Benjamin Mimee

Développement de méthodes alternatives pour la gestion des nématodes phytoparasites
Recherche et / ou projets en cours
Outils génomiques pour le contrôle d’Heterodera glycines, un ravageur émergent du soya
Évaluation et éradication de Globodera spp. dans la culture de pomme de terre (globodera.org)
SoyaGen: Améliorer le rendement et la résistance aux maladies du soya de saison courte (soyagen.ca)
Lutte intégrée contre le nématode des tiges et des bulbes, Ditylenchus dipsaci
Biovigilance pour la durabilité des sols organiques
Caractérisation de microbiotes agricoles afin de monitorer l'effet des perturbations environnementales sur la biodiversité et l'incidence des ravageurs
Énoncés de recherches/projets
Lutte intégrée : développement et validation de programmes de lutte pour les nématodes phytoparasites.
Génomique fonctionnelle et génétique des populations de nématodes: mécanismes de virulence, voies d’introduction, évolution/adaptation des populations dans le temps, impact des changements climatiques sur le développement et la gestion, gènes d’intérêt pour le contrôle, interactions hôtes-parasites pour supporter les programmes d’amélioration génétique.
Biodiversité : mesurer l’impact des pratiques agricoles sur le microbiote du sol et les services écologiques.
Prix et études
Récipiendaire du Syngenta Crop Protection Award 2018, remis par Syngenta et la Society of Nematologist (SON) a une personne dont les contributions à la nématologie ont mené à des avancées significatives en agriculture.
Principales publications
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Current Status of Potato Cyst Nematodes in North America. Louise-Marie Dandurand, Inga A. Zasada, Xiaohong Wang, Benjamin Mimee, Walter De Jong, Richard Novy, Jonathan Whitworth, Joseph C. Kuhl. Annual Review of Phytopathology 2019 57:1, 117-133
2019 - Consulter les détails de la publication
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Dauphinais, N., Vandal, M., Gagnon, A.-È., Bélair, G., Véronneau, P.-Y., Mimee, B. (2018). Development and application of a multiplex qPCR method for the simultaneous detection and quantification of pratylenchus alleni and P. Penetrans in Quebec, Canada, 102(5), 970-976. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-17-1222-RE
2018 - Consulter les détails de la publication
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Duceppe, M.-O., Lafond-Lapalme, J., Palomares-Rius, J.E., Sabeh, M., Blok, V., Moffett, P., Mimee, B. (2017). Analysis of survival and hatching transcriptomes from potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallid, 7(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03871-x
2017 - Consulter les détails de la publication
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Mimee, B., Soufiane, B., Dauphinais, N., Bélair, G. (2017). A qRT-PCR method to evaluate viability of potato cyst nematode (Globodera spp.), 39(4), 503-513. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2017.1382574
2017 - Consulter les détails de la publication
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Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., Mimee, B. (2017). A new method for decontamination of de novo transcriptomes using a hierarchical clustering algorithm, 33(9), 1293-1300. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw793
2017 - Consulter les détails de la publication
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Évaluation des méthodes culturales de gestion du nématode à kyste (nématode doré) (Globodera rostochiensis) au Québec, au Canada.
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Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Mimee, B., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., da Rocha, M.R., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, É., Montarry, J., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., et Jones, J.T. (2016). « The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. », Genome Biology, 17(Article 124), p. 1-23. doi : 10.1186/s13059-016-0985-1
2016 - Consulter les détails de la publication
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Mimee, B. et Lafrenière-Landry, M. (2015). « Soya, nématodes, changements climatiques… C’est quoi le problème?! », Conférence donnée dans le cadre du Colloque sur la santé des sols à St-Hyacinthe, QC, Canada.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Dandurand, L.-M., Bryant, G., Block, V., De Jong, W.S., Denver, D., Grenier, É., Hutchinson, P., Jones, J.B., Kuhl, J., Knudsen, G., McIntosh, T.C., Mimee, B., Novy, R., Thornton, M., Wang, X., Whitworth, J.A., et Zasada, I.A. (2015). « Risk assessment and eradication of Globodera spp. in U.S. production of potato. », 54th Annual meeting of the Society of Nematologists, East Lansing, Michigan, USA, July 19-24, 2015, Résumé publié dans Journal of Nematology.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Tétreault, M.P., Mimee, B., Toussaint, V., Lafond-Lapalme, J., et Moffett, P. (2015). « Effet des pratiques culturales sur le microbiote du sol chez la tomate. », Journées du Centre Sève à Bromont, Bromont, QC, Canada. (Présentation)
2015 - Consulter les détails de la publication
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Gendron-St-Marseille, A.-F., Brodeur, J., et Mimee, B. (2015). « Utilisation du génotypage par séquençage pour l’identification de polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) associées aux phénotypes (HG types) du nématode à kyste du soya, Heterodera glycines. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., et Mimee, B. (2015). « Décontamination de données de séquençage – un nouvel outil bioinformatique. », Journées du Centre Sève à Bromont, Bromont, QC, Canada. (Présentation)
2015 - Consulter les détails de la publication
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Vandal, M., Dauphinais, N., Bélair, G., Brodeur, J., et Mimee, B. (2015). « Le nématode Pratylenchus alleni : sa détection par technique moléculaire et son potentiel de virulence. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Dandurand, L.-M., Bryant, G., Block, V., De Jong, W.S., Denver, D., Grenier, É., Hutchinson, P., Jones, J.B., Kuhl, J., Knudsen, G., McIntosh, T.C., Mimee, B., Novy, R., Thornton, M., Wang, X., Whitworth, J., et Zasada, I.A. (2015). « Risk assessment and eradication of Globodera spp. in U.S. production of potato. », Idaho Potato Conference, Pocatello, ID, USA.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. Final Report. 54. http://cradpdf.drdc-rddc.gc.ca/PDFS/unc195/p802330_A1b.pdf. (Rapport)
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Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Topp, E., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. DRDC-RDDC-2015-C148. Final Close-Out Report. (Rapport)
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Sabeh, H., Duceppe, M.-O., St-Arnaud, M., et Mimee, B. (2015). « Sélection d'un ensemble fiable de gènes de référence pour Globodera rostochiensis. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.
2015 - Consulter les détails de la publication
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Blondlot, A., Gagnon, A.-È., Bourgeois, G., Brodeur, J., Mimee, B., et les autres (2015). « A research program to address agricultural stakeholders’ concerns regarding the evolution of crop pests associated with climate change. », Climate-Smart Agriculture Global Science Conference 2015, Montpellier, France, March 16-18, 2015.
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Rioux, S., Mimee, B., et Pageau, D. (2015). « Les maladies à surveiller dans les cultures de céréales, de soya et de canola. », Journée du producteur charlevoisien. Club agroenvironnemental de la Rive-Nord (C.A.R.N.) en collaboration avec la Direction régionale de la Capitale-Nationale du MAPAQ, Baie-Saint-Paul, Canada, 9 avril, 2015. (Présentation)
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Mimee, B., Bélair, G., Yu, Q., Forge, T.A., Rott, M., et Tenuta, M. (2015). « La génomique et les nouvelles technologies au service de la biovigilance des nématodes phytoparasites. », Journée de la science, Centre de recherche et développement en horticulture. (Présentation)
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Université de Montréal (depuis 2013)
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Université Laval (depuis 2016)