Benjamin Mimee

Chercheur scientifique - Nématologie

Développement de méthodes alternatives pour la gestion des nématodes phytoparasites

Agriculture et Agroalimentaire Canada

Centre de recherche et de développement de Saint-Jean-sur-Richelieu, Saint-Jean-sur-Richelieu, Québec

Recherche et / ou projets en cours

Outils génomiques pour le contrôle d’Heterodera glycines, un ravageur émergent du soya

Évaluation et éradication de Globodera spp. dans la culture de pomme de terre (globodera.org)

SoyaGen: Améliorer le rendement et la résistance aux maladies du soya de saison courte (soyagen.ca)

Lutte intégrée contre le nématode des tiges et des bulbes, Ditylenchus dipsaci

Biovigilance pour la durabilité des sols organiques

Caractérisation de microbiotes agricoles afin de monitorer l'effet des perturbations environnementales sur la biodiversité et l'incidence des ravageurs

Énoncés de recherches/projets

Lutte intégrée : développement et validation de programmes de lutte pour les nématodes phytoparasites.

Génomique fonctionnelle et génétique des populations de nématodes: mécanismes de virulence, voies d’introduction, évolution/adaptation des populations dans le temps, impact des changements climatiques sur le développement et la gestion, gènes d’intérêt pour le contrôle, interactions hôtes-parasites pour supporter les programmes d’amélioration génétique.

Biodiversité : mesurer l’impact des pratiques agricoles sur le microbiote du sol et les services écologiques.

Prix et études

Récipiendaire du Syngenta Crop Protection Award 2018, remis par Syngenta et la Society of Nematologist (SON) a une personne dont les contributions à la nématologie ont mené à des avancées significatives en agriculture.

