Diversité génétique et liens entre le matériel génétique du sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) selon les marqueurs du polymorphisme de longueur de fragments amplifiés

Citation

Bhattarai, S., Coulman, B., Fu, Y.B., Beattie, A.D., Biligetu, B. (2017). Genetic diversity and relationship of sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) germplasm as revealed by amplified fragment length polymorphism markers. Canadian Journal of Plant Science, [online] 98(3), 543-551. http://dx.doi.org/10.1139/cjps-2017-0094

Résumé en langage clair

Le sainfoin est une légumineuse fourragère vivace très répandue dans les régions tempérées de l’hémisphère nord, mais dont l’amélioration génétique a été relativement lente, en partie à cause du manque d’informations sur le génome, notamment au niveau moléculaire. Les auteurs ont tenté d’évaluer la diversité génétique de l’espèce et les liens entre 38 obtentions recueillies à divers endroits de la planète à l’aide d’un outil moléculaire. L’analyse a révélé une plus grande diversité génétique entre les plants de la même obtention, ainsi que des différenciations génétiques significatives entre les obtentions. Les informations sur la distance et la diversité génétiques des obtentions de sainfoin auront leur utilité quand viendra le temps de choisir des spécimens génétiquement différents en vue d’une amélioration génétique de l’espèce.

Résumé

© Sa Majesté la Reine du chef du Canada 2018. Le sainfoin (Onobrychis viciifolia Scop.) est une légumineuse fourragère vivace très répandue dans les régions tempérées de l’hémisphère nord, mais dont l’amélioration génétique a été relativement lente, en partie à cause du manque d’informations sur le génome, notamment au niveau moléculaire. Les auteurs ont tenté d’évaluer la diversité génétique de l’espèce et les liens entre 38 obtentions recueillies à divers endroits de la planète en recourant à des marqueurs AFLP (polymorphisme de longueur de fragments amplifiés). Ils ont utilisé cinq paires d’amorces AFLP pour évaluer 367 plants, qui ont donné 1042 bandes AFLP polymorphiques. La fréquence des bandes notées chez les plants à l’étude variait de 0,003 à 0,973, pour une moyenne de 0,165. L’analyse de la variance moléculaire révèle une plus forte variation génétique entre les plants de la même obtention (84,3 %) que d’obtentions différentes (15,7 %). La plupart des obtentions se caractérisent par une importante distance génétique, selon les grilles de distance entre obtentions, mais la distance n’est pas grande entre les obtentions ayant des parents similaires. Le dendrogramme des obtentions recueillies révèle l’existence de deux groupes dont le coefficient pour la distance génétique entre obtentions est de 0,36. Ces informations sur la distance et la diversité génétiques des obtentions de sainfoin auront leur utilité quand viendra le temps de choisir des spécimens génétiquement différents en vue d’une amélioration génétique de l’espèce.

Date de publication

2017-12-04

Profils d'auteurs