Benjamin Mimee

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Chercheur scientifique - Nématologie

Développement de méthodes alternatives pour la gestion des nématodes phytoparasites

Recherche et / ou projets en cours

Outils génomiques pour le contrôle d’Heterodera glycines, un ravageur émergent du soya

Évaluation et éradication de Globodera spp. dans la culture de pomme de terre (globodera.org)

SoyaGen: Améliorer le rendement et la résistance aux maladies du soya de saison courte (soyagen.ca)

Lutte intégrée contre le nématode des tiges et des bulbes, Ditylenchus dipsaci

Biovigilance pour la durabilité des sols organiques

Caractérisation de microbiotes agricoles afin de monitorer l'effet des perturbations environnementales sur la biodiversité et l'incidence des ravageurs

Énoncés de recherches/projets

Lutte intégrée : développement et validation de programmes de lutte pour les nématodes phytoparasites.

Génomique fonctionnelle et génétique des populations de nématodes: mécanismes de virulence, voies d’introduction, évolution/adaptation des populations dans le temps, impact des changements climatiques sur le développement et la gestion, gènes d’intérêt pour le contrôle, interactions hôtes-parasites pour supporter les programmes d’amélioration génétique.

Biodiversité : mesurer l’impact des pratiques agricoles sur le microbiote du sol et les services écologiques.

Prix et études

Récipiendaire du Syngenta Crop Protection Award 2018, remis par Syngenta et la Society of Nematologist (SON) a une personne dont les contributions à la nématologie ont mené à des avancées significatives en agriculture.

Principales publications

  1. Dauphinais, N., Vandal, M., Gagnon, A.-È., Bélair, G., Véronneau, P.-Y., Mimee, B. (2018). Development and application of a multiplex qPCR method for the simultaneous detection and quantification of pratylenchus alleni and P. Penetrans in Quebec, Canada, 102(5), 970-976. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-17-1222-RE

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  2. Duceppe, M.-O., Lafond-Lapalme, J., Palomares-Rius, J.E., Sabeh, M., Blok, V., Moffett, P., Mimee, B. (2017). Analysis of survival and hatching transcriptomes from potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallid, 7(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03871-x

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  3. Mimee, B., Soufiane, B., Dauphinais, N., Bélair, G. (2017). A qRT-PCR method to evaluate viability of potato cyst nematode (Globodera spp.), 39(4), 503-513. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2017.1382574

    2017 - Consulter les détails de la publication

  4. Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., Mimee, B. (2017). A new method for decontamination of de novo transcriptomes using a hierarchical clustering algorithm, 33(9), 1293-1300. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw793

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  5. 2016 - Consulter les détails de la publication

  6. Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Mimee, B., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., da Rocha, M.R., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, É., Montarry, J., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., et Jones, J.T. (2016). « The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. », Genome Biology, 17(Article 124), p. 1-23. doi : 10.1186/s13059-016-0985-1

    2016 - Consulter les détails de la publication

  7. Sabeh, H., Duceppe, M.-O., St-Arnaud, M., et Mimee, B. (2015). « Sélection d'un ensemble fiable de gènes de référence pour Globodera rostochiensis. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.

    2015 - Consulter les détails de la publication

  8. Blondlot, A., Gagnon, A.-È., Bourgeois, G., Brodeur, J., Mimee, B., et les autres (2015). « A research program to address agricultural stakeholders’ concerns regarding the evolution of crop pests associated with climate change. », Climate-Smart Agriculture Global Science Conference 2015, Montpellier, France, March 16-18, 2015.

    2015 - Consulter les détails de la publication

  9. Rioux, S., Mimee, B., et Pageau, D. (2015). « Les maladies à surveiller dans les cultures de céréales, de soya et de canola. », Journée du producteur charlevoisien. Club agroenvironnemental de la Rive-Nord (C.A.R.N.) en collaboration avec la Direction régionale de la Capitale-Nationale du MAPAQ, Baie-Saint-Paul, Canada, 9 avril, 2015. (Présentation)

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  10. Mimee, B., Bélair, G., Yu, Q., Forge, T.A., Rott, M., et Tenuta, M. (2015). « La génomique et les nouvelles technologies au service de la biovigilance des nématodes phytoparasites. », Journée de la science, Centre de recherche et développement en horticulture. (Présentation)

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Affiliations

Professeur associé

Université de Montréal (depuis 2013)

Professeur associé

Université Laval (depuis 2016)

Langue

Anglais
Français