie

Développement de méthodes alternatives pour la gestion des nématodes phytoparasites

Recherche et / ou projets en cours

Outils génomiques pour le contrôle d’Heterodera glycines, un ravageur émergent du soya

Évaluation et éradication de Globodera spp. dans la culture de pomme de terre (globodera.org)

SoyaGen: Améliorer le rendement et la résistance aux maladies du soya de saison courte (soyagen.ca)

Lutte intégrée contre le nématode des tiges et des bulbes, Ditylenchus dipsaci

Biovigilance pour la durabilité des sols organiques

Caractérisation de microbiotes agricoles afin de monitorer l'effet des perturbations environnementales sur la biodiversité et l'incidence des ravageurs

Énoncés de recherches/projets

Lutte intégrée : développement et validation de programmes de lutte pour les nématodes phytoparasites.

Génomique fonctionnelle et génétique des populations de nématodes: mécanismes de virulence, voies d’introduction, évolution/adaptation des populations dans le temps, impact des changements climatiques sur le développement et la gestion, gènes d’intérêt pour le contrôle, interactions hôtes-parasites pour supporter les programmes d’amélioration génétique.

Biodiversité : mesurer l’impact des pratiques agricoles sur le microbiote du sol et les services écologiques.

Prix et études

Récipiendaire du Syngenta Crop Protection Award 2018, remis par Syngenta et la Society of Nematologist (SON) a une personne dont les contributions à la nématologie ont mené à des avancées significatives en agriculture.

Principales publications

  1. Mimee, B., Lord, E., Véronneau, P.Y., Masonbrink, R., Yu, Q., den Akker, S.E.v. (2019). The draft genome of Ditylenchus dipsaci. Journal of Nematology, [online] 51(1), 1-3. http://dx.doi.org/10.21307/jofnem-2019-027

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  2. Rashidifard, M., Fourie, H., Véronneau, P.Y., Marais, M., Daneel, M.S., Mimee, B. (2018). Genetic diversity and phylogeny of South African Meloidogyne populations using genotyping by sequencing. Scientific Reports, [online] 8(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-31963-9

    2018 - Consulter les détails de la publication

  3. Gagnon A-È, Mimee B, Boivin G & Bélair G. 2018. A promising biological agent to control the carrot weevil. Entomological Society of America & Entomological Society of Canada, Vancouver, British-Columbia, Canada.

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  4. St-Marseille, A.F.G., Lord, E., Véronneau, P.Y., Brodeur, J., Mimee, B. (2018). Genome scans reveal homogenization and local adaptations in populations of the soybean CYST nematode. Frontiers in Plant Science, [online] 9 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2018.00987

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  5. Dauphinais, N., Vandal, M., Gagnon, A.-È., Bélair, G., Véronneau, P.-Y., Mimee, B. (2018). Development and application of a multiplex qPCR method for the simultaneous detection and quantification of pratylenchus alleni and P. Penetrans in Quebec, Canada, 102(5), 970-976. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-17-1222-RE

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  6. Sabeh, M., Duceppe, M.O., St-Arnaud, M., Mimee, B. (2018). Transcriptome-wide selection of a reliable set of reference genes for gene expression studies in potato cyst nematodes (globodera spp.). PLoS ONE, [online] 13(3), http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0193840

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  7. Duceppe, M.-O., Lafond-Lapalme, J., Palomares-Rius, J.E., Sabeh, M., Blok, V., Moffett, P., Mimee, B. (2017). Analysis of survival and hatching transcriptomes from potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallid, 7(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03871-x

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  8. Mimee, B., Soufiane, B., Dauphinais, N., Bélair, G. (2017). A qRT-PCR method to evaluate viability of potato cyst nematode (Globodera spp.), 39(4), 503-513. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2017.1382574

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  9. Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., Mimee, B. (2017). A new method for decontamination of de novo transcriptomes using a hierarchical clustering algorithm, 33(9), 1293-1300. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw793