Principales publications

Mimee, B., Lord, E., Véronneau, P.Y., Masonbrink, R., Yu, Q., den Akker, S.E.v. (2019). The draft genome of Ditylenchus dipsaci. Journal of Nematology, [online] 51(1), 1-3. http://dx.doi.org/10.21307/jofnem-2019-027
2019 - Consulter les détails de la publication
Rashidifard, M., Fourie, H., Véronneau, P.Y., Marais, M., Daneel, M.S., Mimee, B. (2018). Genetic diversity and phylogeny of South African Meloidogyne populations using genotyping by sequencing. Scientific Reports, [online] 8(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-018-31963-9
2018 - Consulter les détails de la publication
Gagnon A-È, Mimee B, Boivin G & Bélair G. 2018. A promising biological agent to control the carrot weevil. Entomological Society of America & Entomological Society of Canada, Vancouver, British-Columbia, Canada.
2018 - Consulter les détails de la publication
St-Marseille, A.F.G., Lord, E., Véronneau, P.Y., Brodeur, J., Mimee, B. (2018). Genome scans reveal homogenization and local adaptations in populations of the soybean CYST nematode. Frontiers in Plant Science, [online] 9 http://dx.doi.org/10.3389/fpls.2018.00987
2018 - Consulter les détails de la publication
Dauphinais, N., Vandal, M., Gagnon, A.-È., Bélair, G., Véronneau, P.-Y., Mimee, B. (2018). Development and application of a multiplex qPCR method for the simultaneous detection and quantification of pratylenchus alleni and P. Penetrans in Quebec, Canada, 102(5), 970-976. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-17-1222-RE
2018 - Consulter les détails de la publication
Sabeh, M., Duceppe, M.O., St-Arnaud, M., Mimee, B. (2018). Transcriptome-wide selection of a reliable set of reference genes for gene expression studies in potato cyst nematodes (globodera spp.). PLoS ONE, [online] 13(3), http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0193840
2018 - Consulter les détails de la publication
Duceppe, M.-O., Lafond-Lapalme, J., Palomares-Rius, J.E., Sabeh, M., Blok, V., Moffett, P., Mimee, B. (2017). Analysis of survival and hatching transcriptomes from potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallid, 7(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03871-x
2017 - Consulter les détails de la publication
Mimee, B., Soufiane, B., Dauphinais, N., Bélair, G. (2017). A qRT-PCR method to evaluate viability of potato cyst nematode (Globodera spp.), 39(4), 503-513. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2017.1382574
2017 - Consulter les détails de la publication
Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., Mimee, B. (2017). A new method for decontamination of de novo transcriptomes using a hierarchical clustering algorithm, 33(9), 1293-1300. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw793
2017 - Consulter les détails de la publication
Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Mimee, B., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., da Rocha, M.R., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, É., Montarry, J., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., et Jones, J.T. (2016). « The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. », Genome Biology, 17(Article 124), p. 1-23. doi : 10.1186/s13059-016-0985-1
2016 - Consulter les détails de la publication
Blondlot, A., Gagnon, A.-È., Bourgeois, G., Brodeur, J., Mimee, B., et les autres (2015). « A research program to address agricultural stakeholders’ concerns regarding the evolution of crop pests associated with climate change. », Climate-Smart Agriculture Global Science Conference 2015, Montpellier, France, March 16-18, 2015.
2015 - Consulter les détails de la publication
Mimee, B., Duceppe, M.-O., Véronneau, P.-Y., Lafond-Lapalme, J., Jean, M., Belzile, F.J., et Bélair, G. (2015). « A new method for studying population genetics of cyst nematodes based on Pool-Seq and genomewide allele frequency analysis. », Molecular Ecology Resources, 15(6), p. 1356-1365. doi : 10.1111/1755-0998.12412
2015 - Consulter les détails de la publication
Rioux, S., Mimee, B., Gagnon, A.-È., et Hambleton, S. (2015). « First report of stripe rust (Puccinia striiformis f. sp. tritici) on wheat in Quebec, Canada. », Phytoprotection, 95(1), p. 7-9. doi : 10.7202/1028400ar
2015 - Consulter les détails de la publication
Moiroux, J., Bourgeois, G., Brodeur, J., Gagnon, A.-È., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Mimee, B. (2014). « Quelles espèces exotiques envahissantes menacent la culture du soya au Québec à la faveur des changements climatiques? », Conférence présentée dans le cadre de la Journée d'information scientifique grandes culture du CRAAQ à Drummondville, QC, Canada.
2014 - Consulter les détails de la publication
Mimee, B. et Gagnon, A.-È. (2014). « Nématode à kyste du soya. », Conférences présentées lors des Journée Phytoprotection grandes cultures au CEROM à St-Mathieu-de-Beloeil, QC, Canada.
2014 - Consulter les détails de la publication
Moiroux, J., Bourgeois, G., Brodeur, J., Gagnon, A.-È., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Mimee, B. (2014). Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec ? Feuillet technique. Ouranos. Québec, Canada. 11 p. (http://www.agrireseau.qc.ca/documents/Document_87868.pdf). (Rapport)
2014 - Consulter les détails de la publication
Bourgeois, G., Moiroux, J., Gendron-St-Marseille, A.-F., Gagnon, A.-È., Mimee, B., et Brodeur, J. (2014). « Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec? », Conférence présentée dans le cadre du Symposium Ouranos à Québec, QC, Canada.
2014 - Consulter les détails de la publication
Mimee, B., Brodeur, J., Bourgeois, G., Moiroux, J., Gendron-St-Marseille, A.-F., et Gagnon, A.-È. (2014). Quels enjeux représentent les changements climatiques en lien avec les espèces exotiques envahissantes pour la culture du soya au Québec? Ouranos #550012-103. Québec, Canada. 51 p. (Rapport)
2014 - Consulter les détails de la publication
Mimee, B., Andersen, R., Bélair, G., Vanasse, A., et Rott, M. (2014). « Impact of quarantine procedures on weed biodiversity and abundance: Implications for the management of the golden potato cyst nematode, Globodera rostochiensis. », Crop Protection, 55, p. 21-27. doi : 10.1016/j.cropro.2013.10.003
2014 - Consulter les détails de la publication
Boucher, A.C., Mimee, B., Montarry, J., Bardou-Valette, S., Bélair, G., Moffett, P., et Grenier, É. (2013). « Genetic diversity of the golden potato cyst nematode Globodera rostochiensis and determination of the origin of populations in Quebec, Canada. », Molecular Phylogenetics and Evolution, 69(1), p. 75-82. doi : 10.1016/j.ympev.2013.05.020
2013 - Consulter les détails de la publication