Benjamin Mimee

Image Benjamin Mimee
Chercheur scientifique - Nématologie

Développement de méthodes alternatives pour la gestion des nématodes phytoparasites

Recherche et / ou projets en cours

Outils génomiques pour le contrôle d’Heterodera glycines, un ravageur émergent du soya

Évaluation et éradication de Globodera spp. dans la culture de pomme de terre (globodera.org)

SoyaGen: Améliorer le rendement et la résistance aux maladies du soya de saison courte (soyagen.ca)

Lutte intégrée contre le nématode des tiges et des bulbes, Ditylenchus dipsaci

Biovigilance pour la durabilité des sols organiques

Caractérisation de microbiotes agricoles afin de monitorer l'effet des perturbations environnementales sur la biodiversité et l'incidence des ravageurs

Énoncés de recherches/projets

Lutte intégrée : développement et validation de programmes de lutte pour les nématodes phytoparasites.

Génomique fonctionnelle et génétique des populations de nématodes: mécanismes de virulence, voies d’introduction, évolution/adaptation des populations dans le temps, impact des changements climatiques sur le développement et la gestion, gènes d’intérêt pour le contrôle, interactions hôtes-parasites pour supporter les programmes d’amélioration génétique.

Biodiversité : mesurer l’impact des pratiques agricoles sur le microbiote du sol et les services écologiques.

Prix et études

Récipiendaire du Syngenta Crop Protection Award 2018, remis par Syngenta et la Society of Nematologist (SON) a une personne dont les contributions à la nématologie ont mené à des avancées significatives en agriculture.

Principales publications

  1. Current Status of Potato Cyst Nematodes in North America. Louise-Marie Dandurand, Inga A. Zasada, Xiaohong Wang, Benjamin Mimee, Walter De Jong, Richard Novy, Jonathan Whitworth, Joseph C. Kuhl. Annual Review of Phytopathology 2019 57:1, 117-133

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  2. Dauphinais, N., Vandal, M., Gagnon, A.-È., Bélair, G., Véronneau, P.-Y., Mimee, B. (2018). Development and application of a multiplex qPCR method for the simultaneous detection and quantification of pratylenchus alleni and P. Penetrans in Quebec, Canada, 102(5), 970-976. http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-08-17-1222-RE

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  3. Duceppe, M.-O., Lafond-Lapalme, J., Palomares-Rius, J.E., Sabeh, M., Blok, V., Moffett, P., Mimee, B. (2017). Analysis of survival and hatching transcriptomes from potato cyst nematodes, Globodera rostochiensis and G. pallid, 7(1), http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-03871-x

    2017 - Consulter les détails de la publication

  4. Mimee, B., Soufiane, B., Dauphinais, N., Bélair, G. (2017). A qRT-PCR method to evaluate viability of potato cyst nematode (Globodera spp.), 39(4), 503-513. http://dx.doi.org/10.1080/07060661.2017.1382574

    2017 - Consulter les détails de la publication

  5. Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., Mimee, B. (2017). A new method for decontamination of de novo transcriptomes using a hierarchical clustering algorithm, 33(9), 1293-1300. http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btw793

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  6. Évaluation des méthodes culturales de gestion du nématode à kyste (nématode doré) (Globodera rostochiensis) au Québec, au Canada.

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  7. Eves-van den Akker, S., Laetsch, D.R., Mimee, B., Thorpe, P., Lilley, C.J., Danchin, E.G.J., da Rocha, M.R., Rancurel, C., Holroyd, N.E., Cotton, J.A., Szitenberg, A., Grenier, É., Montarry, J., Duceppe, M.-O., Boyes, I., Marvin, J.M.C., Jones, L.M., Yusup, H.B., Lafond-Lapalme, J., Esquibet, M., Sabeh, M., Rott, M., Overmars, H., Finkers-Tomczak, A., Smant, G., Koutsovoulos, G., Blok, V., Mantelin, S., Cock, P.J.A., Phillips, W., Henrissat, B., Urwin, P.E., Blaxter, M., et Jones, J.T. (2016). « The genome of the yellow potato cyst nematode, Globodera rostochiensis, reveals insights into the basis of parasitism and virulence. », Genome Biology, 17(Article 124), p. 1-23. doi : 10.1186/s13059-016-0985-1

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  8. Mimee, B., Bélair, G., Yu, Q., Forge, T.A., Rott, M., et Tenuta, M. (2015). « La génomique et les nouvelles technologies au service de la biovigilance des nématodes phytoparasites. », Journée de la science, Centre de recherche et développement en horticulture. (Présentation)

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  9. Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Moffett, P., Bélair, G., et Mimee, B. (2015). « Étude transcriptomique du nématode doré durant le processus d’éclosion. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.

