Bahram Samanfar, Ph. D.
Dr Bahram Samanfar est chercheur scientifique au CRD d’Ottawa d’AAC et professeur auxiliaire au Département de biologie de l’Université Carleton. Ce généticien moléculaire et spécialiste de la génomique appliquée possède des connaissances sur la mise au point de marqueurs moléculaires propres à des allèles, les cartes de recombinaison, la sélection assistée par marqueurs, la génomique fonctionnelle, la biologie computationnelle et la bioinformatique, particulièrement en lien avec le soja.
Recherche et / ou projets en cours
Le soja est l’une des plantes cultivées les plus importantes dans le monde, entre autres sur le plan économique. Cette plante est une source d’huile et de protéines végétales pour les humains et les animaux. La culture du soja est en hausse au Canada depuis 2000. Fait intéressant à noter, sa production dans l’ouest du Canada a récemment gagné du terrain. Le Canada dispose de toutes les ressources nécessaires pour étendre la culture du soja, notamment vers le nord et vers l’ouest. Pour y parvenir, certaines difficultés doivent être surmontées, notamment en ce qui concerne le temps de floraison et de maturation, la teneur en protéines, les organismes nuisibles et les maladies. Dans mon laboratoire, nous essayons de résoudre ces difficultés grâce à la génomique, à la génomique fonctionnelle et à la bioinformatique.
Dr. Bahram Samanfar (Ph. D.) est chercheur scientifique au CRD d’Ottawa d’AAC et professeur auxiliaire au Département de biologie de l’Université Carleton. Ce généticien moléculaire et spécialiste de la génomique appliquée possède des connaissances sur la mise au point de marqueurs moléculaires propres à des allèles, les cartes de recombinaison, la sélection assistée par marqueurs, la génomique fonctionnelle, la biologie computationnelle et la bioinformatique, particulièrement en lien avec le soja.
Énoncés de recherches/projets
- Identification et caractérisation de nouveaux gènes de soja intervenant dans :
- la période de floraison et de maturation;
- la synthèse des protéines des graines;
- les voies de synthèse importantes sur le plan économique.
- Mise au point de marqueurs propres à des allèles (sélection assistée par marqueurs chez le soja).
- Analyse des interactions hôte-pathogène chez le soja (nématode à kyste du soja).
- Identification et caractérisation de nouveaux gènes intervenant dans l’établissement des attributs santé liés à la consommation de soja (santé humaine et allergies).
- Génomique et génomique fonctionnelle (biologie systémique) du soja, de la levure et d’E. coli.
- Bioinformatique et biologie computationnelle (génomique fonctionnelle du soja).
Activités professionnelles / intérêts
Génomique, protéomique et transcriptomique du soja, biologie cellulaire et moléculaire, biotechnologie, génétique et génomique végétales, marqueurs ADN, mise au point de marqueurs propres à des allèles, biologie systémique, sélection moléculaire, interactions hôte-pathogène, bioinformatique, biologie computationnelle, analyses QTL et GWAS, période de floraison et de maturation (génétique de la sensibilité à la photopériode) chez le soja, protéines des graines de soja, génomique fonctionnelle des attributs santé du soja, allergies, voie de synthèse des protéines des graines de soja, microbiologie, voie de synthèse (traduction) des protéines chez la levure et E. coli, interactions protéines-protéines (IPP) et interactions génétiques (IG).
Prix et études
Ph.D. (Université Carleton, Canada)
M.Sc. (Université Paul-Sabatier, France)
M.Sc. (Université de Téhéran, Iran)
B.Sc. (Université de Téhéran, Iran)
Liens additionnels
https://bahramsamanfar.wixsite.com/samanfarlab
https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=HfYsijsAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
Principales publications
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Bahram Samanfar, Nour Nissan, Benjamin Mimee, Elroy Cober, Ashkan Golshani: Development of a Proteome-Wide Data Mining Pipeline to Discover Novel Soybean Genes Associated with Soybean Cyst Nematode (SCN) Resistance. Plant and Animal Genome (PAG-31), 2024, Sandiego, USA [Oral].
2024 - Consulter les détails de la publication
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Bahram Samanfar, Julia Hooker, Elroy Cober, Ashkan Golshani: Differential gene expression offers insights into the environmentally regulated protein content of soybean seeds, with emphasis on Asparagine synthesis pathway. Plant and Animal Genome (PAG-31), 2024, Sandiego, USA [Oral].
2024 - Consulter les détails de la publication
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Bahram Samanfar, Julia Hooker, Elroy Cober: Differential gene expression of higher latitudes in soybean. World Soybean Research Conference 11 (WSRC11), 2023, Vienna, Austria [Oral].