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  10. Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Mimee, B., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., da Rocha, M.R., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, É., Montarry, J., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., et Jones, J.T. (2016). « The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. », Genome Biology, 17(Article 124), p. 1-23. doi : 10.1186/s13059-016-0985-1

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  11. Blondlot, A., Gagnon, A.-È., Bourgeois, G., Brodeur, J., Mimee, B., et les autres (2015). « A research program to address agricultural stakeholders’ concerns regarding the evolution of crop pests associated with climate change. », Climate-Smart Agriculture Global Science Conference 2015, Montpellier, France, March 16-18, 2015.

    2015 - Consulter les détails de la publication

  12. Mimee, B., Duceppe, M.-O., Véronneau, P.-Y., Lafond-Lapalme, J., Jean, M., Belzile, F.J., et Bélair, G. (2015). « A new method for studying population genetics of cyst nematodes based on Pool-Seq and genomewide allele frequency analysis. », Molecular Ecology Resources, 15(6), p. 1356-1365. doi : 10.1111/1755-0998.12412

    2015 - Consulter les détails de la publication

  13. Rioux, S., Mimee, B., Gagnon, A.-È., et Hambleton, S. (2015). « First report of stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) on wheat in Quebec, Canada. », Phytoprotection, 95(1), p. 7-9. doi : 10.7202/1028400ar

    2015 - Consulter les détails de la publication

  14. Mimee, B., Brodeur, J., Bourgeois, G., Moiroux, J., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Gagnon, A.-È. (2014). Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec? Ouranos #550012-103. Québec, Canada. 51 p. (Rapport)

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  15. Moiroux, J., Bourgeois, G., Brodeur, J., Gagnon, A.-È., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Mimee, B. (2014). « Quelles espèces exotiques envahissantes menacent la culture du soya au Québec à la faveur des changements climatiques? », Conférence présentée dans le cadre de la Journée d'information scientifique grandes culture du CRAAQ à Drummondville, QC, Canada.

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  16. Mimee, B. et Gagnon, A.-È. (2014). « Nématode à kyste du soya. », Conférences présentées lors des Journée Phytoprotection grandes cultures au CEROM à St-Mathieu-de-Beloeil, QC, Canada.

    2014 - Consulter les détails de la publication

  17. Moiroux, J., Bourgeois, G., Brodeur, J., Gagnon, A.-È., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Mimee, B. (2014). Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec ? Feuillet technique. Ouranos. Québec, Canada. 11 p. (http://www.agrireseau.qc.ca/documents/Document_87868.pdf). (Rapport)

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  18. Bourgeois, G., Moiroux, J., Gendron-St-Marseille, A.-F., Gagnon, A.-È., Mimee, B., et Brodeur, J. (2014). « Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec? », Conférence présentée dans le cadre du Symposium Ouranos à Québec, QC, Canada.

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  19. Mimee, B., Andersen, R., Bélair, G., Vanasse, A., et Rott, M. (2014). « Impact of quarantine procedures on weed biodiversity and abundance: Implications for the management of the golden potato cyst nematode, Globodera rostochiensis. », Crop Protection, 55, p. 21-27. doi : 10.1016/j.cropro.2013.10.003

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  20. Boucher, A.C., Mimee, B., Montarry, J., Bardou-Valette, S., Bélair, G., Moffett, P., et Grenier, É. (2013). « Genetic diversity of the golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis and determination of the origin of populations in Quebec, Canada. », Molecular Phylogenetics and Evolution, 69(1), p. 75-82. doi : 10.1016/j.ympev.2013.05.020

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Installation de recherche

430, boul. Gouin
Saint-Jean-sur-Richelieu, QC J3B 3E6
Canada

Affiliations

Professeur associé

Université de Montréal (depuis 2013)

Professeur associé

Université Laval (depuis 2016)

Langue

Anglais
Français