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  10. Rioux, S., Mimee, B., et Pageau, D. (2015). « Quelles sont les maladies à surveiller en grandes cultures ? », Journée d’information grandes cultures : du semis à la récolte. Club agroenvironnemental de la Rive-Nord (CARN) en collaboration avec la Direction régionale de la Capitale-Nationale du MAPAQ, Deschambault, 18 février 2015. (Présentation)

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  11. Gendron-St-Marseille, A.-F., Mimee, B., Bélair, G., Bourgeois, G., et Brodeur, J. (2015). « Bioclimatic modeling of soybean phenology and the soybean cyst nematode (Heterodera glycines) life cycle in a context of climate change. », 54th Annual meeting of the Society of Nematologists, East Lansing, Michigan, USA, July 19-24, 2015, Résumé publié dans Journal of Nematology.

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  12. Mimee, B. et Lafrenière-Landry, M. (2015). « Soya, nématodes, changements climatiques… C’est quoi le problème?! », Conférence donnée dans le cadre du Colloque sur la santé des sols à St-Hyacinthe, QC, Canada.

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  13. Dandurand, L.-M., Bryant, G., Block, V., De Jong, W.S., Denver, D., Grenier, É., Hutchinson, P., Jones, J.B., Kuhl, J., Knudsen, G., McIntosh, T.C., Mimee, B., Novy, R., Thornton, M., Wang, X., Whitworth, J.A., et Zasada, I.A. (2015). « Risk assessment and eradication of Globodera spp. in U.S. production of potato. », 54th Annual meeting of the Society of Nematologists, East Lansing, Michigan, USA, July 19-24, 2015, Résumé publié dans Journal of Nematology.

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  14. Tétreault, M.P., Mimee, B., Toussaint, V., Lafond-Lapalme, J., et Moffett, P. (2015). « Effet des pratiques culturales sur le microbiote du sol chez la tomate. », Journées du Centre Sève à Bromont, Bromont, QC, Canada. (Présentation)

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  15. Gendron-St-Marseille, A.-F., Brodeur, J., et Mimee, B. (2015). « Utilisation du génotypage par séquençage pour l’identification de polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) associées aux phénotypes (HG types) du nématode à kyste du soya, Heterodera glycines. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.

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  16. Lafond-Lapalme, J., Duceppe, M.-O., Wang, S., Moffett, P., et Mimee, B. (2015). « Décontamination de données de séquençage – un nouvel outil bioinformatique. », Journées du Centre Sève à Bromont, Bromont, QC, Canada. (Présentation)

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  17. Vandal, M., Dauphinais, N., Bélair, G., Brodeur, J., et Mimee, B. (2015). « Le nématode Pratylenchus alleni : sa détection par technique moléculaire et son potentiel de virulence. », Congrès annuel de la Société de Protection des Plantes du Québec (SPPQ), Beaupré, QC, Canada, Résumé publié dans Phytoprotection.

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  18. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. Final Report. 54. http://cradpdf.drdc-rddc.gc.ca/PDFS/unc195/p802330_A1b.pdf. (Rapport)

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  19. Dandurand, L.-M., Bryant, G., Block, V., De Jong, W.S., Denver, D., Grenier, É., Hutchinson, P., Jones, J.B., Kuhl, J., Knudsen, G., McIntosh, T.C., Mimee, B., Novy, R., Thornton, M., Wang, X., Whitworth, J., et Zasada, I.A. (2015). « Risk assessment and eradication of Globodera spp. in U.S. production of potato. », Idaho Potato Conference, Pocatello, ID, USA.

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  20. Lévesque, C.A., Chen, W., Hambleton, S., Seifert, K.A., Adam, Z., Bilodeau, G.J., Cullis, J., Demeke, T., Dumonceaux, T.J., Gagnon, M., Graefenhan, T., Kawchuk, L.M., Khan, I.U.H., Lewis, C.T., Li, X., Links, M.G., Mimee, B., Rott, M., Tambong, J.T., Topp, E., Yu, Q., et Yuan, K. (2015). Project CRTI 09-462RD - Next generation sequencing, direct detection and genotyping of fungi, bacteria and nematodes in the agri-food system. DRDC-RDDC-2015-C148. Final Close-Out Report. (Rapport)

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Installation de recherche

430, boul. Gouin
Saint-Jean-sur-Richelieu, QC J3B 3E6
Canada

Affiliations

Professeur associé

Université de Montréal (depuis 2013)

Professeur associé

Université Laval (depuis 2016)

Language

Anglais
Français