2023 - Consulter les détails de la publication
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Bahram Samanfar, Nour Nissan, James Green, Benjamin Mimee, Elroy Cober: A method to obtaining novel sources of resistance in soybean against SCN. World Soybean Research Conference 11 (WSRC11), 2023, Vienna, Austria [Oral].
2023 - Consulter les détails de la publication
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Elizabeth Brauer, Doris Luckert, Stephanie Poncos, Hannah Morrison, Whynn Bosnich, Melodie Laniel, Martin Charette, Andrew Burt, James Tucker, Raja Khanal, Bahram Samanfar: Bacterial detection and induced immune responses in barley. Canadian Society of Plant Biologists(CSPB), 2023, Quebec City, Canada.
2023 - Consulter les détails de la publication
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Julia C. Hooker, Elroy R. Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: GmSWEET29 and Paralog GmSWEET34 Are Differentially Expressed between Soybeans Grown in Eastern and Western Canada. Carleton Life Science day 6, 2023 Canada.
2023 - Consulter les détails de la publication
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Siwar Haidar, Simon Lackey, Elroy Cober, Malcolm Morrison, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Genome-wide analysis of cold imbibition stress in soybean, Glycine max. Carleton Life Science day 6, 2023 Canada.
2023 - Consulter les détails de la publication
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Simon Lackey, Siwar Haidar, Elroy Cober, Malcolm Morrison, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Genome-wide analysis of cold imbibition stress in soybean, Glycine max. 20thAnnual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology, 2023 Canada.
2023 - Consulter les détails de la publication
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Julia C. Hooker, Elroy R. Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: GmSWEET29 and Paralog GmSWEET34 Are Differentially Expressed between Soybeans Grown in Eastern and Western Canada. 20thAnnual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology, 2023 Canada [Oral].
2023 - Consulter les détails de la publication
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Nour Nissan, Bahram Samanfar, Elroy Cober, Steve Molnar, James Green, Ashkan Golshani: Large-Scale Data Mining Pipeline for Identifying Novel Soybean Genes Involved in Resistance Against a Terrible Yield Robber, SCN. 20thAnnual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology, 2023 Canada [Oral].
2023 - Consulter les détails de la publication
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Siwar Haidar, Elroy Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Identification of the Underlying Candidate Gene for the E7 Maturity Locus in Soybean (Glycine max). 20thAnnual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology, 2023 Canada [Oral].
2023 - Consulter les détails de la publication
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Nour Nissan, Elroy R. Cober, James Green, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: A Bioinformatics In-Silico Approach to Obtaining a Short-List of Candidates for Novel Sources of Resistance Against a Terrible Yield Robber, SCN. Plant and Animal Genome (PAG30) 2023, San Diego, USA.
2023 - Consulter les détails de la publication
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Nour Nissan, Elroy Cober, Jim Green, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Bioinformatics and Molecular Biology Approach to Identifying Novel Sources of Resistance Against a Terrible Yield Robber, SCN. Soy2022
2022 - Consulter les détails de la publication
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Julia C. Hooker, Elroy R. Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: SWEET sugar transporters are differentially expressed between soybeans grown in Eastern and Western Canada. Soy2022 (Virtual), 2022 USA
2022 - Consulter les détails de la publication
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Simon Lackey, Elroy Cober, Andrew Bird, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Introgression of early maturity alleles from wild soybean (Glycine soja) to domesticated cultivars (Glycine max). 19th Annual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology, 2022 Canada
2022 - Consulter les détails de la publication
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Western Soybean Protein. Presentation at Northern Soybean Summit. Soy Canada. 25 January 2022.
2022 - Consulter les détails de la publication
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Simon Lackey, Elroy Cober, Andrew Bird, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Identification of novel maturity-related QTLs in a G.max/G.soja RIL population. Canadian Society of Plant Biologists(CSPB-SCBV), eastern meeting, 2021 Canada.
2021 - Consulter les détails de la publication
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Nour Nissan, Elroy Cober, Steve Molner, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Revealing the Truth Behind A Previously Presumed Locus, E6, in Soybean Variety Paranagoiana.Canadian Society of Plant Biologists(CSPB-SCBV) eastern meeting, 2021 Canada.
2021 - Consulter les détails de la publication
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Julia Hooker, Elroy Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Identifying differentially expressed genes involved in low seed protein in western Canadian soybeans. 18th Annual OCIB Symposium, Ottawa Carleton Institute of Biology , 2021 Canada.
2021 - Consulter les détails de la publication
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3- Nour Nissan, Elroy Cober, Ashkan Golshani, Bahram Samanfar: Proteome-wide computational approaches to identify novel genes involved in soybean resistance to SCN. 18th Annual OCIB, Ottawa Carleton Institute of Biology Symposium, 2021 Canada.
2021 - Consulter les détails de la publication
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Affiliations
- Professeur de recherche auxiliaire, Département de biologie, Université Carleton.